RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367364.5

PTPRC-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 1,017 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-202ENST00000367364 DNASE1L1P49184 302 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-202ENST00000367364 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-202ENST00000367364 UBE2G1P62253 170 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-202ENST00000367364 CX3CL1P78423 397 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-202ENST00000367364 AESQ08117 197 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-202ENST00000367364 PSG7Q13046 419 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-202ENST00000367364 KLRD1Q13241 179 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-202ENST00000367364 GNMTQ14749 295 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF74Q16587 644 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-202ENST00000367364 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-202ENST00000367364 C5orf47Q569G3 176 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-202ENST00000367364 LCN15Q6UWW0 184 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF562Q6V9R5 426 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-202ENST00000367364 FA2HQ7L5A8 372 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-202ENST00000367364 TCF23Q7RTU1 214 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-202ENST00000367364 HMGN2P46Q86SG4 172 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-202ENST00000367364 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-202ENST00000367364 OR6K6Q8NGW6 343 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-202ENST00000367364 PIFOQ8TCI5 191 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-202ENST00000367364 CT55Q8WUE5 264 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-202ENST00000367364 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-202ENST00000367364 BLNKQ8WV28 456 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-202ENST00000367364 FGF14Q92915 247 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-202ENST00000367364 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-202ENST00000367364 SPATA33Q96N06 139 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-202ENST00000367364 TSSK2Q96PF2 358 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-202ENST00000367364 RCHY1Q96PM5 261 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-202ENST00000367364 RAB40CQ96S21 281 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-202ENST00000367364 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-202ENST00000367364 CITED1Q99966 193 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-202ENST00000367364 SAMD10Q9BYL1 202 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-202ENST00000367364 ULBP3Q9BZM4 244 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-202ENST00000367364 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-202ENST00000367364 ELOVL3Q9HB03 270 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-202ENST00000367364 YAE1D1Q9NRH1 226 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-202ENST00000367364 KCNIP2Q9NS61 270 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-202ENST00000367364 CENPMQ9NSP4 180 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-202ENST00000367364 THYN1Q9P016 225 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-202ENST00000367364 TBC1D29Q9UFV1 150 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-202ENST00000367364 NAT8BQ9UHF3 227 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-202ENST00000367364 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-202ENST00000367364 LHFPL6Q9Y693 200 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-202ENST00000367364 V9GYV3 84 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-202ENST00000367364 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-202ENST00000367364 USF3Q68DE3 2245 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-202ENST00000367364 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 A0A1B0GV50 99 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 TMEM8BA6NDV4 472 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 F8W1H4 67 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 H3BMH7 237 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 J3QR89 54 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 HLA-DQA1P01909 254 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 TTRP02766 147 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 CA3P07451 260 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 PVRP15151 417 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 USF1P22415 310 aaPredicted RBP2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 CBLN1P23435 193 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 GPR183P32249 361 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 PSMB3P49720 205 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 SNU13P55769 128 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 RHOAP61586 193 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 RPS24P62847 133 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF146Q15072 292 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 MEP1BQ16820 701 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 VWC2Q2TAL6 325 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 LINC01545Q5VT33 79 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 PLCXD3Q63HM9 321 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 LCN12Q6JVE5 192 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 Q6P435 159 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 Q6Q795 121 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 BAGE3Q86Y29 109 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 BAGE2Q86Y30 109 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF547Q8IVP9 402 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF645Q8N7E2 425 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 NECAP1Q8NC96 275 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF439Q8NDP4 499 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 OR5D14Q8NGL3 314 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 OR52E5Q8NH55 327 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 OR52N5Q8NH56 324 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 OR2AE1Q8NHA4 323 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF502Q8TBZ5 544 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 OR51E1Q8TCB6 317 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 GTSF1Q8WW33 167 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 PP6455Q8WZ26 134 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 LINC01600Q96MT4 127 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 NDFIP1Q9BT67 221 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 CHRDL1Q9BU40 450 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 GGTLC1Q9BX51 225 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 TMEM222Q9H0R3 208 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 TXNIPQ9H3M7 391 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 ZNF286AQ9HBT8 521 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 OSTCQ9NRP0 149 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-202ENST00000367364 KCNIP1Q9NZI2 227 aa2.71□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.3 ms