RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
PTX4-201ENST00000293922 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
PTX4-201ENST00000293922 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP14.15□□□□□ -0.14
PTX4-201ENST00000293922 FOXE3Q13461 319 aa14.15□□□□□ -0.14
PTX4-201ENST00000293922 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa14.15□□□□□ -0.14
PTX4-201ENST00000293922 STX12Q86Y82 276 aa14.15□□□□□ -0.14
PTX4-201ENST00000293922 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa14.15□□□□□ -0.14
PTX4-201ENST00000293922 PPP1R14BQ96C90 147 aa14.15□□□□□ -0.14
PTX4-201ENST00000293922 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
PTX4-201ENST00000293922 CST7O76096 145 aa14.14□□□□□ -0.15
PTX4-201ENST00000293922 PRH1P02810 166 aa14.14□□□□□ -0.15
PTX4-201ENST00000293922 SLC25A24Q6NUK1 477 aa14.14□□□□□ -0.15
PTX4-201ENST00000293922 REC114Q7Z4M0 266 aa14.14□□□□□ -0.15
PTX4-201ENST00000293922 HAPLN4Q86UW8 402 aa14.14□□□□□ -0.15
PTX4-201ENST00000293922 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP14.14□□□□□ -0.15
PTX4-201ENST00000293922 MFFQ9GZY8 342 aa14.14□□□□□ -0.15
PTX4-201ENST00000293922 NUDT19A8MXV4 375 aa14.13□□□□□ -0.15
PTX4-201ENST00000293922 ELANEP08246 267 aa14.13□□□□□ -0.15
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PTX4-201ENST00000293922 ARL16Q0P5N6 197 aa14.13□□□□□ -0.15
PTX4-201ENST00000293922 OR2F1Q13607 317 aa14.13□□□□□ -0.15
PTX4-201ENST00000293922 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
PTX4-201ENST00000293922 ZNF345Q14585 488 aa14.13□□□□□ -0.15
PTX4-201ENST00000293922 OR10P1Q8NGE3 313 aa14.13□□□□□ -0.15
PTX4-201ENST00000293922 THYN1Q9P016 225 aa14.13□□□□□ -0.15
PTX4-201ENST00000293922 HSPB11Q9Y547 144 aa14.13□□□□□ -0.15
PTX4-201ENST00000293922 PSMB8P28062 276 aa14.12□□□□□ -0.15
PTX4-201ENST00000293922 HBG1P69891 147 aa14.12□□□□□ -0.15
PTX4-201ENST00000293922 HBG2P69892 147 aa14.12□□□□□ -0.15
PTX4-201ENST00000293922 OR8G2PQ6IF36 304 aa14.12□□□□□ -0.15
PTX4-201ENST00000293922 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
PTX4-201ENST00000293922 MISP3Q96FF7 219 aa14.12□□□□□ -0.15
PTX4-201ENST00000293922 SLA2Q9H6Q3 261 aa14.12□□□□□ -0.15
PTX4-201ENST00000293922 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa14.12□□□□□ -0.15
PTX4-201ENST00000293922 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP14.12□□□□□ -0.15
PTX4-201ENST00000293922 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa14.11□□□□□ -0.15
PTX4-201ENST00000293922 I3L2K1 104 aa14.11□□□□□ -0.15
PTX4-201ENST00000293922 CXCL2P19875 107 aa14.11□□□□□ -0.15
PTX4-201ENST00000293922 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
PTX4-201ENST00000293922 MYCNOSP40205 109 aa14.11□□□□□ -0.15
PTX4-201ENST00000293922 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
PTX4-201ENST00000293922 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP14.11□□□□□ -0.15
PTX4-201ENST00000293922 CD69Q07108 199 aa14.11□□□□□ -0.15
PTX4-201ENST00000293922 TMEM217Q8N7C4 229 aa14.11□□□□□ -0.15
PTX4-201ENST00000293922 NECAP1Q8NC96 275 aa14.11□□□□□ -0.15
PTX4-201ENST00000293922 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
PTX4-201ENST00000293922 RAX2Q96IS3 184 aa14.11□□□□□ -0.15
