RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428457.1

TNS3-204, Transcript of tensin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TNS3, Length 5,070 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3-204ENST00000428457 IFI27L2Q9H2X8 130 aa8.35□□□□□ -1.07
TNS3-204ENST00000428457 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa8.34□□□□□ -1.07
TNS3-204ENST00000428457 IGKV3-15P01624 115 aa8.34□□□□□ -1.07
TNS3-204ENST00000428457 LY6EQ16553 131 aa8.34□□□□□ -1.07
TNS3-204ENST00000428457 LINC01551Q86U37 167 aa8.34□□□□□ -1.07
TNS3-204ENST00000428457 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
TNS3-204ENST00000428457 THSD7BQ9C0I4 1608 aa8.34□□□□□ -1.07
TNS3-204ENST00000428457 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa8.34□□□□□ -1.07
TNS3-204ENST00000428457 S4R3C0 116 aa8.34□□□□□ -1.07
TNS3-204ENST00000428457 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
TNS3-204ENST00000428457 A0A1B0GW64 132 aa8.34□□□□□ -1.07
TNS3-204ENST00000428457 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
TNS3-204ENST00000428457 PSG1P11464 419 aa8.34□□□□□ -1.07
TNS3-204ENST00000428457 SLC25A16P16260 332 aa8.34□□□□□ -1.07
TNS3-204ENST00000428457 NEUROG1Q92886 237 aa8.34□□□□□ -1.07
TNS3-204ENST00000428457 GNB1LQ9BYB4 327 aa8.34□□□□□ -1.07
TNS3-204ENST00000428457 GREB1Q4ZG55 1949 aa8.34□□□□□ -1.07
TNS3-204ENST00000428457 DOCK4Q8N1I0 1966 aa8.34□□□□□ -1.07
TNS3-204ENST00000428457 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa8.34□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa8.34□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa8.34□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 C17orf100A8MU93 164 aa8.34□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 MFAP4P55083 255 aa8.34□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 UBE2V1Q13404 147 aa8.34□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 ORAOV1Q8WV07 137 aa8.34□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 C16orf92Q96LL3 132 aa8.34□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 CELA3AP09093 270 aa8.33□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 OR10J3Q5JRS4 329 aa8.33□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 PNKDQ8N490 385 aa8.33□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 PRSS22Q9GZN4 317 aa8.33□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 DPM3Q9P2X0 92 aa8.33□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa8.33□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 PYYP10082 97 aa8.33□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 TSPOP30536 169 aa8.33□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 EFNA4P52798 201 aa8.33□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 PATJQ8NI35 1801 aa8.33□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 TRAV24A0A0B4J272 114 aa8.33□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 hDV102S1A0JD36 115 aa8.33□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 NDUFA3O95167 84 aa8.33□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 TFF1P04155 84 aa8.33□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 C3orf79P0CE67 100 aa8.33□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 LHX2P50458 406 aa8.33□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 RPS20P60866 119 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 CACNG7P62955 275 aa8.33□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 PRSS8Q16651 343 aa8.33□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 FAM166AQ6J272 317 aa8.33□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 KLHDC3Q9BQ90 382 aa8.33□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa8.33□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 IGKV1D-12P01611 117 aa8.33□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 TMEM170BQ5T4T1 132 aa8.33□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 OR52E5Q8NH55 327 aa8.33□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 OSTCQ9NRP0 149 aa8.33□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 DOCK6Q96HP0 2047 aa8.33□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa8.32□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 Q6ZS92 163 aa8.32□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 OR10J6PQ8NGY7 276 aa8.32□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 DDB2Q92466 427 aa8.32□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 A0A087X0K7 114 aa8.32□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 FAM201AQ5SY85 155 aa8.32□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 GTSF1LQ9H1H1 148 aa8.32□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 ANK1P16157 1881 aa8.32□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 A0A1W2PRE2 83 aa8.32□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 FAM181BA6NEQ2 426 aa8.32□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 IGHV1-2P23083 117 aa8.32□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 WDR82Q6UXN9 313 aa8.32□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 PRSS33Q8NF86 280 aa8.32□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 PEMTQ9UBM1 199 aa8.32□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 TRAV1-1A0A0B4J248 108 aa8.32□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 EFNB3Q15768 340 aa8.32□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 FAM90A2PQ658T7 463 aa8.32□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 ZIC4Q8N9L1 334 aa8.32□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 GPR82Q96P67 336 aa8.32□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 FOXL1Q12952 345 aa8.31□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 PLA2G2CQ5R387 149 aa8.31□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 FAM74A4Q5TZK3 123 aa8.31□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa8.31□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 CDPF1Q6NVV7 123 aa8.31□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 C10orf126Q8N4M7 172 aa8.31□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 ZNF581Q9P0T4 197 aa8.31□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 CCL1P22362 96 aa8.31□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 ORMDL3Q8N138 153 aa8.31□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 ANAPC13Q9BS18 74 aa8.31□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 C5orf63A6NC05 138 aa8.31□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 CDKN1AP38936 164 aa8.31□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 DUX5Q96PT3 197 aa8.31□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 ST20Q9HBF5 79 aa8.31□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa8.31□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa8.31□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 IGHV2-5P01817 119 aa8.31□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 ACP7Q6ZNF0 438 aa8.31□□□□□ -1.08
TNS3-204ENST00000428457 SYT8Q8NBV8 401 aa8.31□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms