RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484684.1

SRPRB-204, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene SRPRB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-204ENST00000484684 NECAP1Q8NC96 275 aa11.66□□□□□ -0.54
SRPRB-204ENST00000484684 OR5B3Q8NH48 314 aa11.66□□□□□ -0.54
SRPRB-204ENST00000484684 SCGB3A2Q96PL1 93 aa11.66□□□□□ -0.54
SRPRB-204ENST00000484684 TSC22D3Q99576 134 aa11.66□□□□□ -0.54
SRPRB-204ENST00000484684 C20orf85Q9H1P6 137 aa11.66□□□□□ -0.54
SRPRB-204ENST00000484684 KLK9Q9UKQ9 250 aa11.66□□□□□ -0.54
SRPRB-204ENST00000484684 SELENOKQ9Y6D0 94 aa11.66□□□□□ -0.54
SRPRB-204ENST00000484684 TRAV6A0A075B6T7 132 aa11.65□□□□□ -0.54
SRPRB-204ENST00000484684 FAM223BA6NKX1 122 aa11.65□□□□□ -0.54
SRPRB-204ENST00000484684 B3GALNT1O75752 331 aa11.65□□□□□ -0.54
SRPRB-204ENST00000484684 UPK1BO75841 260 aa11.65□□□□□ -0.54
SRPRB-204ENST00000484684 SFT2D2O95562 160 aa11.65□□□□□ -0.54
SRPRB-204ENST00000484684 EDN2P20800 178 aa11.65□□□□□ -0.54
SRPRB-204ENST00000484684 TCTAP57738 103 aa11.65□□□□□ -0.54
SRPRB-204ENST00000484684 FAM223AQ8IWN6 122 aa11.65□□□□□ -0.54
SRPRB-204ENST00000484684 C2CD4CQ8TF44 421 aa11.65□□□□□ -0.54
SRPRB-204ENST00000484684 RRNAD1Q96FB5 475 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
SRPRB-204ENST00000484684 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
SRPRB-204ENST00000484684 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
SRPRB-204ENST00000484684 C9orf170A2RU37 121 aa11.64□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 C2orf70A6NJV1 201 aa11.64□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 MPTX1A8MV57 137 aa11.64□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 IGHV3-48P01763 117 aa11.64□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 DEFA4P12838 97 aa11.64□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 ATP5G2Q06055 141 aa11.64□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 DHRS2Q13268 280 aa11.64□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 AARDQ4LEZ3 155 aa11.64□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 OR2C3Q8N628 320 aa11.64□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 ZNF414Q96IQ9 312 aa11.64□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 MFFQ9GZY8 342 aa11.64□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 HSPG2P98160 4391 aa11.64□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 A0A0B4J2A0 478 aa11.63□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 F8W735 103 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 K7EIM0 57 aa11.63□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 UBE2CO00762 179 aa11.63□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 ADAP1O75689 374 aa11.63□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 IFNA17P01571 189 aa11.63□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 OR4E1P0C645 316 aa11.63□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 ASAH1Q13510 395 aa11.63□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 CLEC19AQ6UXS0 136 aa11.63□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 TMEM61Q8N0U2 210 aa11.63□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 TMEM170AQ8WVE7 144 aa11.63□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 IL22RA2Q969J5 263 aa11.63□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 NUDT15Q9NV35 164 aa11.63□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 FKBP11Q9NYL4 201 aa11.63□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 SHPKQ9UHJ6 478 aa11.63□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa11.63□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 CENPXA8MT69 81 aa11.62□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 TCRBP04435 133 aa11.62□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 HOXB5P09067 269 aa11.62□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 TM4SF20Q53R12 229 aa11.62□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 SLC25A24Q6NUK1 477 aa11.62□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 LGI3Q8N145 548 aa11.62□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 STPG3Q8N7X2 389 aa11.62□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 C11orf45Q8TAV5 145 aa11.62□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 ZNF502Q8TBZ5 544 aa11.62□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 SEC22CQ9BRL7 303 aa11.62□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 PKD1P98161 4303 aa11.61□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 ATG12O94817 140 aa11.61□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 SULT1A3P0DMM9 295 aa11.61□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 SULT1A4P0DMN0 295 aa11.61□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 ANXA3P12429 323 aa11.61□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 GPR183P32249 361 aa11.61□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 LRTM2Q8N967 370 aa11.61□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 ZNF114Q8NC26 417 aa11.61□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 CACNG8Q8WXS5 425 aa11.61□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa11.6□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 IGLL5B9A064 214 aa11.6□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 SMCO1Q147U7 214 aa11.6□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 C4orf46Q504U0 113 aa11.6□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 GGNBP1Q5YKI7 109 aa11.6□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 HSD17B13Q7Z5P4 300 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 NRARPQ7Z6K4 114 aa11.6□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 ZNF575Q86XF7 245 aa11.6□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 OR1P1Q8NH06 330 aa11.6□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 SCARB1Q8WTV0 552 aa11.6□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 MISP3Q96FF7 219 aa11.6□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 I3L2K1 104 aa11.59□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 PITX3O75364 302 aa11.59□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 OR2C1O95371 312 aa11.59□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 DHFRP00374 187 aa11.59□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 CBLN1P23435 193 aa11.59□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 SRPXP78539 464 aa11.59□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 BSXQ3C1V8 233 aa11.59□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa11.59□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 CHRDL1Q9BU40 450 aa11.59□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 RBKSQ9H477 322 aa11.59□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 APLNQ9ULZ1 77 aa11.59□□□□□ -0.55
SRPRB-204ENST00000484684 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms