RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 AJUBAQ96IF1 538 aa21.35■■□□□ 1.01
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM250H0YL14 139 aa21.34■■□□□ 1.01
HOXD8-201ENST00000313173 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP21.34■■□□□ 1.01
HOXD8-201ENST00000313173 AKR1C3P42330 323 aa21.34■■□□□ 1.01
HOXD8-201ENST00000313173 C19orf35Q6ZS72 473 aa21.34■■□□□ 1.01
HOXD8-201ENST00000313173 C19orf24Q9BVV8 132 aa21.34■■□□□ 1.01
HOXD8-201ENST00000313173 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
HOXD8-201ENST00000313173 RND2P52198 227 aa21.33■■□□□ 1.01
HOXD8-201ENST00000313173 PAX8Q06710 450 aa21.33■■□□□ 1.01
HOXD8-201ENST00000313173 NANPQ8TBE9 248 aa21.33■■□□□ 1.01
HOXD8-201ENST00000313173 FUT9Q9Y231 359 aa21.33■■□□□ 1.01
HOXD8-201ENST00000313173 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa21.33■■□□□ 1
HOXD8-201ENST00000313173 MT-CO2P00403 227 aa21.33■■□□□ 1
HOXD8-201ENST00000313173 SAA4P35542 130 aa21.33■■□□□ 1
HOXD8-201ENST00000313173 FAM78BQ5VT40 261 aa21.33■■□□□ 1
HOXD8-201ENST00000313173 LINC00518Q8N0U6 118 aa21.33■■□□□ 1
HOXD8-201ENST00000313173 OR4F5Q8NH21 305 aa21.33■■□□□ 1
HOXD8-201ENST00000313173 PERPQ96FX8 193 aa21.33■■□□□ 1
HOXD8-201ENST00000313173 OR4F4Q96R69 305 aa21.33■■□□□ 1
HOXD8-201ENST00000313173 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa21.32■■□□□ 1
HOXD8-201ENST00000313173 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa21.32■■□□□ 1
HOXD8-201ENST00000313173 IGHV3-48P01763 117 aa21.32■■□□□ 1
HOXD8-201ENST00000313173 PAX1P15863 534 aa21.32■■□□□ 1
HOXD8-201ENST00000313173 ABCA2Q9BZC7 2435 aa21.32■■□□□ 1
HOXD8-201ENST00000313173 SPG11Q96JI7 2443 aa21.32■■□□□ 1
HOXD8-201ENST00000313173 OR5G3P0C626 314 aa21.31■■□□□ 1
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM11P17152 192 aa21.31■■□□□ 1
HOXD8-201ENST00000313173 FXYD3Q14802 87 aa21.31■■□□□ 1
HOXD8-201ENST00000313173 C22orf15Q8WYQ4 148 aa21.31■■□□□ 1
HOXD8-201ENST00000313173 NRGNQ92686 78 aa21.31■■□□□ 1
HOXD8-201ENST00000313173 SLC25A33Q9BSK2 321 aa21.31■■□□□ 1
HOXD8-201ENST00000313173 NPFFO15130 113 aa21.31■■□□□ 1
HOXD8-201ENST00000313173 GCHFRP30047 84 aa21.31■■□□□ 1
HOXD8-201ENST00000313173 MIR17HGQ75NE6 70 aa21.31■■□□□ 1
HOXD8-201ENST00000313173 MLXQ9UH92 298 aa21.31■■□□□ 1
HOXD8-201ENST00000313173 DMRT1Q9Y5R6 373 aa21.31■■□□□ 1
HOXD8-201ENST00000313173 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
HOXD8-201ENST00000313173 C11orf94C9JXX5 98 aa21.3■■□□□ 1
HOXD8-201ENST00000313173 SELENOTP62341 195 aa21.3■■□□□ 1
HOXD8-201ENST00000313173 FAM106CPP0CH98 169 aa21.29■■□□□ 1
HOXD8-201ENST00000313173 DSCR9P59020 149 aa21.29■■□□□ 1
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM116Q8NCL8 245 aa21.29■■□□□ 1
HOXD8-201ENST00000313173 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa21.29■■□□□ 1
HOXD8-201ENST00000313173 PSMB11A5LHX3 300 aa21.29■■□□□ 1
HOXD8-201ENST00000313173 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
HOXD8-201ENST00000313173 BRS3P32247 399 aa21.29■■□□□ 1
HOXD8-201ENST00000313173 UBE2G2P60604 165 aa21.29■■□□□ 1
HOXD8-201ENST00000313173 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
HOXD8-201ENST00000313173 TUBA4BQ9H853 241 aa21.29■■□□□ 1
HOXD8-201ENST00000313173 CENPEQ02224 2701 aa21.29■■□□□ 1
HOXD8-201ENST00000313173 CELSR2Q9HCU4 2923 aa21.29■■□□□ 1
