RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460176.6

GARNL3-211, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 5

Gene GARNL3, Length 569 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-211ENST00000460176 C8orf86Q6ZUL3 223 aa7.91□□□□□ -1.14
GARNL3-211ENST00000460176 ZNF502Q8TBZ5 544 aa7.91□□□□□ -1.14
GARNL3-211ENST00000460176 ASB13Q8WXK3 278 aa7.91□□□□□ -1.14
GARNL3-211ENST00000460176 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa7.91□□□□□ -1.14
GARNL3-211ENST00000460176 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
GARNL3-211ENST00000460176 CXorf58Q96LI9 332 aa7.91□□□□□ -1.14
GARNL3-211ENST00000460176 CCDC140Q96MF4 163 aa7.91□□□□□ -1.14
GARNL3-211ENST00000460176 RNF126Q9BV68 326 aa7.91□□□□□ -1.14
GARNL3-211ENST00000460176 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
GARNL3-211ENST00000460176 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
GARNL3-211ENST00000460176 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa7.9□□□□□ -1.14
GARNL3-211ENST00000460176 IGSF23A1L1A6 192 aa7.9□□□□□ -1.14
GARNL3-211ENST00000460176 PMS2P5A8MQ11 134 aa7.9□□□□□ -1.14
GARNL3-211ENST00000460176 G3V3Q6 166 aa7.9□□□□□ -1.14
GARNL3-211ENST00000460176 CCNKO75909 580 aa7.9□□□□□ -1.14
GARNL3-211ENST00000460176 TRBV12-3P01733 135 aa7.9□□□□□ -1.14
GARNL3-211ENST00000460176 OR8U8P0C7N1 319 aa7.9□□□□□ -1.14
GARNL3-211ENST00000460176 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
GARNL3-211ENST00000460176 OPRK1P41145 380 aa7.9□□□□□ -1.14
GARNL3-211ENST00000460176 RAP2BP61225 183 aa7.9□□□□□ -1.14
GARNL3-211ENST00000460176 CD69Q07108 199 aa7.9□□□□□ -1.14
GARNL3-211ENST00000460176 Q5BKY6 102 aa7.9□□□□□ -1.14
GARNL3-211ENST00000460176 ETV3LQ6ZN32 361 aa7.9□□□□□ -1.14
GARNL3-211ENST00000460176 HAPLN4Q86UW8 402 aa7.9□□□□□ -1.14
GARNL3-211ENST00000460176 SPATA3Q8NHX4 192 aa7.9□□□□□ -1.14
GARNL3-211ENST00000460176 RAX2Q96IS3 184 aa7.9□□□□□ -1.14
GARNL3-211ENST00000460176 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
GARNL3-211ENST00000460176 C21orf62Q9NYP8 219 aa7.9□□□□□ -1.14
GARNL3-211ENST00000460176 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
GARNL3-211ENST00000460176 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
GARNL3-211ENST00000460176 STAB1Q9NY15 2570 aa7.89□□□□□ -1.15
GARNL3-211ENST00000460176 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa7.89□□□□□ -1.15
GARNL3-211ENST00000460176 A0A087WW49 117 aa7.89□□□□□ -1.15
GARNL3-211ENST00000460176 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa7.89□□□□□ -1.15
GARNL3-211ENST00000460176 ANKRD34BA5PLL1 514 aa7.89□□□□□ -1.15
GARNL3-211ENST00000460176 FAM24AA6NFZ4 105 aa7.89□□□□□ -1.15
GARNL3-211ENST00000460176 E5RGE8 158 aa7.89□□□□□ -1.15
GARNL3-211ENST00000460176 TSPAN15O95858 294 aa7.89□□□□□ -1.15
GARNL3-211ENST00000460176 RLN2P04090 185 aa7.89□□□□□ -1.15
GARNL3-211ENST00000460176 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
GARNL3-211ENST00000460176 IFNA4P05014 189 aa7.89□□□□□ -1.15
GARNL3-211ENST00000460176 METTL15P1P0C7V9 234 aa7.89□□□□□ -1.15
GARNL3-211ENST00000460176 PET100P0DJ07 73 aa7.89□□□□□ -1.15
GARNL3-211ENST00000460176 LYL1P12980 280 aa7.89□□□□□ -1.15
GARNL3-211ENST00000460176 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
GARNL3-211ENST00000460176 P2RY1P47900 373 aa7.89□□□□□ -1.15
GARNL3-211ENST00000460176 BCAP31P51572 246 aa7.89□□□□□ -1.15
