RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 LalbaP29752 143 aa10.71□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mcpt8P43430 247 aa10.71□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pramel5Q7TPY4 500 aa10.71□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr132Q7TRI8 313 aa10.71□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dirc2Q8BFQ6 478 aa10.71□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp3Q8BLB0 497 aa10.71□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Foxn4Q8K3Q3 521 aa10.71□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lmntd1Q9D4C1 413 aa10.71□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Golt1aQ9DCQ3 133 aa10.71□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm28285A0A087WQ54 102 aa10.7□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm5890A0A140LI04 305 aa10.7□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rpl23a-ps3A0A140T8M7 156 aa10.7□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn1r180B9EK86 305 aa10.7□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr62L7MU75 315 aa10.7□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hist1h2bmP10854 126 aa10.7□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cxcl1P12850 96 aa10.7□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cdx1P18111 268 aa10.7□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CamlgP49070 294 aa10.7□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rpl23aP62751 156 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 S100a3P62818 101 aa10.7□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm5127Q3UQH6 212 aa10.7□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tob1Q61471 362 aa10.7□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hist1h2bhQ64478 126 aa10.7□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hist2h2bbQ64525 126 aa10.7□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hist1h2bcQ6ZWY9 126 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rtn4rl2Q7M6Z0 420 aa10.7□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pla2g16Q8R3U1 162 aa10.7□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q8VCE4 163 aa10.7□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q9CRC3 126 aa10.7□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 RprmQ9JJ72 109 aa10.7□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm4950D3YUM8 205 aa10.7□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr555E9Q547 315 aa10.7□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr178E9Q9T3 319 aa10.7□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn1r204I7HIK1 302 aa10.7□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Phlda2O08969 144 aa10.7□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fgf8P37237 268 aa10.7□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Npbwr1P49681 329 aa10.7□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q3UUX7 111 aa10.7□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc34a1Q60825 637 aa10.7□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AgaQ64191 346 aa10.7□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 LgalslbQ7TPX9 165 aa10.7□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kazald1Q8BJ66 313 aa10.7□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mib2Q8R516 973 aa10.7□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1420Q8VF55 309 aa10.7□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1030Q8VFL5 318 aa10.7□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 3100002H09RikQ9CXW6 140 aa10.7□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CstadQ9D245 104 aa10.7□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q9DAL9 119 aa10.7□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fbln5Q9WVH9 448 aa10.7□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1124A2AT86 318 aa10.69□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SiglechB7ZMQ6 332 aa10.69□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm20815J3KMI0 227 aa10.69□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm20914J3QME2 227 aa10.69□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr893K7N678 312 aa10.69□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm10665K7N6B7 321 aa10.69□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trav6-2Q5R1I4 113 aa10.69□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ifna15Q61718 190 aa10.69□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Klk1b24Q61754 263 aa10.69□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Oxgr1Q6IYF8 337 aa10.69□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 G6pc3Q6NSQ9 346 aa10.69□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm21292Q78EE2 227 aa10.69□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q8CDS7 251 aa10.69□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr113Q8VEU4 312 aa10.69□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1298Q8VGE6 312 aa10.69□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr354Q8VGJ8 317 aa10.69□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hspb9Q9DAM3 168 aa10.69□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sptan1P16546 2472 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1220F7BL62 311 aa10.69□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm21789J3QMZ1 123 aa10.69□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm21870J3QPN2 123 aa10.69□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm21883J3QPV3 123 aa10.69□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Foxh1O88621 401 aa10.69□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PtcraP0C6B2 199 aa10.69□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rab11aP62492 216 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr94Q6UAH0 386 aa10.69□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 BC049762Q8C601 163 aa10.69□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Alkbh6Q8K2U2 238 aa10.69□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Angptl6Q8R0Z6 457 aa10.69□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 FuomQ8R2K1 153 aa10.69□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 S1pr5Q91X56 400 aa10.69□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp958Q99LG7 467 aa10.69□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hdhd3Q9CYW4 251 aa10.69□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Syt7Q9R0N7 403 aa10.69□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pkd1l2Q7TN88 2461 aa10.69□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm35060A0A140LIV7 231 aa10.68□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr102B2RT33 308 aa10.68□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 AsmtD3KU66 387 aa10.68□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm10638F6QEG2 257 aa10.68□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tpsb2P21845 276 aa10.68□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CryzP47199 331 aa10.68□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 C1ql4Q4ZJM9 238 aa10.68□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rab9bQ8BHH2 201 aa10.68□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rbpms2Q8VC52 206 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr1260Q8VGN9 310 aa10.68□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr181Q8VGQ7 317 aa10.68□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr101Q920Z0 308 aa10.68□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mrpl21Q9D1N9 209 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm29049A0A087WSM5 227 aa10.68□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Igkv14-100A0A0G2JG36 117 aa10.68□□□□□ -0.7
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 4931429L15RikE9PVU2 379 aa10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 250.9 ms