RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 RBKSQ9H477 322 aa12.79□□□□□ -0.36
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RABGEF1-204ENST00000442563 K7EMT4 169 aa12.78□□□□□ -0.36
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RABGEF1-204ENST00000442563 SEC22CQ9BRL7 303 aa12.71□□□□□ -0.37
RABGEF1-204ENST00000442563 SMPXQ9UHP9 88 aa12.71□□□□□ -0.37
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RABGEF1-204ENST00000442563 A8MZ25 164 aa12.7□□□□□ -0.38
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RABGEF1-204ENST00000442563 RND2P52198 227 aa12.7□□□□□ -0.38
RABGEF1-204ENST00000442563 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
RABGEF1-204ENST00000442563 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP12.7□□□□□ -0.38
RABGEF1-204ENST00000442563 BTNL8Q6UX41 500 aa12.7□□□□□ -0.38
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC16A13Q7RTY0 426 aa12.7□□□□□ -0.38
RABGEF1-204ENST00000442563 NRARPQ7Z6K4 114 aa12.7□□□□□ -0.38
RABGEF1-204ENST00000442563 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
RABGEF1-204ENST00000442563 NPIPB3Q92617 1050 aa12.7□□□□□ -0.38
RABGEF1-204ENST00000442563 GINS3Q9BRX5 216 aa12.7□□□□□ -0.38
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