RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 TBX15Q96SF7 602 aa7.01□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa7.01□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 FKBP11Q9NYL4 201 aa7.01□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 SLC45A2Q9UMX9 530 aa7.01□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa7.01□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 PKIAP61925 76 aa7.01□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 RPP30P78346 268 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 FBLN7Q53RD9 439 aa7.01□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 DIRC2Q96SL1 478 aa7.01□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 IL19Q9UHD0 177 aa7.01□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 NAT8BQ9UHF3 227 aa7.01□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 POLQO75417 2590 aa7.01□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa7.01□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 FAM90A27PA6NNH2 459 aa7.01□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 C17orf100A8MU93 164 aa7.01□□□□□ -1.29
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GINS1-201ENST00000262460 C16orf97H3BN30 126 aa7.01□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 NTF3P20783 257 aa7.01□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 CAMPP49913 170 aa7.01□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 RAB7AP51149 207 aa7.01□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 KRTDAPP60985 99 aa7.01□□□□□ -1.29
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GINS1-201ENST00000262460 RTL8BQ17RB0 113 aa7.01□□□□□ -1.29
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GINS1-201ENST00000262460 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 ZNF600Q6ZNG1 722 aa7.01□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 OR1B1Q8NGR6 318 aa7.01□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 DYNLRB1Q9NP97 96 aa7.01□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa7□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 A8MWP6 167 aa7□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 PRCDQ00LT1 54 aa7□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 PATE2Q6UY27 113 aa7□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 Q8NA96 180 aa7□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 CMTM2Q8TAZ6 248 aa7□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 ZNF714Q96N38 554 aa7□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 V9GYV3 84 aa7□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 FLNCQ14315 2725 aa7□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP7□□□□□ -1.299e-8■■■■□ 19.5
GINS1-201ENST00000262460 ISLRO14498 428 aa7□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 TNFSF4P23510 183 aa7□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 SRP14P37108 136 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 MFAP2P55001 183 aa7□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 RPL8P62917 257 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 RAB31Q13636 194 aa7□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 TMEM108Q6UXF1 575 aa7□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 TCF24Q7RTU0 167 aa7□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 PNKDQ8N490 385 aa7□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 TMEM18Q96B42 140 aa7□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 SAMD10Q9BYL1 202 aa7□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 WNT10AQ9GZT5 417 aa7□□□□□ -1.29
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GINS1-201ENST00000262460 TNXAQ16473 311 aa6.99□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 LCN12Q6JVE5 192 aa6.99□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 TRAT1Q6PIZ9 186 aa6.99□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 SLC25A33Q9BSK2 321 aa6.99□□□□□ -1.29
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GINS1-201ENST00000262460 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa6.99□□□□□ -1.29
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GINS1-201ENST00000262460 MUC21Q5SSG8 566 aa6.99□□□□□ -1.29
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GINS1-201ENST00000262460 MPDU1O75352 247 aa6.98□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 IGHV3-23P01764 117 aa6.98□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 SRIP30626 198 aa6.98□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 ZNF137PP52743 207 aa6.98□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 CD69Q07108 199 aa6.98□□□□□ -1.29
GINS1-201ENST00000262460 TMEM95Q3KNT9 176 aa6.98□□□□□ -1.29
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