GARNL3-211ENST00000460176 RAB11AP62491 216 aa7.89□□□□□ -1.15
GARNL3-211ENST00000460176 FHL3Q13643 280 aa7.89□□□□□ -1.15
GARNL3-211ENST00000460176 CLEC19AQ6UXS0 136 aa7.89□□□□□ -1.15
GARNL3-211ENST00000460176 SLC16A13Q7RTY0 426 aa7.89□□□□□ -1.15
GARNL3-211ENST00000460176 DUX3Q96PT4 197 aa7.89□□□□□ -1.15
GARNL3-211ENST00000460176 ATP6V0BQ99437 205 aa7.89□□□□□ -1.15
GARNL3-211ENST00000460176 MBD2Q9UBB5 411 aa7.89□□□□□ -1.15
GARNL3-211ENST00000460176 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
GARNL3-211ENST00000460176 PPP5D1E7EU14 171 aa7.88□□□□□ -1.15
GARNL3-211ENST00000460176 CCL24O00175 119 aa7.88□□□□□ -1.15
GARNL3-211ENST00000460176 BMPR1BO00238 502 aa7.88□□□□□ -1.15
GARNL3-211ENST00000460176 RGS13O14921 159 aa7.88□□□□□ -1.15
GARNL3-211ENST00000460176 GPR183P32249 361 aa7.88□□□□□ -1.15
GARNL3-211ENST00000460176 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
GARNL3-211ENST00000460176 CAV2P51636 162 aa7.88□□□□□ -1.15
GARNL3-211ENST00000460176 MFAP4P55083 255 aa7.88□□□□□ -1.15
GARNL3-211ENST00000460176 ARL16Q0P5N6 197 aa7.88□□□□□ -1.15
GARNL3-211ENST00000460176 FAM209BQ5JX69 171 aa7.88□□□□□ -1.15
GARNL3-211ENST00000460176 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
GARNL3-211ENST00000460176 OR8G2PQ6IF36 304 aa7.88□□□□□ -1.15
GARNL3-211ENST00000460176 ACSM6Q6P461 480 aa7.88□□□□□ -1.15
GARNL3-211ENST00000460176 TMEM252Q8N6L7 170 aa7.88□□□□□ -1.15
GARNL3-211ENST00000460176 OR11H1Q8NG94 326 aa7.88□□□□□ -1.15
GARNL3-211ENST00000460176 OR1N2Q8NGR9 330 aa7.88□□□□□ -1.15
GARNL3-211ENST00000460176 OR2T35Q8NGX2 323 aa7.88□□□□□ -1.15
GARNL3-211ENST00000460176 OR4X1Q8NH49 305 aa7.88□□□□□ -1.15
GARNL3-211ENST00000460176 ZNF414Q96IQ9 312 aa7.88□□□□□ -1.15
GARNL3-211ENST00000460176 TXN2Q99757 166 aa7.88□□□□□ -1.15
GARNL3-211ENST00000460176 OR2T8A6NH00 312 aa7.87□□□□□ -1.15
GARNL3-211ENST00000460176 LINC01619G3V211 115 aa7.87□□□□□ -1.15
GARNL3-211ENST00000460176 M0QZ24 198 aa7.87□□□□□ -1.15
GARNL3-211ENST00000460176 TGOLN2O43493 480 aa7.87□□□□□ -1.15
GARNL3-211ENST00000460176 CST7O76096 145 aa7.87□□□□□ -1.15
GARNL3-211ENST00000460176 CLEC3BP05452 202 aa7.87□□□□□ -1.15
GARNL3-211ENST00000460176 SLC25A4P12235 298 aa7.87□□□□□ -1.15
GARNL3-211ENST00000460176 MYCNOSP40205 109 aa7.87□□□□□ -1.15
GARNL3-211ENST00000460176 RND2P52198 227 aa7.87□□□□□ -1.15
GARNL3-211ENST00000460176 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP7.87□□□□□ -1.15
GARNL3-211ENST00000460176 FGL1Q08830 312 aa7.87□□□□□ -1.15
GARNL3-211ENST00000460176 ZNF616Q08AN1 781 aa7.87□□□□□ -1.15
GARNL3-211ENST00000460176 GAMTQ14353 236 aa7.87□□□□□ -1.15
GARNL3-211ENST00000460176 Q56UQ5 140 aa7.87□□□□□ -1.15
GARNL3-211ENST00000460176 ETFRF1Q6IPR1 90 aa7.87□□□□□ -1.15
GARNL3-211ENST00000460176 LILRB2Q8N423 598 aa7.87□□□□□ -1.15
GARNL3-211ENST00000460176 UBAC2Q8NBM4 344 aa7.87□□□□□ -1.15
GARNL3-211ENST00000460176 TMEM116Q8NCL8 245 aa7.87□□□□□ -1.15
GARNL3-211ENST00000460176 OR4F17Q8NGA8 305 aa7.87□□□□□ -1.15
GARNL3-211ENST00000460176 THAP6Q8TBB0 222 aa7.87□□□□□ -1.15
GARNL3-211ENST00000460176 CACNG8Q8WXS5 425 aa7.87□□□□□ -1.15
GARNL3-211ENST00000460176 DCUN1D4Q92564 292 aa7.87□□□□□ -1.15
GARNL3-211ENST00000460176 DPF1Q92782 380 aa7.87□□□□□ -1.15
GARNL3-211ENST00000460176 ST6GAL2Q96JF0 529 aa7.87□□□□□ -1.15
GARNL3-211ENST00000460176 OR4F4Q96R69 305 aa7.87□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.9 ms