RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484547.7

RABGEF1-207, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RABGEF1, Length 1,596 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-207ENST00000484547 HIST1H2BHQ93079 126 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-207ENST00000484547 RAB40CQ96S21 281 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-207ENST00000484547 HIST1H2BNQ99877 126 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-207ENST00000484547 HIST1H2BMQ99879 126 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-207ENST00000484547 PYGO2Q9BRQ0 406 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-207ENST00000484547 SH3BGRL3Q9H299 93 aa9.17□□□□□ -0.94
RABGEF1-207ENST00000484547 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa9.17□□□□□ -0.94
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RABGEF1-207ENST00000484547 RASL11BQ9BPW5 248 aa9.13□□□□□ -0.95
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RABGEF1-207ENST00000484547 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-207ENST00000484547 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-207ENST00000484547 ZMAT4Q9H898 229 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGEF1-207ENST00000484547 YIF1AO95070 293 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-207ENST00000484547 GCGP01275 180 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGEF1-207ENST00000484547 PSMB8P28062 276 aa9.12□□□□□ -0.95
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