RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626874.2

CHD2-208, Transcript of chromodomain helicase DNA binding protein 2, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene CHD2, Length 7,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHD2-208	ENST00000626874	NEUROG3	Q9Y4Z2	214 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	LGALS1	P09382	135 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	TBR1	Q16650	682 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	WNT10A	Q9GZT5	417 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	LRRK1	Q38SD2	2015 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	GCHFR	P30047	84 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	DRAM1	Q8N682	238 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	GPR146	Q96CH1	333 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	SPSB2	Q99619	263 aa		5.83	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	OR1P1	Q8NH06	330 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	LHFPL6	Q9Y693	200 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	OR9G9	P0C7N8	305 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	CRYBB3	P26998	211 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	RND3	P61587	244 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	FAM27E3	Q08E93	113 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	PARL	Q9H300	379 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	TNFRSF12A	Q9NP84	129 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	KLK13	Q9UKR3	277 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	MSGN1	A6NI15	193 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	GLIPR1	P48060	266 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	RHOG	P84095	191 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	SRSF4	Q08170	494 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	CENPW	Q5EE01	88 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	MSRB3	Q8IXL7	192 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	PRR32	B1ATL7	298 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	TMEM50A	O95807	157 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	SRSF6	Q13247	344 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	FAM90A2P	Q658T7	463 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	RASL11A	Q6T310	242 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	CRIM1	Q9NZV1	1036 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	CELA2A	P08217	269 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		5.82	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	TMEM238	C9JI98	176 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	TOMM40	O96008	361 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	PAX2	Q02962	417 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	ALPK2	Q86TB3	2170 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874		J3QLI3	93 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	CT83	Q5H943	113 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	PSPN	O60542	156 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	CD28	P10747	220 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	SRI	P30626	198 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	SRSF8	Q9BRL6	282 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	IGLV1-36	A0A0B4J1U3	117 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	ERVH48-1	M5A8F1	160 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	OR4D11	Q8NGI4	311 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	GREB1	Q4ZG55	1949 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	ARID2	Q68CP9	1835 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	PSG1	P11464	419 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	IGLV3-21	P80748	117 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	RASL10A	Q92737	203 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	RNF125	Q96EQ8	232 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	ATRX	P46100	2492 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	NCOR1	O75376	2440 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	ZG16	O60844	167 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	SLA	Q13239	276 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	PRO1933	Q9H354	126 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874		A0A1W2PR77	199 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	IGKV1D-16	P01601	117 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	ATXN8	Q156A1	80 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	LINC00477	Q96M19	166 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	SMPX	Q9UHP9	88 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	LIMS1	P48059	325 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	ZNF585B	Q52M93	769 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	RCHY1	Q96PM5	261 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874		Q9H3A6	140 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	LINC00158	P58513	81 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	CACNA1E	Q15878	2313 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874		A0A1B0GTL3	188 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	LHB	P01229	141 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	TMEM144	Q7Z5S9	345 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		5.8	□□□□□ -1.48
CHD2-208	ENST00000626874		A0A1B0GTI1	187 aa		5.8	□□□□□ -1.48

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