RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468164.1

C9orf3-212, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 5

Gene C9orf3, Length 849 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-212ENST00000468164 GINS3Q9BRX5 216 aa9.96□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
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C9orf3-212ENST00000468164 OPRK1P41145 380 aa9.95□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 TCF24Q7RTU0 167 aa9.95□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 LYG2Q86SG7 212 aa9.95□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 ST8SIA2Q92186 375 aa9.95□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 GALNT14Q96FL9 552 aa9.95□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 ZNF414Q96IQ9 312 aa9.95□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 OR10C1Q96KK4 312 aa9.95□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 PRRT1Q99946 306 aa9.95□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 SOSTQ9BQB4 213 aa9.95□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP9.95□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 A0A0G2JRQ6 117 aa9.94□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 NXPH3O95157 252 aa9.94□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 APOHP02749 345 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 P0C879 139 aa9.94□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 UCP1P25874 307 aa9.94□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 BMI1P35226 326 aa9.94□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 FAUP35544 74 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 AP3S2P59780 193 aa9.94□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 PAFAH1B2P68402 229 aa9.94□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 ZNF600Q6ZNG1 722 aa9.94□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 Q6ZWC4 215 aa9.94□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 MCUBQ9NWR8 336 aa9.94□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa9.94□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa9.93□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 CORTO00230 105 aa9.93□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 UBE2CO00762 179 aa9.93□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 INPP1P49441 399 aa9.93□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP9.93□□□□□ -0.82
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C9orf3-212ENST00000468164 Q6ZRM9 215 aa9.93□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 OR4C16Q8NGL9 310 aa9.93□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 TMEM230Q96A57 120 aa9.93□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 SCGB3A2Q96PL1 93 aa9.93□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 TMEM222Q9H0R3 208 aa9.93□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 NAA60Q9H7X0 242 aa9.93□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa9.92□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa9.92□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 A0A1B0GU03 582 aa9.92□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 DFFBO76075 338 aa9.92□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 TMEM50AO95807 157 aa9.92□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 TMEM268Q5VZI3 342 aa9.92□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 LEMD1Q68G75 181 aa9.92□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 CCDC190Q86UF4 302 aa9.92□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 KIR2DL5AQ8N109 375 aa9.92□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 LILRB2Q8N423 598 aa9.92□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 TOMM5Q8N4H5 51 aa9.92□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 OR51S1Q8NGJ8 323 aa9.92□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa9.92□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 LHFPL5Q8TAF8 219 aa9.92□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 RNF183Q96D59 192 aa9.92□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 ZFAND3Q9H8U3 227 aa9.92□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 MAP6D1Q9H9H5 199 aa9.92□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 RABAC1Q9UI14 185 aa9.92□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa9.92□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 V9GYH0 126 aa9.92□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 CEBPZOSA8MTT3 80 aa9.91□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 MPTX1A8MV57 137 aa9.91□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 CDS2O95674 445 aa9.91□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 FAM90A2PQ658T7 463 aa9.91□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 GLYATL2Q8WU03 294 aa9.91□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 CSTL1Q9H114 145 aa9.91□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 MS4A6AQ9H2W1 248 aa9.91□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 PRR13Q9NZ81 148 aa9.91□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 CACNG5Q9UF02 275 aa9.91□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 INS-IGF2F8WCM5 200 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 CLN5O75503 358 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 SCGB2A1O75556 95 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 B3GALNT1O75752 331 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 LY6G6CO95867 125 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 NPPCP23582 126 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 DEFB131AP59861 70 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 SPCS3P61009 180 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 DHODHQ02127 395 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 TNFRSF9Q07011 255 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 TIGITQ495A1 244 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 FAM219AQ8IW50 185 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 STXBP6Q8NFX7 210 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 GPR146Q96CH1 333 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 METTL26Q96S19 204 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 TMEM231Q9H6L2 316 aa9.9□□□□□ -0.82
C9orf3-212ENST00000468164 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa9.89□□□□□ -0.83
C9orf3-212ENST00000468164 CA1P00915 261 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
C9orf3-212ENST00000468164 HTR2BP41595 481 aa9.89□□□□□ -0.83
C9orf3-212ENST00000468164 ZNF79Q15937 498 aa9.89□□□□□ -0.83
C9orf3-212ENST00000468164 TRIQKQ629K1 86 aa9.89□□□□□ -0.83
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