RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429581.2

PTPRD-AS2-201, Transcript of PTPRD antisense RNA 2 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD-AS2, Length 2,838 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PYYP10082 97 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CRYBB3P26998 211 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C8orf31Q8N9H6 132 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IGLC7A0M8Q6 106 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 OR5I1Q13606 314 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PLGLAQ15195 96 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SLC25A33Q9BSK2 321 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GPR61Q9BZJ8 451 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CBLN4Q9NTU7 201 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IGSF10Q6WRI0 2623 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 F6UZH7 168 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TIMM23O14925 209 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 OR5G3P0C626 314 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 S100PP25815 95 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FAM71F2Q6NXP2 309 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SIGLEC9Q9Y336 463 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MYO18BQ8IUG5 2567 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa10.15□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SLC17A3O00476 420 aa10.15□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ORM2P19652 201 aa10.15□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TMEM249Q2WGJ8 235 aa10.15□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 OR4X1Q8NH49 305 aa10.15□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CSMD2Q7Z408 3487 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 K7EN84 100 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LIPFP07098 398 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LGALS7P47929 136 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 UBTD1Q9HAC8 227 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GGTLC3B5MD39 225 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PPP5D1E7EU14 171 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MT-CO2P00403 227 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 HOXA5P20719 270 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PATE2Q6UY27 113 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PPP1R27Q86WC6 154 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 OR5AU1Q8NGC0 362 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 OR4A5Q8NH83 315 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NIT2Q9NQR4 276 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MIOXQ9UGB7 285 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FNDC10F2Z333 226 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 H3BTX0 84 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C19orf84I3L1E1 186 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 COX7A2P2O60397 106 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 VENTXO95231 258 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 S100A9P06702 114 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MMDQ15546 238 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C11orf71Q6IPW1 123 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NHLRC2Q8NBF2 726 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CACNG8Q8WXS5 425 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TIMD4Q96H15 378 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SFRP2Q96HF1 295 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LINC00479Q96M42 142 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 S4R3C0 116 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CENPEQ02224 2701 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GNLYP22749 145 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP10.13□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 HES1Q14469 280 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LEMD1Q68G75 181 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CDPF1Q6NVV7 123 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MMD2Q8IY49 270 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 OR2T10Q8NGZ9 312 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SGMS2Q8NHU3 365 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SLC25A2Q9BXI2 301 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PHOX2AO14813 284 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C8orf88P0DMB2 117 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SSX2Q16385 188 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 OR1B1Q8NGR6 318 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ANAPC16Q96DE5 110 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SGK494Q96LW2 274 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DMRT1Q9Y5R6 373 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CELSR2Q9HCU4 2923 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ZNF320A2RRD8 509 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PSMB11A5LHX3 300 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CNIH1O95406 144 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RD3LP0DJH9 198 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 COMPP49747 757 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PQLC2Q6ZP29 291 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TEX45Q8NA69 505 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa10.12□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LOC105371242A0A075B767 164 aa10.11□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa10.11□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CRYGBP07316 175 aa10.11□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C10orf113Q5VZT2 155 aa10.11□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 BEND2Q8NDZ0 799 aa10.11□□□□□ -0.79
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms