RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318129.5

GINS3-201, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 2,274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-201ENST00000318129 C12orf77C9JDV5 145 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 CBLN1P23435 193 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 TMEM30BQ3MIR4 351 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 TPRX1Q8N7U7 411 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 UHRF2Q96PU4 802 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 OR4C12Q96R67 309 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 CTSZQ9UBR2 303 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 LINC00312Q9Y6C7 94 aa8.31□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 PDZD2O15018 2839 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 IGLC7A0M8Q6 106 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 PAGE4O60829 102 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 ZNF253O75346 499 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 HBZP02008 142 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 RPL31P62899 125 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 HTD2P86397 168 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 VAMP3Q15836 100 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 OR5B3Q8NH48 314 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 FAM168AQ92567 244 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP8.3□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 PIMREGQ9BSJ6 248 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 SLC25A22Q9H936 323 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 NRN1Q9NPD7 142 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 CLN8Q9UBY8 286 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 TIMM9Q9Y5J7 89 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 OTOGQ6ZRI0 2925 aa8.3□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 ACANP16112 2415 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 C15orf65H3BRN8 121 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 NBEAP1P0C6P0 100 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 CGB3P0DN86 165 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 CGB7P0DN87 165 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 SLC25A6P12236 298 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 HBG1P69891 147 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 HBG2P69892 147 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 ACSM6Q6P461 480 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 ZNF841Q6ZN19 808 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 PNKDQ8N490 385 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 IL1F10Q8WWZ1 152 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 NINJ1Q92982 152 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 SFRP2Q96HF1 295 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 DCTN5Q9BTE1 182 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 LINC00574Q9H8X3 128 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 DOCK11Q5JSL3 2073 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 RNF212BA8MTL3 300 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 F2RL2O00254 374 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP8.29□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 TUSC2O75896 110 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 C16orf54Q6UWD8 224 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 ZNF114Q8NC26 417 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 OR4F17Q8NGA8 305 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 OR1L1Q8NH94 360 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 SMIM12Q96EX1 92 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 CALYQ9NYX4 217 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 PSENENQ9NZ42 101 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 DSCAML1Q8TD84 2053 aa8.29□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa8.28□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 C11orf94C9JXX5 98 aa8.28□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 H0Y980 276 aa8.28□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 SYNGR2O43760 224 aa8.28□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 IGKV1-13P0DP09 117 aa8.28□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 PSG1P11464 419 aa8.28□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 PRRX1P54821 245 aa8.28□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 GNB1P62873 340 aa8.28□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 TMEM200BQ69YZ2 307 aa8.28□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 OR10V1Q8NGI7 309 aa8.28□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 C8orf46Q8TAG6 207 aa8.28□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 C10orf105Q8TEF2 133 aa8.28□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 FAM216AQ8WUB2 273 aa8.28□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 NRGNQ92686 78 aa8.28□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 OR2W1Q9Y3N9 320 aa8.28□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa8.28□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa8.28□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 FCN3O75636 299 aa8.28□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 SSTR5P35346 364 aa8.28□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 C17orf58Q2M2W7 97 aa8.28□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 Q6ZRM9 215 aa8.28□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 FGFRL1Q8N441 504 aa8.28□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 MBD6Q96DN6 1003 aa8.28□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 PERPQ96FX8 193 aa8.28□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 ZNF714Q96N38 554 aa8.28□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 BPESC1Q9GZL8 116 aa8.28□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 GNB4Q9HAV0 340 aa8.28□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa8.28□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 JPT1Q9UK76 154 aa8.28□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 MXRA5Q9NR99 2828 aa8.27□□□□□ -1.08
GINS3-201ENST00000318129 ITPR3Q14573 2671 aa8.27□□□□□ -1.09
GINS3-201ENST00000318129 VWC2LB2RUY7 222 aa8.27□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.6 ms