RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		13.48	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		13.47	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		13.47	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	SLC25A6	P12236	298 aa		13.47	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	ADM	P35318	185 aa		13.47	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	ASAH1	Q13510	395 aa		13.47	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	MLANA	Q16655	118 aa		13.47	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	BSX	Q3C1V8	233 aa		13.47	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	C2orf83	Q53S99	150 aa		13.47	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	LCN12	Q6JVE5	192 aa		13.47	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		13.47	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	NOXA1	Q86UR1	476 aa		13.47	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	13.47	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		13.46	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	TMEM213	A2RRL7	107 aa		13.46	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902		A8MWP6	167 aa		13.46	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	NDUFA4	O00483	81 aa		13.46	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	PITX3	O75364	302 aa		13.46	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	MED6	O75586	246 aa		13.46	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	IAPP	P10997	89 aa		13.46	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	FCGR2B	P31994	310 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	PVRIG	Q6DKI7	326 aa		13.46	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	UXS1	Q8NBZ7	420 aa		13.46	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	ENKUR	Q8TC29	256 aa		13.46	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		13.46	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	FNDC4	Q9H6D8	234 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	PAIP2B	Q9ULR5	123 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902		U3KQ87	197 aa		13.46	□□□□□ -0.25
USP19-210	ENST00000465902	IZUMO1R	A6ND01	250 aa		13.45	□□□□□ -0.26
USP19-210	ENST00000465902	FAM90A26	D6RGX4	464 aa		13.45	□□□□□ -0.26
USP19-210	ENST00000465902	ZNF207	O43670	478 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
USP19-210	ENST00000465902	IFNA4	P05014	189 aa		13.45	□□□□□ -0.26
USP19-210	ENST00000465902	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
USP19-210	ENST00000465902	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
USP19-210	ENST00000465902	TMEM190	Q8WZ59	177 aa		13.45	□□□□□ -0.26
USP19-210	ENST00000465902	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
USP19-210	ENST00000465902	MPTX1	A8MV57	137 aa		13.44	□□□□□ -0.26
USP19-210	ENST00000465902	SCGB2A1	O75556	95 aa		13.44	□□□□□ -0.26
USP19-210	ENST00000465902	TMEM50A	O95807	157 aa		13.44	□□□□□ -0.26
USP19-210	ENST00000465902	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
USP19-210	ENST00000465902	GUCA2B	Q16661	112 aa		13.44	□□□□□ -0.26
USP19-210	ENST00000465902	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		13.44	□□□□□ -0.26
USP19-210	ENST00000465902	OR2K2	Q8NGT1	345 aa		13.44	□□□□□ -0.26
USP19-210	ENST00000465902	MITD1	Q8WV92	249 aa		13.44	□□□□□ -0.26
USP19-210	ENST00000465902	MARC2	Q969Z3	335 aa		13.44	□□□□□ -0.26
USP19-210	ENST00000465902	SEC22C	Q9BRL7	303 aa		13.44	□□□□□ -0.26
USP19-210	ENST00000465902	DAZ1	Q9NQZ3	744 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
USP19-210	ENST00000465902	WRB	O00258	174 aa		13.43	□□□□□ -0.26
USP19-210	ENST00000465902	SYNGR2	O43760	224 aa		13.43	□□□□□ -0.26
USP19-210	ENST00000465902	IFITM3	Q01628	133 aa		13.43	□□□□□ -0.26
USP19-210	ENST00000465902	ETFRF1	Q6IPR1	90 aa		13.43	□□□□□ -0.26
