RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 PITX3O75364 302 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 B3GALNT1O75752 331 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 SFT2D2O95562 160 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM50AO95807 157 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 H2AFB1P0C5Y9 115 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 H2AFB2P0C5Z0 115 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 IL7P13232 177 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 MFAP4P55083 255 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 SPCS3P61009 180 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 CNPY1Q3B7I2 92 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM106AQ4KMX7 169 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 SPANXN2Q5MJ10 180 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM219AQ8IW50 185 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM61Q8N0U2 210 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 DEFB125Q8N687 156 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 OR52E5Q8NH55 327 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 DYNLRB2Q8TF09 96 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM190Q8WZ59 177 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 IL22RA2Q969J5 263 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 RBKSQ9H477 322 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 NDUFA13Q9P0J0 144 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 LYSTQ99698 3801 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A0B4J2A0 478 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A1B0GU03 582 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 A8MZ25 164 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 NDUFA4O00483 81 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 SULT1A3P0DMM9 295 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 SULT1A4P0DMN0 295 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 FAUP35544 74 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 AP3S2P59780 193 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 TNFRSF9Q07011 255 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 C2orf83Q53S99 150 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM128Q5BJH2 165 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 SPSB3Q6PJ21 355 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 TOMM20LQ6UXN7 152 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 LGI3Q8N145 548 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 OR52B4Q8NGK2 314 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 OR1L6Q8NGR2 347 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 OR2K2Q8NGT1 345 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 SCGB3A2Q96PL1 93 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 NEURL2Q9BR09 285 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 SHPKQ9UHJ6 478 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 C9orf170A2RU37 121 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 CEBPZOSA8MTT3 80 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 K7EMT4 169 aa5.23□□□□□ -1.57
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RABGEF1-206ENST00000461017 ATG12O94817 140 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 NDUFB6O95139 128 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 IGKV1-17P01599 117 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 HOXB5P09067 269 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 SNCAP37840 140 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 ELLP55199 621 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 CD81P60033 236 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 IFITM3Q01628 133 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 SMCO1Q147U7 214 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF124Q15973 351 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 GUCA2BQ16661 112 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 HAGHQ16775 308 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 TIGITQ495A1 244 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 GGNBP1Q5YKI7 109 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM90A2PQ658T7 463 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 LCN12Q6JVE5 192 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 CENPSQ8N2Z9 138 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 LRTM2Q8N967 370 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 OR10C1Q96KK4 312 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 ATP6V0BQ99437 205 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 RNF2Q99496 336 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 TXN2Q99757 166 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 PDCD10Q9BUL8 212 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 C20orf24Q9BUV8 137 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 RETNQ9HD89 108 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 HSPB7Q9UBY9 170 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 UBQLN2Q9UHD9 624 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 SMPXQ9UHP9 88 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 STARD9Q9P2P6 4700 aa5.23□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 NAP1L6A6NFF2 107 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 C15orf62A8K5M9 175 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 OR11H12B2RN74 326 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1-206ENST00000461017 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
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