RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626061.2

SNAP23-222, Transcript of synaptosome associated protein 23, human

TSL 5 BASIC

Gene SNAP23, Length 237 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAP23-222	ENST00000626061	TCP1	P17987	556 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	TIRAP	P58753	221 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	NHLH2	Q02577	135 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	MAJIN	Q3KP22	176 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	SSX6	Q7RTT6	188 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	ADGRG5	Q8IZF4	528 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	STPG4	Q8N801	248 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	COQ8A	Q8NI60	647 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	METTL26	Q96S19	204 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	NMNAT2	Q9BZQ4	307 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	RIBC2	Q9H4K1	309 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	VAPA	Q9P0L0	249 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	TMEM235	A6NFC5	223 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061		F6UB75	175 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	ITGB1BP1	O14713	200 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	FFAR1	O14842	300 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	IGHV3-53	P01767	116 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	PRSS1	P07477	247 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	POLR2J	P52435	117 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF85	Q03923	595 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	TPBG	Q13641	420 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	ANKRD19P	Q9H560	264 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	ISG20L2	Q9H9L3	353 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	LRRC42	Q9Y546	428 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		3.55	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061		A0A1B0GVG6	124 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061		B5MCH6	92 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	USP17L23	D6RBM5	183 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061		H0Y9J4	135 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	GEMIN2	O14893	280 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF254	O75437	659 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	GAST	P01350	101 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	AMTN	Q6UX39	209 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	UTS2B	Q765I0	119 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	GPR141	Q7Z602	305 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	CCDC28A	Q8IWP9	274 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF679	Q8IYX0	411 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	TMEM203	Q969S6	136 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	NSL1	Q96IY1	281 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	THTPA	Q9BU02	230 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	ADI1	Q9BV57	179 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	C11orf54	Q9H0W9	315 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	OR51E2	Q9H255	320 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061		R4GMQ9	66 aa		3.54	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	IGLV8-61	A0A075B6I0	122 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061		A0A0J9YX75	114 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061		K7EIM0	57 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	KBTBD11	O94819	623 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	IFNA7	P01567	189 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	ORM1	P02763	201 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	MT2A	P02795	61 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	ALOX5AP	P20292	161 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	SPRR2D	P22532	72 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	CRYBB3	P26998	211 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	GCA	P28676	217 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	MPV17L	Q2QL34	196 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	HSD17B13	Q7Z5P4	300 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	GAPT	Q8N292	157 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	OTULIN	Q96BN8	352 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	MOB3A	Q96BX8	217 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	TPD52L3	Q96J77	140 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	C2orf50	Q96LR7	162 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	TTTY10	Q9BZA0	68 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	NINJ2	Q9NZG7	142 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	FUT9	Q9Y231	359 aa		3.53	□□□□□ -1.84
SNAP23-222	ENST00000626061	IGLC7	A0M8Q6	106 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SNAP23-222	ENST00000626061	DIRC3	C9JPN6	131 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SNAP23-222	ENST00000626061	RAB27B	O00194	218 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SNAP23-222	ENST00000626061	GNG7	O60262	68 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SNAP23-222	ENST00000626061	CA11	O75493	328 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SNAP23-222	ENST00000626061	ABHD2	P08910	425 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SNAP23-222	ENST00000626061	IDO1	P14902	403 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SNAP23-222	ENST00000626061	ID1	P41134	155 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SNAP23-222	ENST00000626061	MFAP4	P55083	255 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SNAP23-222	ENST00000626061	RAP2B	P61225	183 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SNAP23-222	ENST00000626061	CAV1	Q03135	178 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SNAP23-222	ENST00000626061	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	3.52	□□□□□ -1.85
SNAP23-222	ENST00000626061	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
SNAP23-222	ENST00000626061	ARFRP1	Q13795	201 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SNAP23-222	ENST00000626061	SP6	Q3SY56	376 aa		3.52	□□□□□ -1.85
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	3.52	□□□□□ -1.85
SNAP23-222	ENST00000626061	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
SNAP23-222	ENST00000626061	ZNF436-AS1	Q8NC38	126 aa	Predicted RBP	3.52	□□□□□ -1.85

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