RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640072.1

NECAP1-222, Transcript of NECAP endocytosis associated 1, human

TSL 5

Gene NECAP1, Length 3,456 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NECAP1-222	ENST00000640072	GCSH	P23434	173 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	OR1L3	Q8NH93	324 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	PFN4	Q8NHR9	129 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	DYSF	O75923	2080 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	KIAA1549	Q9HCM3	1950 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072		A1L4Q6	167 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	DHRS3	O75911	302 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	HLA-DRB1	P01911	266 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	PFN2	P35080	140 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	CSN1S1	P47710	185 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	TAS2R45	P59539	299 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	FXYD4	P59646	89 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF141	Q15928	474 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF114	Q8NC26	417 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF721	Q8TF20	911 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	PRELID3A	Q96N28	172 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	TMEM147	Q9BVK8	224 aa		5.08	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	F11R	Q9Y624	299 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	TEX50	A0A1B0GTY4	177 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	IL9	P15248	144 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	TMEM64	Q6YI46	380 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	BAD	Q92934	168 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	SMIM14	Q96QK8	99 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	NMNAT3	Q96T66	252 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	BCL2L10	Q9HD36	194 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	PILRA	Q9UKJ1	303 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	LTBP1	Q14766	1721 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	TMEM262	E9PQX1	116 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	TMEM178B	H3BS89	294 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072		H7C1H1	209 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	BCL3	P20749	454 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	DRD3	P35462	400 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	OR4X2	Q8NGF9	303 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF501	Q96CX3	271 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	NAA60	Q9H7X0	242 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	KIAA2026	Q5HYC2	2103 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	TRAV9-1	A0A075B6T8	112 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	FAM240A	A0A1B0GVK7	77 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	C11orf94	C9JXX5	98 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	ZIC3	O60481	467 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	APCS	P02743	223 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	DLX1	P56177	255 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	ACP7	Q6ZNF0	438 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	OR10J6P	Q8NGY7	276 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	BRK1	Q8WUW1	75 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	SLC25A22	Q9H936	323 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		5.07	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	VWC2L	B2RUY7	222 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072		H3BMG7	143 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072		H3BP45	60 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	CHEK1	O14757	476 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	NDUFB2	O95178	105 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	LEPROTL1	O95214	131 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	IGHV3-7	P01780	117 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	SRD5A1	P18405	259 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	EMD	P50402	254 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	ZNF134	P52741	427 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	LY6K	Q17RY6	165 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	KCTD18	Q6PI47	426 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	RASL10A	Q92737	203 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	C9orf85	Q96MD7	179 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	SPACA5	Q96QH8	159 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	LINC01587	Q99440	93 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	PRSS22	Q9GZN4	317 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	C21orf62	Q9NYP8	219 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	IL36B	Q9NZH7	164 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	TAAR2	Q9P1P5	351 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	MYLK	Q15746	1914 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	OOSP1	A8MZH6	123 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	HLA-DQA1	P01909	254 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	INSL3	P51460	131 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	NCBP2	P52298	156 aa	Known RBP eCLIP	5.06	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	UNC119	Q13432	240 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	ZCCHC24	Q8N2G6	241 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	WDR83OS	Q9Y284	106 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	TRPM6	Q9BX84	2022 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	LOC105378220	A0A1B0GUY1	285 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072		J3QQQ9	107 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	DPM2	O94777	84 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	LGALS1	P09382	135 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	SCT	P09683	121 aa		5.06	□□□□□ -1.6
NECAP1-222	ENST00000640072	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6

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