RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880		A0A0B4J2A0	478 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	IFNA10	P01566	189 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	TFPI2	P48307	235 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	SUPT4H1	P63272	117 aa	Known RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	SMCO1	Q147U7	214 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	BAK1	Q16611	211 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	MLANA	Q16655	118 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM128	Q5BJH2	165 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	SLC24A4	Q8NFF2	622 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	OR52E5	Q8NH55	327 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	SLC25A21	Q9BQT8	299 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	GINS3	Q9BRX5	216 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		11.13	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	C15orf62	A8K5M9	175 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	CENPX	A8MT69	81 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	C8orf88	P0DMB2	117 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	HAGH	Q16775	308 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM116	Q8NCL8	245 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	SPATA25	Q9BR10	227 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	UBQLN2	Q9UHD9	624 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	TRAV14DV4	A0A0A6YYC5	116 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	TRAV25	A0A0B4J276	109 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	PIGBOS1	A0A0B4J2F0	54 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880		A8MZ25	164 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880		K7EMT4	169 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	NPY1R	P25929	384 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	RPL11	P62913	178 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	TNFRSF9	Q07011	255 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	PPP1R1A	Q13522	171 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	DTD1	Q8TEA8	209 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	RBKS	Q9H477	322 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	CACFD1	Q9UGQ2	172 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	SMPX	Q9UHP9	88 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	11.11	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	NAP1L6	A6NFF2	107 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM50A	O95807	157 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	IFNA4	P05014	189 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	HOXB5	P09067	269 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	BMI1	P35226	326 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	RND2	P52198	227 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	NMS	Q5H8A3	153 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	NOXA1	Q86UR1	476 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	ACY3	Q96HD9	319 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	SPAG8	Q99932	426 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	RETN	Q9HD89	108 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880		A0A1B0GU03	582 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	OR4C46	A6NHA9	309 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	CLN5	O75503	358 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	SFT2D2	O95562	160 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	IAPP	P10997	89 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	TIGIT	Q495A1	244 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	AARD	Q4LEZ3	155 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	C2orf83	Q53S99	150 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	RNF2	Q99496	336 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SSR4-208	ENST00000471880	DUXB	A0A1W2PPF3	345 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	CHEK1	O14757	476 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	TSPAN4	O14817	238 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	IL7	P13232	177 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	BSX	Q3C1V8	233 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	TCF24	Q7RTU0	167 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	OR4X1	Q8NH49	305 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	NARS2	Q96I59	477 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	FLVCR2	Q9UPI3	526 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	NDUFB6	O95139	128 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	SLC25A4	P12235	298 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	NPPC	P23582	126 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	C4orf46	Q504U0	113 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	ST8SIA2	Q92186	375 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	OR10C1	Q96KK4	312 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	METTL26	Q96S19	204 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880		U3KQ87	197 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64
SSR4-208	ENST00000471880	DNASE2	O00115	360 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64

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