RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460759.1

NISCH-203, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 565 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-203ENST00000460759 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP10.17□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa10.16□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 RAB19A4D1S5 217 aa10.16□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 AGPAT2O15120 278 aa10.16□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 ATP6V0E1O15342 81 aa10.16□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 MT-CO2P00403 227 aa10.16□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 IGHG2P01859 326 aa10.16□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 AMY1AP04745 511 aa10.16□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 IGF1P05019 195 aa10.16□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 FABP1P07148 127 aa10.16□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 APELAP0DMC3 54 aa10.16□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 MFAP2P55001 183 aa10.16□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 LY6EQ16553 131 aa10.16□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 ASPHD1Q5U4P2 390 aa10.16□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa10.16□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 ACY3Q96HD9 319 aa10.16□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 TMUB1Q9BVT8 246 aa10.16□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 C19orf24Q9BVV8 132 aa10.16□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa10.16□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 PXMP4Q9Y6I8 212 aa10.16□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa10.15□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa10.15□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 H3BUA1 57 aa10.15□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 I3L2K1 104 aa10.15□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 BRI3O95415 125 aa10.15□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 IGHV4-59P01825 116 aa10.15□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 H2AFB1P0C5Y9 115 aa10.15□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 S100A1P23297 94 aa10.15□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 SRP14P37108 136 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 RND2P52198 227 aa10.15□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 ELLP55199 621 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 B2MP61769 119 aa10.15□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 PRR20EP86478 221 aa10.15□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 PRR20CP86479 221 aa10.15□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 PRR20DP86480 221 aa10.15□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 PRR20BP86481 221 aa10.15□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 PRR20AP86496 221 aa10.15□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 KRTAP1-1Q07627 177 aa10.15□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 UQCC3Q6UW78 93 aa10.15□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 SLC35E3Q7Z769 313 aa10.15□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa10.15□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 OR4X1Q8NH49 305 aa10.15□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 MARC2Q969Z3 335 aa10.15□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 TRGV9Q99603 122 aa10.15□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 RPRMQ9NS64 109 aa10.15□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 SLC45A2Q9UMX9 530 aa10.15□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
NISCH-203ENST00000460759 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa10.14□□□□□ -0.79
NISCH-203ENST00000460759 TRAV41A0A0B4J266 112 aa10.14□□□□□ -0.79
NISCH-203ENST00000460759 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa10.14□□□□□ -0.79
NISCH-203ENST00000460759 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa10.14□□□□□ -0.79
NISCH-203ENST00000460759 ZFP92A6NM28 416 aa10.14□□□□□ -0.79
NISCH-203ENST00000460759 AP4M1O00189 453 aa10.14□□□□□ -0.79
NISCH-203ENST00000460759 NPBWR1P48145 328 aa10.14□□□□□ -0.79
NISCH-203ENST00000460759 ECSCRQ19T08 205 aa10.14□□□□□ -0.79
NISCH-203ENST00000460759 ACSM6Q6P461 480 aa10.14□□□□□ -0.79
NISCH-203ENST00000460759 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa10.14□□□□□ -0.79
NISCH-203ENST00000460759 STPG3Q8N7X2 389 aa10.14□□□□□ -0.79
NISCH-203ENST00000460759 OR10G4Q8NGN3 311 aa10.14□□□□□ -0.79
NISCH-203ENST00000460759 OR10G9Q8NGN4 311 aa10.14□□□□□ -0.79
NISCH-203ENST00000460759 OR10G7Q8NGN6 311 aa10.14□□□□□ -0.79
NISCH-203ENST00000460759 OR2T6Q8NHC8 308 aa10.14□□□□□ -0.79
NISCH-203ENST00000460759 VN1R17PQ8TDU5 208 aa10.14□□□□□ -0.79
NISCH-203ENST00000460759 MBD3L1Q8WWY6 194 aa10.14□□□□□ -0.79
NISCH-203ENST00000460759 NPIPB3Q92617 1050 aa10.14□□□□□ -0.79
NISCH-203ENST00000460759 RNF2Q99496 336 aa10.14□□□□□ -0.79
NISCH-203ENST00000460759 TXN2Q99757 166 aa10.14□□□□□ -0.79
NISCH-203ENST00000460759 HRH4Q9H3N8 390 aa10.14□□□□□ -0.79
NISCH-203ENST00000460759 SLC39A9Q9NUM3 307 aa10.14□□□□□ -0.79
NISCH-203ENST00000460759 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
NISCH-203ENST00000460759 DMRT1Q9Y5R6 373 aa10.14□□□□□ -0.79
NISCH-203ENST00000460759 MFSD2BA6NFX1 497 aa10.13□□□□□ -0.79
NISCH-203ENST00000460759 SEC14L6B5MCN3 397 aa10.13□□□□□ -0.79
NISCH-203ENST00000460759 K7EIM0 57 aa10.13□□□□□ -0.79
NISCH-203ENST00000460759 OR10J1P30954 320 aa10.13□□□□□ -0.79
NISCH-203ENST00000460759 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
NISCH-203ENST00000460759 FHITP49789 147 aa10.13□□□□□ -0.79
NISCH-203ENST00000460759 C19orf54Q5BKX5 351 aa10.13□□□□□ -0.79
NISCH-203ENST00000460759 MIC13Q5XKP0 118 aa10.13□□□□□ -0.79
NISCH-203ENST00000460759 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
NISCH-203ENST00000460759 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
NISCH-203ENST00000460759 FANCD2OSQ96PS1 177 aa10.13□□□□□ -0.79
NISCH-203ENST00000460759 ATP6V0BQ99437 205 aa10.13□□□□□ -0.79
NISCH-203ENST00000460759 PBDC1Q9BVG4 233 aa10.13□□□□□ -0.79
NISCH-203ENST00000460759 YAE1D1Q9NRH1 226 aa10.13□□□□□ -0.79
NISCH-203ENST00000460759 CSPG4Q6UVK1 2322 aa10.13□□□□□ -0.79
NISCH-203ENST00000460759 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa10.12□□□□□ -0.79
NISCH-203ENST00000460759 A0A1W2PPV4 95 aa10.12□□□□□ -0.79
NISCH-203ENST00000460759 CLN5O75503 358 aa10.12□□□□□ -0.79
NISCH-203ENST00000460759 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
NISCH-203ENST00000460759 MFAP4P55083 255 aa10.12□□□□□ -0.79
NISCH-203ENST00000460759 RHOBP62745 196 aa10.12□□□□□ -0.79
NISCH-203ENST00000460759 C9orf152Q5JTZ5 239 aa10.12□□□□□ -0.79
NISCH-203ENST00000460759 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.4 ms