RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461653.5

RABGGTB-204, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 1,702 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-204ENST00000461653 SDK1Q7Z5N4 2213 aa3.21□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 LAMA4Q16363 1823 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 A0A1B0GV90 55 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 SOCS1O15524 211 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 OR2J2O76002 312 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 IGLV3-25P01717 112 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 CSN2P05814 226 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 IGHV4-34P06331 123 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 C8GP07360 202 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 TLX1NBP0CAT3 122 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 PDGFRLQ15198 375 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 NDUFA5Q16718 116 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 TCF24Q7RTU0 167 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 LINC01551Q86U37 167 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 SGPP2Q8IWX5 399 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 MKXQ8IYA7 352 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 SLC25A40Q8TBP6 338 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 MAL2Q969L2 176 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 GPR146Q96CH1 333 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 CCDC115Q96NT0 180 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 NMNAT3Q96T66 252 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 SERPINI1Q99574 410 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 CCL13Q99616 98 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 CCDC32Q9BV29 185 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 COMMD5Q9GZQ3 224 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 KCNIP2Q9NS61 270 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 TMEM38BQ9NVV0 291 aa3.2□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 A0A1B0GVX0 72 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 ARL5CA6NH57 179 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 SIGLEC16A6NMB1 481 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 POP7O75817 140 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 SCO1O75880 301 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 PDYNP01213 254 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 APCSP02743 223 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 BPGMP07738 259 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 NUDT1P36639 197 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 GNA12Q03113 381 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 LUZP6Q538Z0 58 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 TYMSOSQ8TAI1 123 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 LMX1AQ8TE12 382 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 GPR82Q96P67 336 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 OR2A5Q96R48 311 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 DOCK8Q8NF50 2099 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 POLQO75417 2590 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 DNHD1Q96M86 4753 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 RELNP78509 3460 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 GREB1Q4ZG55 1949 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 DOCK5Q9H7D0 1870 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF98A6NK75 572 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 A8MUN3 132 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 C11orf94C9JXX5 98 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 LST1O00453 97 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 COX7A2LO14548 114 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 CCL16O15467 120 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 CST8O60676 142 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 BANF1O75531 89 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF688P0C7X2 276 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 IGHV1-8P0DP01 117 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 ATP5G3P48201 142 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 GRK1Q15835 563 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 LTC4SQ16873 150 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF675Q8TD23 568 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 RAB2BQ8WUD1 216 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 ELSPBP1Q96BH3 223 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 MS4A6EQ96DS6 147 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 CAPZA3Q96KX2 299 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF382Q96SR6 550 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 VPS25Q9BRG1 176 aa3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP3.19□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 A0A0J9YY10 115 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 A0A1B0GX78 115 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 DEGS1O15121 323 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 LY6G6DO95868 133 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 IGLV3-27P01718 113 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 CD28P10747 220 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 COX4I1P13073 169 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 CNTFRP26992 372 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 LHX2P50458 406 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF616Q08AN1 781 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 CST6Q15828 149 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 PLPPR5Q32ZL2 321 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 ZNF664Q8N3J9 261 aa3.18□□□□□ -1.9
RABGGTB-204ENST00000461653 PACRGLQ8N7B6 248 aa3.18□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms