RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468347.1

SHQ1-204, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 134 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-204ENST00000468347 GCNT4Q9P109 453 aa-1.3□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 PSME2Q9UL46 239 aa-1.3□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 KIF3AQ9Y496 699 aa-1.3□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP-1.3□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP-1.3□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 ITPR1Q14643 2758 aa-1.3□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 NPATQ14207 1427 aa-1.31□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 C10orf71Q711Q0 1435 aa-1.31□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP-1.31□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP-1.31□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 TRAV10A0A0B4J240 114 aa-1.31□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa-1.31□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP-1.31□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP-1.31□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 ARL6IP5O75915 188 aa-1.31□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 CD79AP11912 226 aa-1.31□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 COX7CP15954 63 aa-1.31□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 PPIBP23284 216 aaKnown RBP-1.31□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 CASP1P29466 404 aa-1.31□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 KCNJ3P48549 501 aa-1.31□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP-1.31□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 XIAPP98170 497 aa-1.31□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 RAD51Q06609 339 aa-1.31□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP-1.31□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 TRAM1Q15629 374 aa-1.31□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 ESRGQ1W209 222 aa-1.31□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 DEFB112Q30KQ8 113 aa-1.31□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 ACTL10Q5JWF8 245 aa-1.31□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 RESP18Q5W5W9 173 aa-1.31□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 XAF1Q6GPH4 301 aa-1.31□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP-1.31□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 LRRC45Q96CN5 670 aa-1.31□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 C9orf72Q96LT7 481 aa-1.31□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 GSDMAQ96QA5 445 aa-1.31□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 LYSMD1Q96S90 227 aa-1.31□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP-1.31□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa-1.31□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 SDHAF2Q9NX18 166 aa-1.31□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa-1.31□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 ANAPC10Q9UM13 185 aa-1.31□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa-1.31□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 SNX10Q9Y5X0 201 aa-1.31□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 KPTNQ9Y664 436 aa-1.31□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 HELZP42694 1942 aaKnown RBP-1.31□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 DNAJC13O75165 2243 aa-1.31□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 LRRK2Q5S007 2527 aa-1.31□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 CASZ1Q86V15 1759 aa-1.31□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa-1.32□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 RIC1Q4ADV7 1423 aa-1.32□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 ANK1P16157 1881 aa-1.32□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa-1.32□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 C9orf170A2RU37 121 aa-1.32□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 FABP5P3A8MUU1 101 aa-1.32□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 EFCAB9A8MZ26 197 aa-1.32□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa-1.32□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 GOLGA8RI6L899 631 aa-1.32□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 SULT1C2O00338 296 aa-1.32□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 CDIPTO14735 213 aa-1.32□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 SC5DO75845 299 aa-1.32□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 PROSCO94903 275 aa-1.32□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 VAPBO95292 243 aa-1.32□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 HBZP02008 142 aa-1.32□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 MBP02144 154 aa-1.32□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 C1QBP02746 253 aa-1.32□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 AKR1C4P17516 323 aa-1.32□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 CCL1P22362 96 aa-1.32□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 EVI2AP22794 236 aa-1.32□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 RCVRNP35243 200 aa-1.32□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 ATP5J2P56134 94 aa-1.32□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP-1.32□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 HPCAP84074 193 aa-1.32□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 DNAJC3Q13217 504 aa-1.32□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 GPM6BQ13491 265 aa-1.32□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 SYCP1Q15431 976 aa-1.32□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP-1.32□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 GRK1Q15835 563 aa-1.32□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP-1.32□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 C1orf194Q5T5A4 169 aa-1.32□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 C1orf134Q5TEV5 83 aa-1.32□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 AADACL3Q5VUY0 350 aa-1.32□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa-1.32□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 RUFY3Q7L099 469 aa-1.32□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 DEFB128Q7Z7B8 93 aa-1.32□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 SCD5Q86SK9 330 aa-1.32□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa-1.32□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 OR4K17Q8NGC6 315 aa-1.32□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 OR13D1Q8NGV5 346 aa-1.32□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 OR2T35Q8NGX2 323 aa-1.32□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 OR5K1Q8NHB7 308 aa-1.32□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 FAM81AQ8TBF8 368 aa-1.32□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 TMEM254Q8TBM7 123 aa-1.32□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 CANT1Q8WVQ1 401 aa-1.32□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 C4orf3Q8WVX3 66 aa-1.32□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 CDKL2Q92772 493 aa-1.32□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 GPR146Q96CH1 333 aa-1.32□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 ZNF714Q96N38 554 aa-1.32□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 CCL13Q99616 98 aa-1.32□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 DERL1Q9BUN8 251 aa-1.32□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 FXYD6Q9H0Q3 95 aa-1.32□□□□□ -2.62
SHQ1-204ENST00000468347 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP-1.32□□□□□ -2.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.2 ms