PTX4-201ENST00000293922 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP14.11□□□□□ -0.15
PTX4-201ENST00000293922 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa14.11□□□□□ -0.15
PTX4-201ENST00000293922 K7EIM0 57 aa14.1□□□□□ -0.15
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PTX4-201ENST00000293922 NDUFB8O95169 186 aa14.1□□□□□ -0.15
PTX4-201ENST00000293922 MT-CO2P00403 227 aa14.1□□□□□ -0.15
PTX4-201ENST00000293922 S100A11P31949 105 aa14.1□□□□□ -0.15
PTX4-201ENST00000293922 OPRK1P41145 380 aa14.1□□□□□ -0.15
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PTX4-201ENST00000293922 SLC38A11Q08AI6 406 aa14.1□□□□□ -0.15
PTX4-201ENST00000293922 KCNRGQ8N5I3 272 aa14.1□□□□□ -0.15
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PTX4-201ENST00000293922 MS4A10Q96PG2 267 aa14.1□□□□□ -0.15
PTX4-201ENST00000293922 DUX3Q96PT4 197 aa14.1□□□□□ -0.15
PTX4-201ENST00000293922 GGACTQ9BVM4 153 aa14.1□□□□□ -0.15
PTX4-201ENST00000293922 FBXL7Q9UJT9 491 aa14.1□□□□□ -0.15
PTX4-201ENST00000293922 A0A0D9SG52 128 aa14.09□□□□□ -0.15
PTX4-201ENST00000293922 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa14.09□□□□□ -0.15
PTX4-201ENST00000293922 FAM223BA6NKX1 122 aa14.09□□□□□ -0.15
PTX4-201ENST00000293922 TRGV3P03979 118 aa14.09□□□□□ -0.15
PTX4-201ENST00000293922 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP14.09□□□□□ -0.15
PTX4-201ENST00000293922 RAB9AP51151 201 aa14.09□□□□□ -0.15
PTX4-201ENST00000293922 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
PTX4-201ENST00000293922 DLK1P80370 383 aa14.09□□□□□ -0.15
PTX4-201ENST00000293922 DEFB136Q30KP8 78 aa14.09□□□□□ -0.15
PTX4-201ENST00000293922 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP14.09□□□□□ -0.15
PTX4-201ENST00000293922 FAM223AQ8IWN6 122 aa14.09□□□□□ -0.15
PTX4-201ENST00000293922 C9orf62Q8N4C0 152 aa14.09□□□□□ -0.15
PTX4-201ENST00000293922 OR1S2Q8NGQ3 325 aa14.09□□□□□ -0.15
PTX4-201ENST00000293922 MYOZ3Q8TDC0 251 aa14.09□□□□□ -0.15
PTX4-201ENST00000293922 KLK15Q9H2R5 256 aa14.09□□□□□ -0.15
PTX4-201ENST00000293922 FNDC10F2Z333 226 aa14.08□□□□□ -0.15
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PTX4-201ENST00000293922 MLANAQ16655 118 aa14.08□□□□□ -0.15
PTX4-201ENST00000293922 ATP6V1FQ16864 119 aa14.08□□□□□ -0.15
PTX4-201ENST00000293922 C15orf32Q32M92 178 aa14.08□□□□□ -0.15
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PTX4-201ENST00000293922 ETFRF1Q6IPR1 90 aa14.08□□□□□ -0.15
PTX4-201ENST00000293922 SLC16A13Q7RTY0 426 aa14.08□□□□□ -0.15
PTX4-201ENST00000293922 VN1R17PQ8TDU5 208 aa14.08□□□□□ -0.15
PTX4-201ENST00000293922 USMG5Q96IX5 58 aa14.08□□□□□ -0.15
PTX4-201ENST00000293922 FBXL17Q9UF56 701 aa14.08□□□□□ -0.15
PTX4-201ENST00000293922 KRTAP10-11P60412 298 aa14.07□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP14.07□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 VWC2Q2TAL6 325 aa14.07□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 LILRB2Q8N423 598 aa14.07□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 MRAPQ8TCY5 172 aa14.07□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 SCARB1Q8WTV0 552 aa14.07□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 CXorf58Q96LI9 332 aa14.07□□□□□ -0.16
PTX4-201ENST00000293922 MFSD2BA6NFX1 497 aa14.07□□□□□ -0.16
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