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF727A8MUV8 499 aa21.28■■□□□ 1
HOXD8-201ENST00000313173 FBN2P35556 2912 aa21.28■■□□□ 1
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF562Q6V9R5 426 aa21.28■■□□□ 1
HOXD8-201ENST00000313173 RNF2Q99496 336 aa21.28■■□□□ 1
HOXD8-201ENST00000313173 TXNDC17Q9BRA2 123 aa21.28■■□□□ 1
HOXD8-201ENST00000313173 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
HOXD8-201ENST00000313173 WNT10AQ9GZT5 417 aa21.28■■□□□ 1
HOXD8-201ENST00000313173 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP21.28■■□□□ 1
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF90Q03938 601 aa21.27■■□□□ 1
HOXD8-201ENST00000313173 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa21.27■■□□□ 1
HOXD8-201ENST00000313173 PIP4P2Q8N4L2 257 aa21.27■■□□□ 1
HOXD8-201ENST00000313173 TRGV9Q99603 122 aa21.27■■□□□ 1
HOXD8-201ENST00000313173 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
HOXD8-201ENST00000313173 CST9LP1Q5W188 147 aa21.27■■□□□ 1
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM37Q8WXS4 190 aa21.27■■□□□ 1
HOXD8-201ENST00000313173 SMIM7Q9BQ49 75 aa21.27■■□□□ 1
HOXD8-201ENST00000313173 TNFRSF19Q9NS68 423 aa21.27■■□□□ 1
HOXD8-201ENST00000313173 PDE6DO43924 150 aa21.26■□□□□ 0.99
HOXD8-201ENST00000313173 ATP5G3P48201 142 aa21.26■□□□□ 0.99
HOXD8-201ENST00000313173 CX3CL1P78423 397 aa21.26■□□□□ 0.99
HOXD8-201ENST00000313173 FAM120AOSQ5T036 256 aa21.26■□□□□ 0.99
HOXD8-201ENST00000313173 C15orf54Q8N8G6 183 aa21.26■□□□□ 0.99
HOXD8-201ENST00000313173 OR1L6Q8NGR2 347 aa21.26■□□□□ 0.99
HOXD8-201ENST00000313173 ARPC1AQ92747 370 aa21.26■□□□□ 0.99
HOXD8-201ENST00000313173 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP21.26■□□□□ 0.99
HOXD8-201ENST00000313173 SDF2L1Q9HCN8 221 aa21.26■□□□□ 0.99
HOXD8-201ENST00000313173 C1RLQ9NZP8 487 aa21.26■□□□□ 0.99
HOXD8-201ENST00000313173 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa21.25■□□□□ 0.99
HOXD8-201ENST00000313173 A0A087WWC5 75 aa21.25■□□□□ 0.99
HOXD8-201ENST00000313173 CLN5O75503 358 aa21.25■□□□□ 0.99
HOXD8-201ENST00000313173 TAS2R45P59539 299 aa21.25■□□□□ 0.99
HOXD8-201ENST00000313173 OR1L4Q8NGR5 311 aa21.25■□□□□ 0.99
HOXD8-201ENST00000313173 PFDN5Q99471 154 aa21.25■□□□□ 0.99
HOXD8-201ENST00000313173 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
HOXD8-201ENST00000313173 PARLQ9H300 379 aa21.25■□□□□ 0.99
HOXD8-201ENST00000313173 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa21.25■□□□□ 0.99
HOXD8-201ENST00000313173 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
HOXD8-201ENST00000313173 I3L2K1 104 aa21.25■□□□□ 0.99
HOXD8-201ENST00000313173 NAT8Q9UHE5 227 aa21.25■□□□□ 0.99
HOXD8-201ENST00000313173 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa21.24■□□□□ 0.99
HOXD8-201ENST00000313173 COLCA2A8K830 154 aa21.24■□□□□ 0.99
HOXD8-201ENST00000313173 B4DEV8 164 aa21.24■□□□□ 0.99
HOXD8-201ENST00000313173 F6UZH7 168 aa21.24■□□□□ 0.99
HOXD8-201ENST00000313173 BPIFB3P59826 476 aa21.24■□□□□ 0.99
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF674Q2M3X9 581 aa21.24■□□□□ 0.99
HOXD8-201ENST00000313173 PQLC2Q6ZP29 291 aa21.24■□□□□ 0.99
HOXD8-201ENST00000313173 COX7A2P2O60397 106 aa21.23■□□□□ 0.99
HOXD8-201ENST00000313173 Q8N9W7 124 aa21.23■□□□□ 0.99
HOXD8-201ENST00000313173 OR4X1Q8NH49 305 aa21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms