RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

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Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SNRPGP15A8MWD9 76 aa11.68□□□□□ -0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 F8W735 103 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SYNGR2O43760 224 aa11.68□□□□□ -0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IFNA10P01566 189 aa11.68□□□□□ -0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC25A4P12235 298 aa11.68□□□□□ -0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OPRK1P41145 380 aa11.68□□□□□ -0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ID3Q02535 119 aa11.68□□□□□ -0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RELQ04864 619 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ETFRF1Q6IPR1 90 aa11.68□□□□□ -0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR4D5Q8NGN0 318 aa11.68□□□□□ -0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SEC22CQ9BRL7 303 aa11.68□□□□□ -0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CMYA5Q8N3K9 4069 aa11.67□□□□□ -0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa11.67□□□□□ -0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 A8MWP6 167 aa11.67□□□□□ -0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa11.67□□□□□ -0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ELLP55199 621 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DEFA6Q01524 100 aa11.67□□□□□ -0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IL34Q6ZMJ4 242 aa11.67□□□□□ -0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UBAC2Q8NBM4 344 aa11.67□□□□□ -0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR4X1Q8NH49 305 aa11.67□□□□□ -0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MPTX1A8MV57 137 aa11.66□□□□□ -0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 WRBO00258 174 aa11.66□□□□□ -0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NDUFA4O00483 81 aa11.66□□□□□ -0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GNG7O60262 68 aa11.66□□□□□ -0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PTTG1O95997 202 aa11.66□□□□□ -0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CTSGP08311 255 aa11.66□□□□□ -0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RAB11AP62491 216 aa11.66□□□□□ -0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MARC2Q969Z3 335 aa11.66□□□□□ -0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UFC1Q9Y3C8 167 aa11.66□□□□□ -0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa11.65□□□□□ -0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF320A2RRD8 509 aa11.65□□□□□ -0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGLV1-51P01701 117 aa11.65□□□□□ -0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CSN3P07498 182 aa11.65□□□□□ -0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ADMP35318 185 aa11.65□□□□□ -0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UXS1Q8NBZ7 420 aa11.65□□□□□ -0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM116Q8NCL8 245 aa11.65□□□□□ -0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR2K2Q8NGT1 345 aa11.65□□□□□ -0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM170AQ8WVE7 144 aa11.65□□□□□ -0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM190Q8WZ59 177 aa11.65□□□□□ -0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR10C1Q96KK4 312 aa11.65□□□□□ -0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CHRDL1Q9BU40 450 aa11.65□□□□□ -0.54
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PLXNB1O43157 2135 aa11.65□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C2orf70A6NJV1 201 aa11.64□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 K7EMT4 169 aa11.64□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CLN5O75503 358 aa11.64□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IFNA4P05014 189 aa11.64□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TAS2R30P59541 319 aa11.64□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KRTAP10-11P60412 298 aa11.64□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CACNG8Q8WXS5 425 aa11.64□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RAB40CQ96S21 281 aa11.64□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa11.64□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa11.64□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TNCP24821 2201 aa11.64□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C5orf51A6NDU8 294 aa11.63□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C15orf62A8K5M9 175 aa11.63□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM50AO95807 157 aa11.63□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IAPPP10997 89 aa11.63□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FOLR2P14207 255 aa11.63□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP11.63□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CD69Q07108 199 aa11.63□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRSS54Q6PEW0 395 aa11.63□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa11.63□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GSG1LQ6UXU4 331 aa11.63□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C2orf50Q96LR7 162 aa11.63□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MAGT1Q9H0U3 335 aa11.63□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GSKIPQ9P0R6 139 aa11.63□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMEM213A2RRL7 107 aa11.62□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM25EA8MYX2 175 aa11.62□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGHV3-48P01763 117 aa11.62□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C8orf88P0DMB2 117 aa11.62□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CBLN1P23435 193 aa11.62□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LCN12Q6JVE5 192 aa11.62□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C11orf87Q6NUJ2 197 aa11.62□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF600Q6ZNG1 722 aa11.62□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC16A13Q7RTY0 426 aa11.62□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR1S2Q8NGQ3 325 aa11.62□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SMIM8Q96KF7 97 aa11.62□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 WNK1Q9H4A3 2382 aa11.62□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CCSO14618 274 aa11.61□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SSSCA1O60232 199 aa11.61□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RND2P52198 227 aa11.61□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MLANAQ16655 118 aa11.61□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPANXN5Q5MJ07 72 aa11.61□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DYNLRB2Q8TF09 96 aa11.61□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ANAPC16Q96DE5 110 aa11.61□□□□□ -0.55
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GINS3Q9BRX5 216 aa11.61□□□□□ -0.55
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