RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459159.1

SNORD54-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 54, humanhuman

BASIC

Gene SNORD54, Length 67 nt, Biotype snoRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD54-201ENST00000459159 TTC37Q6PGP7 1564 aa-2.78□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP-2.79□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP-2.79□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 B5MCH6 92 aa-2.79□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 TMEM262E9PQX1 116 aa-2.79□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 H3BN98 237 aa-2.79□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 VCYO14598 125 aa-2.79□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 ORC5O43913 435 aa-2.79□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 BBOX1O75936 387 aa-2.79□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 DIRAS1O95057 198 aa-2.79□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 CBX7O95931 251 aa-2.79□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 IGHG2P01859 326 aa-2.79□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 ORM1P02763 201 aa-2.79□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 IL3P08700 152 aa-2.79□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 CXCL1P09341 107 aa-2.79□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 IFI6P09912 130 aa-2.79□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 TSPY8P0CW00 308 aa-2.79□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 SRGAP2BP0DMP2 458 aa-2.79□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 NME2P22392 152 aa-2.79□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 CNTFP26441 200 aa-2.79□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP-2.79□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP-2.79□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 CRYBA2P53672 197 aa-2.79□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 GMFBP60983 142 aa-2.79□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP-2.79□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 RPL27P61353 136 aaKnown RBP-2.79□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 SULT2A1Q06520 285 aa-2.79□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 BNIP1Q12981 228 aa-2.79□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 CUL4AQ13619 759 aa-2.79□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 EMC2Q15006 297 aa-2.79□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 KYAT1Q16773 422 aa-2.79□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 C1orf140Q5VVS0 124 aa-2.79□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa-2.79□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 LCN8Q6JVE9 175 aa-2.79□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 FAM151BQ6UXP7 276 aa-2.79□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 RUFY3Q7L099 469 aa-2.79□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 LRRC8DQ7L1W4 858 aa-2.79□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 SLC35E3Q7Z769 313 aa-2.79□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 METTL23Q86XA0 190 aa-2.79□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 STX12Q86Y82 276 aa-2.79□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 PLCZ1Q86YW0 608 aa-2.79□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 KIAA0825Q8IV33 1275 aa-2.79□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 NELFCDQ8IXH7 590 aa-2.79□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa-2.79□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 PDCL2Q8N4E4 241 aa-2.79□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 SERP2Q8N6R1 65 aa-2.79□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 C11orf65Q8NCR3 313 aa-2.79□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 CEP70Q8NHQ1 597 aa-2.79□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 STYXQ8WUJ0 223 aa-2.79□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 HMGB4Q8WW32 186 aa-2.79□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 ST8SIA4Q92187 359 aa-2.79□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 LPGAT1Q92604 370 aa-2.79□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 ISOC2Q96AB3 205 aa-2.79□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 SKA1Q96BD8 255 aa-2.79□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 OR51E2Q9H255 320 aa-2.79□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP-2.79□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 GLRX2Q9NS18 164 aa-2.79□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 GIN1Q9NXP7 522 aa-2.79□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 IL20Q9NYY1 176 aa-2.79□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 KAAG1Q9UBP8 84 aa-2.79□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 CYP8B1Q9UNU6 501 aa-2.79□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 SH3GLB1Q9Y371 365 aa-2.79□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa-2.79□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 LRRC42Q9Y546 428 aa-2.79□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa-2.79□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 CCNB3Q8WWL7 1395 aa-2.79□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP-2.8□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa-2.8□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa-2.8□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 LGALS16A8MUM7 142 aa-2.8□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 EVPLLA8MZ36 301 aa-2.8□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa-2.8□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 BLOC1S5-TXNDC5H3BN57 136 aa-2.8□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 GNPATO15228 680 aa-2.8□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 ARPC5O15511 151 aa-2.8□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 HYPMO75409 117 aa-2.8□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 GOT2P00505 430 aaKnown RBP-2.8□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP-2.8□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 GTF2F2P13984 249 aa-2.8□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 ATP6V0CP27449 155 aa-2.8□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP-2.8□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 ACTR1BP42025 376 aa-2.8□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 NAMPTP43490 491 aa-2.8□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 OR1G1P47890 313 aa-2.8□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 PLA2G16P53816 162 aa-2.8□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 RAB38P57729 211 aa-2.8□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 NCALDP61601 193 aa-2.8□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP-2.8□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP-2.8□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 GABRA6Q16445 453 aa-2.8□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP-2.8□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 BTBD16Q32M84 506 aa-2.8□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa-2.8□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 NCAPH2Q6IBW4 605 aa-2.8□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 TANGO2Q6ICL3 276 aa-2.8□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 TRAT1Q6PIZ9 186 aa-2.8□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 PQLC2Q6ZP29 291 aa-2.8□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP-2.8□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 OR8H2Q8N162 312 aa-2.8□□□□□ -2.86
SNORD54-201ENST00000459159 ARHGAP18Q8N392 663 aa-2.8□□□□□ -2.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms