RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482563.1

RBM39-233, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 1,737 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-233	ENST00000482563		M0R2Z0	102 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	DPM2	O94777	84 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	IFNG	P01579	166 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	IGHV1-69	P01742	117 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	ZNF25	P17030	456 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	MGLL	Q99685	303 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	NUP210L	Q5VU65	1888 aa		4.59	□□□□□ -1.67
RBM39-233	ENST00000482563	PLXNB1	O43157	2135 aa		4.59	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		4.59	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	C9orf170	A2RU37	121 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	C17orf51	A8MQB3	221 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	C1QA	P02745	245 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	UCHL1	P09936	223 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	MPV17	P39210	176 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	EMX2	Q04743	252 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563		Q6ZR54	194 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	OR8D4	Q8NGM9	314 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	LINC00470	Q9BZP3	86 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	TMEM212	A6NML5	194 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	SOD1	P00441	154 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	TMEM244	Q5VVB8	128 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	TMEM14EP	Q6UXP3	125 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	MUC7	Q8TAX7	377 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	SLC39A9	Q9NUM3	307 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	NAT8	Q9UHE5	227 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	TNS3	Q68CZ2	1445 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563		H3BQ85	93 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	NAPSA	O96009	420 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	FOXA1	P55317	472 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	WNT4	P56705	351 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	NCS1	P62166	190 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	RPS25	P62851	125 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	RHOG	P84095	191 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	ZNF141	Q15928	474 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	SPANXN3	Q5MJ09	141 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	PPTC7	Q8NI37	304 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	UBALD1	Q8TB05	177 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	TMEM203	Q969S6	136 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	MYH11	P35749	1972 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	C17orf98	A8MV24	154 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	C16orf90	A8MZG2	172 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	WISP3	O95389	354 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	IGHV3-7	P01780	117 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	RAB5C	P51148	216 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	LXN	Q9BS40	222 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	HS3ST2	Q9Y278	367 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	ZNF443	Q9Y2A4	671 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	LINC00694	P0DN24	101 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	AMMECR1L	Q6DCA0	310 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	HAGHL	Q6PII5	290 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	C2orf91	Q6ZV80	131 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	OR51A4	Q8NGJ6	313 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	ARL11	Q969Q4	196 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	DOCK9	Q9BZ29	2069 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	SDC2	P34741	201 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	SRP14	P37108	136 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	TMBIM6	P55061	237 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	FXYD7	P58549	80 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	MAX	P61244	160 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	UBE2B	P63146	152 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	SELENOW	P63302	87 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	BCL2L15	Q5TBC7	163 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	C4orf22	Q6V702	233 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	OR4E2	Q8NGC2	313 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	C14orf144	Q96I85	54 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	COA4	Q9NYJ1	87 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	BAIAP2	Q9UQB8	552 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	PHLPP1	O60346	1717 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	IRGM	A1A4Y4	181 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	DYNLT3	P51808	116 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	ARPP19	P56211	112 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	BIK	Q13323	160 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	TEX29	Q8N6K0	151 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	ST20-AS1	Q8NBB2	130 aa		4.54	□□□□□ -1.68
RBM39-233	ENST00000482563	C1orf64	Q8NEQ6	169 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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