RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317991.9

GRAMD1A-201, Transcript of GRAM domain containing 1A, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene GRAMD1A, Length 2,695 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1A-201ENST00000317991 NAV3Q8IVL0 2385 aa18.15■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 CD46P15529 392 aa18.15■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 CR1LQ2VPA4 569 aa18.15■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 MUC15Q8N387 334 aa18.15■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa18.15■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 COMMD5Q9GZQ3 224 aa18.15■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 INTS1Q8N201 2190 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 HOXC12P31275 282 aa18.15■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa18.14■□□□□ 0.5
GRAMD1A-201ENST00000317991 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa18.14■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 IGHV3-48P01763 117 aa18.14■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 PRCDQ00LT1 54 aa18.14■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 OR5B3Q8NH48 314 aa18.14■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 LOXL4Q96JB6 756 aa18.14■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa18.14■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 HIGD1CA8MV81 97 aa18.14■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 ACP1P24666 158 aa18.14■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 PNKDQ8N490 385 aa18.14■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa18.13■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 C21orf140B9A014 251 aa18.13■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 FNDC10F2Z333 226 aa18.13■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 TNFSF4P23510 183 aa18.13■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 RNF151Q2KHN1 245 aa18.13■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 LINC00173Q6ZV60 143 aa18.13■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 K7EP13 123 aa18.13■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 CGB3P0DN86 165 aa18.13■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 CGB7P0DN87 165 aa18.13■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 GNG5P63218 68 aa18.13■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 OR4C5Q8NGB2 326 aa18.13■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZPBPQ9BS86 351 aa18.13■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 SAP30LQ9HAJ7 183 aa18.13■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 DSCAML1Q8TD84 2053 aa18.13■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa18.12■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 MPV17L2Q567V2 206 aa18.12■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZNF841Q6ZN19 808 aa18.12■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 MOGAT3Q86VF5 341 aa18.12■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 PPP1R35Q8TAP8 253 aa18.12■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 PRNDQ9UKY0 176 aa18.12■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 UPK2O00526 184 aa18.12■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa18.12■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 OR2D3Q8NGH3 330 aa18.12■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 GRAMD2BQ96HH9 432 aa18.12■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 PSMB11A5LHX3 300 aa18.11■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 LAMTOR5O43504 91 aa18.11■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 PLXNB1O43157 2135 aa18.11■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 PLAUP00749 431 aa18.11■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 CA7P43166 264 aa18.11■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 VAMP3Q15836 100 aa18.11■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 OR2V2Q96R30 315 aa18.11■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 TCF24Q7RTU0 167 aa18.1■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZNF329Q86UD4 541 aa18.1■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 RND1Q92730 232 aa18.1■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 RNF24Q9Y225 148 aa18.1■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 hDV102S1A0JD36 115 aa18.1■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 PEX7O00628 323 aa18.1■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 CD69Q07108 199 aa18.1■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa18.09■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 CT45A6P0DMU7 189 aa18.09■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 CT45A5P0DMU8 189 aa18.09■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 CT45A7P0DMV0 189 aa18.09■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 KIR2DL2P43627 348 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 CDKN1BP46527 198 aa18.09■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 RTL8BQ17RB0 113 aa18.09■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 C2orf83Q53S99 150 aa18.09■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 RASL11AQ6T310 242 aa18.09■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZNF596Q8TC21 504 aa18.09■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 TMEM70Q9BUB7 260 aa18.09■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 C19orf24Q9BVV8 132 aa18.09■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa18.09■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 OR4C46A6NHA9 309 aa18.09■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAM231DQ6ZW35 169 aa18.09■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 C1orf210Q8IVY1 113 aa18.09■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 DYSFO75923 2080 aa18.08■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 E7EUB6 86 aa18.08■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 ITGB1BP1O14713 200 aa18.08■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 FAM120AOSQ5T036 256 aa18.08■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 PAXXQ9BUH6 204 aa18.08■□□□□ 0.49
GRAMD1A-201ENST00000317991 PLCE1Q9P212 2302 aa18.08■□□□□ 0.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 POU2AF1Q16633 256 aa18.08■□□□□ 0.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa18.08■□□□□ 0.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 PATE2Q6UY27 113 aa18.08■□□□□ 0.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 DEFB108BQ8NET1 73 aa18.08■□□□□ 0.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa18.08■□□□□ 0.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 OR2J3O76001 311 aa18.07■□□□□ 0.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 HES3Q5TGS1 186 aa18.07■□□□□ 0.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 ETFRF1Q6IPR1 90 aa18.07■□□□□ 0.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 ABCA1O95477 2261 aa18.07■□□□□ 0.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 RPH3ALQ9UNE2 315 aa18.07■□□□□ 0.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 WASHC3Q9Y3C0 194 aa18.07■□□□□ 0.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 SPRY3O43610 288 aa18.06■□□□□ 0.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 SSX8Q7RTT4 187 aa18.06■□□□□ 0.48
GRAMD1A-201ENST00000317991 C9orf106Q8NAJ2 232 aa18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.4 ms