RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638603.1

SCARB2-211, Transcript of scavenger receptor class B member 2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SCARB2, Length 4,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2-211ENST00000638603 TMEM14BQ9NUH8 114 aa6.7□□□□□ -1.34
SCARB2-211ENST00000638603 SLC25A15Q9Y619 301 aa6.7□□□□□ -1.34
SCARB2-211ENST00000638603 CEP295Q9C0D2 2601 aa6.7□□□□□ -1.34
SCARB2-211ENST00000638603 hADV38S2A0JD32 116 aa6.7□□□□□ -1.34
SCARB2-211ENST00000638603 C8orf88P0DMB2 117 aa6.7□□□□□ -1.34
SCARB2-211ENST00000638603 APELAP0DMC3 54 aa6.7□□□□□ -1.34
SCARB2-211ENST00000638603 GLRXP35754 106 aa6.7□□□□□ -1.34
SCARB2-211ENST00000638603 BLNKQ8WV28 456 aa6.7□□□□□ -1.34
SCARB2-211ENST00000638603 UPK2O00526 184 aa6.7□□□□□ -1.34
SCARB2-211ENST00000638603 MMP23AO75900 390 aa6.7□□□□□ -1.34
SCARB2-211ENST00000638603 IGLV1-44P01699 117 aa6.7□□□□□ -1.34
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SCARB2-211ENST00000638603 PRR31Q5SQ13 230 aa6.7□□□□□ -1.34
SCARB2-211ENST00000638603 ATOH7Q8N100 152 aa6.7□□□□□ -1.34
SCARB2-211ENST00000638603 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SCARB2-211ENST00000638603 LINC00479Q96M42 142 aa6.7□□□□□ -1.34
SCARB2-211ENST00000638603 PRO3102Q9H379 93 aa6.7□□□□□ -1.34
SCARB2-211ENST00000638603 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa6.7□□□□□ -1.34
SCARB2-211ENST00000638603 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa6.7□□□□□ -1.34
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SCARB2-211ENST00000638603 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.7□□□□□ -1.34
SCARB2-211ENST00000638603 SFXN3Q9BWM7 321 aa6.7□□□□□ -1.34
SCARB2-211ENST00000638603 WNT10AQ9GZT5 417 aa6.7□□□□□ -1.34
SCARB2-211ENST00000638603 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa6.7□□□□□ -1.34
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SCARB2-211ENST00000638603 V9GYV3 84 aa6.7□□□□□ -1.34
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SCARB2-211ENST00000638603 M0QZK8 103 aa6.69□□□□□ -1.34
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SCARB2-211ENST00000638603 NRN1Q9NPD7 142 aa6.69□□□□□ -1.34
SCARB2-211ENST00000638603 SSUH2Q9Y2M2 353 aa6.69□□□□□ -1.34
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SCARB2-211ENST00000638603 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SCARB2-211ENST00000638603 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SCARB2-211ENST00000638603 PLXNB1O43157 2135 aa6.69□□□□□ -1.34
SCARB2-211ENST00000638603 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa6.69□□□□□ -1.34
SCARB2-211ENST00000638603 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa6.69□□□□□ -1.34
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SCARB2-211ENST00000638603 C10orf113Q5VZT2 155 aa6.69□□□□□ -1.34
SCARB2-211ENST00000638603 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa6.69□□□□□ -1.34
SCARB2-211ENST00000638603 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
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SCARB2-211ENST00000638603 CCL17Q92583 94 aa6.69□□□□□ -1.34
SCARB2-211ENST00000638603 NPIPB3Q92617 1050 aa6.69□□□□□ -1.34
SCARB2-211ENST00000638603 NEUROG1Q92886 237 aa6.69□□□□□ -1.34
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SCARB2-211ENST00000638603 C1orf159Q96HA4 380 aa6.69□□□□□ -1.34
SCARB2-211ENST00000638603 PAXXQ9BUH6 204 aa6.69□□□□□ -1.34
SCARB2-211ENST00000638603 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
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SCARB2-211ENST00000638603 AMY1AP04745 511 aa6.68□□□□□ -1.34
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SCARB2-211ENST00000638603 CHODLQ9H9P2 273 aa6.68□□□□□ -1.34
SCARB2-211ENST00000638603 FBXL7Q9UJT9 491 aa6.68□□□□□ -1.34
SCARB2-211ENST00000638603 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa6.68□□□□□ -1.34
SCARB2-211ENST00000638603 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa6.68□□□□□ -1.34
SCARB2-211ENST00000638603 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa6.68□□□□□ -1.34
SCARB2-211ENST00000638603 HLA-DQA1P01909 254 aa6.68□□□□□ -1.34
SCARB2-211ENST00000638603 TFPI2P48307 235 aa6.68□□□□□ -1.34
SCARB2-211ENST00000638603 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
SCARB2-211ENST00000638603 BPIFB3P59826 476 aa6.68□□□□□ -1.34
SCARB2-211ENST00000638603 CX3CL1P78423 397 aa6.68□□□□□ -1.34
SCARB2-211ENST00000638603 C10orf55Q5SWW7 151 aa6.68□□□□□ -1.34
SCARB2-211ENST00000638603 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa6.68□□□□□ -1.34
SCARB2-211ENST00000638603 KIR2DL5AQ8N109 375 aa6.68□□□□□ -1.34
SCARB2-211ENST00000638603 C11orf52Q96A22 123 aa6.68□□□□□ -1.34
SCARB2-211ENST00000638603 NBASA2RRP1 2371 aa6.68□□□□□ -1.34
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