USP19-210	ENST00000465902	BTNL8	Q6UX41	500 aa		13.43	□□□□□ -0.26
USP19-210	ENST00000465902	OR4X1	Q8NH49	305 aa		13.43	□□□□□ -0.26
USP19-210	ENST00000465902	TMEM170A	Q8WVE7	144 aa		13.43	□□□□□ -0.26
USP19-210	ENST00000465902	MRPL36	Q9P0J6	103 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
USP19-210	ENST00000465902	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
USP19-210	ENST00000465902	MLX	Q9UH92	298 aa		13.43	□□□□□ -0.26
USP19-210	ENST00000465902	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
USP19-210	ENST00000465902	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		13.43	□□□□□ -0.26
USP19-210	ENST00000465902	CLN5	O75503	358 aa		13.42	□□□□□ -0.26
USP19-210	ENST00000465902	SCGB1D2	O95969	90 aa		13.42	□□□□□ -0.26
USP19-210	ENST00000465902	SLC25A4	P12235	298 aa		13.42	□□□□□ -0.26
USP19-210	ENST00000465902	RND2	P52198	227 aa		13.42	□□□□□ -0.26
USP19-210	ENST00000465902	DEFA1	P59665	94 aa		13.42	□□□□□ -0.26
USP19-210	ENST00000465902	DEFA3	P59666	94 aa		13.42	□□□□□ -0.26
USP19-210	ENST00000465902	CD69	Q07108	199 aa		13.42	□□□□□ -0.26
USP19-210	ENST00000465902	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
USP19-210	ENST00000465902	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		13.42	□□□□□ -0.26
USP19-210	ENST00000465902	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
USP19-210	ENST00000465902	ACY3	Q96HD9	319 aa		13.42	□□□□□ -0.26
USP19-210	ENST00000465902	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
USP19-210	ENST00000465902	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		13.42	□□□□□ -0.26
USP19-210	ENST00000465902	C15orf62	A8K5M9	175 aa		13.41	□□□□□ -0.26
USP19-210	ENST00000465902	FAM25E	A8MYX2	175 aa		13.41	□□□□□ -0.26
USP19-210	ENST00000465902	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
USP19-210	ENST00000465902	ATP5I	P56385	69 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
USP19-210	ENST00000465902	RAB11A	P62491	216 aa		13.41	□□□□□ -0.26
USP19-210	ENST00000465902	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
USP19-210	ENST00000465902	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		13.41	□□□□□ -0.26
USP19-210	ENST00000465902	RBPMS2	Q6ZRY4	209 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
USP19-210	ENST00000465902	WDR89	Q96FK6	387 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
USP19-210	ENST00000465902	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		13.4	□□□□□ -0.26
USP19-210	ENST00000465902	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		13.4	□□□□□ -0.26
USP19-210	ENST00000465902		K7EMT4	169 aa		13.4	□□□□□ -0.26
USP19-210	ENST00000465902	CCS	O14618	274 aa		13.4	□□□□□ -0.26
USP19-210	ENST00000465902	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
USP19-210	ENST00000465902	C8orf88	P0DMB2	117 aa		13.4	□□□□□ -0.26
USP19-210	ENST00000465902	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	13.4	□□□□□ -0.26
USP19-210	ENST00000465902	TIGIT	Q495A1	244 aa		13.4	□□□□□ -0.26
USP19-210	ENST00000465902	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		13.4	□□□□□ -0.26
USP19-210	ENST00000465902	TOMM20L	Q6UXN7	152 aa		13.4	□□□□□ -0.26
USP19-210	ENST00000465902	SLC16A13	Q7RTY0	426 aa		13.4	□□□□□ -0.26
USP19-210	ENST00000465902	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		13.4	□□□□□ -0.26
USP19-210	ENST00000465902	C12orf45	Q8N5I9	185 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
USP19-210	ENST00000465902	OR10C1	Q96KK4	312 aa		13.4	□□□□□ -0.26
USP19-210	ENST00000465902	GINS3	Q9BRX5	216 aa		13.4	□□□□□ -0.26
USP19-210	ENST00000465902	PUS1	Q9Y606	427 aa	Known RBP eCLIP	13.4	□□□□□ -0.26
USP19-210	ENST00000465902	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		13.4	□□□□□ -0.26

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms