RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243082.4

HOXC11-201, Transcript of homeobox C11, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC11, Length 2,039 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11-201ENST00000243082 SMUG1Q53HV7 270 aa14.73□□□□□ -0.05
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HOXC11-201ENST00000243082 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
HOXC11-201ENST00000243082 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa14.73□□□□□ -0.05
HOXC11-201ENST00000243082 RNF224P0DH78 156 aa14.73□□□□□ -0.05
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HOXC11-201ENST00000243082 UHRF2Q96PU4 802 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC11-201ENST00000243082 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
HOXC11-201ENST00000243082 BPIFB3P59826 476 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC11-201ENST00000243082 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXC11-201ENST00000243082 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
HOXC11-201ENST00000243082 OR5T1Q8NG75 326 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-201ENST00000243082 OR5AU1Q8NGC0 362 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXC11-201ENST00000243082 SPOCK3Q9BQ16 436 aa14.65□□□□□ -0.06
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