RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426333.6

EFTUD2-202, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EFTUD2, Length 4,548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-202ENST00000426333 DERL1Q9BUN8 251 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-202ENST00000426333 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-202ENST00000426333 A0A1W2PR77 199 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-202ENST00000426333 H3BUT2 72 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM201AQ5SY85 155 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-202ENST00000426333 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-202ENST00000426333 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-202ENST00000426333 MIA3Q5JRA6 1907 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-202ENST00000426333 COL4A3Q01955 1670 aa9.24□□□□□ -0.93
EFTUD2-202ENST00000426333 DOCK9Q9BZ29 2069 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-202ENST00000426333 PRR19A6NJB7 356 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-202ENST00000426333 FABP5P3A8MUU1 101 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-202ENST00000426333 FDCSPQ8NFU4 85 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-202ENST00000426333 MEGF9Q9H1U4 602 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-202ENST00000426333 CNTFRP26992 372 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM27E3Q08E93 113 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM170AQ8WVE7 144 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-202ENST00000426333 VCX2Q9H322 139 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM74BQ9NUR3 256 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-202ENST00000426333 IGKV1D-33P01593 117 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-202ENST00000426333 IGKV1-33P01594 117 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-202ENST00000426333 IGHV3-23P01764 117 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-202ENST00000426333 PF4P02776 101 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-202ENST00000426333 STARD6P59095 220 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-202ENST00000426333 CD69Q07108 199 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-202ENST00000426333 VKORC1Q9BQB6 163 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-202ENST00000426333 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-202ENST00000426333 Q9H3A6 140 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-202ENST00000426333 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-202ENST00000426333 ELOVL5Q9NYP7 299 aa9.23□□□□□ -0.93
EFTUD2-202ENST00000426333 SCN8AQ9UQD0 1980 aa9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-202ENST00000426333 PI4KAP42356 2102 aa9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-202ENST00000426333 TMEM95Q3KNT9 176 aa9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-202ENST00000426333 TGFAP01135 160 aa9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-202ENST00000426333 PPP1R27Q86WC6 154 aa9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-202ENST00000426333 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-202ENST00000426333 LINC01560Q8TB33 94 aa9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-202ENST00000426333 RNF126Q9BV68 326 aa9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-202ENST00000426333 ANKRD36A6QL64 1941 aa9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-202ENST00000426333 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-202ENST00000426333 NAPSAO96009 420 aa9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-202ENST00000426333 C1QTNF9P0C862 333 aa9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-202ENST00000426333 ASCL2Q99929 193 aa9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-202ENST00000426333 GDF15Q99988 308 aa9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-202ENST00000426333 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-202ENST00000426333 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-202ENST00000426333 FBLN5Q9UBX5 448 aa9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-202ENST00000426333 FREM3P0C091 2139 aa9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-202ENST00000426333 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-202ENST00000426333 COL6A3P12111 3177 aa9.22□□□□□ -0.93
EFTUD2-202ENST00000426333 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa9.21□□□□□ -0.93
EFTUD2-202ENST00000426333 CELA3AP09093 270 aa9.21□□□□□ -0.93
EFTUD2-202ENST00000426333 MBD3L1Q8WWY6 194 aa9.21□□□□□ -0.93
EFTUD2-202ENST00000426333 ARPC1AQ92747 370 aa9.21□□□□□ -0.93
EFTUD2-202ENST00000426333 DUX3Q96PT4 197 aa9.21□□□□□ -0.93
EFTUD2-202ENST00000426333 OSTCQ9NRP0 149 aa9.21□□□□□ -0.93
EFTUD2-202ENST00000426333 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa9.21□□□□□ -0.93
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa9.21□□□□□ -0.93
EFTUD2-202ENST00000426333 LINC00312Q9Y6C7 94 aa9.21□□□□□ -0.93
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF106Q9H2Y7 1883 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 SPEGQ15772 3267 aa9.21□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 A0A1W2PRE2 83 aa9.21□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 NDUFA3O95167 84 aa9.21□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 SFTA2Q6UW10 78 aa9.21□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 C2orf16Q68DN1 1984 aa9.21□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa9.21□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 GHRHP01286 108 aa9.21□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 HIST1H2BKO60814 126 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 HIST1H2BJP06899 126 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 HIST1H2BOP23527 126 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 HIST1H2BBP33778 126 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 HIST1H2BDP58876 126 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 HIST1H2BCP62807 126 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 ID3Q02535 119 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 HIST2H2BEQ16778 126 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM71F2Q6NXP2 309 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 NR2C2APQ86WQ0 139 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 FAM90A1Q86YD7 464 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 HIST1H2BHQ93079 126 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 HIST1H2BNQ99877 126 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 HIST1H2BMQ99879 126 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 H0YIZ8 118 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 HBDP02042 147 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 PPBPP02775 128 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 KIR3DL3Q8N743 410 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 OR4X2Q8NGF9 303 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 OTORQ9NRC9 128 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 IGKV1-13P0DP09 117 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 SAMD13Q5VXD3 122 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 CLEC19AQ6UXS0 136 aa9.2□□□□□ -0.94
EFTUD2-202ENST00000426333 BEND2Q8NDZ0 799 aa9.2□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.7 ms