RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000625672.2

NRXN1-222, Transcript of neurexin 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene NRXN1, Length 8,113 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NRXN1-222	ENST00000625672	INS	P01308	110 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NRXN1-222	ENST00000625672	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	11.66	□□□□□ -0.54
NRXN1-222	ENST00000625672	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NRXN1-222	ENST00000625672	PLA2G10	O15496	165 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NRXN1-222	ENST00000625672	HBD	P02042	147 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NRXN1-222	ENST00000625672	CCL3L1	P16619	93 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NRXN1-222	ENST00000625672	TFF3	Q07654	80 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NRXN1-222	ENST00000625672	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	11.66	□□□□□ -0.54
NRXN1-222	ENST00000625672	ZNF250	P15622	560 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NRXN1-222	ENST00000625672	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NRXN1-222	ENST00000625672	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NRXN1-222	ENST00000625672	DOCK7	Q96N67	2140 aa		11.66	□□□□□ -0.54
NRXN1-222	ENST00000625672	C12orf77	C9JDV5	145 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NRXN1-222	ENST00000625672	UMOD	P07911	640 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NRXN1-222	ENST00000625672	PAX8	Q06710	450 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NRXN1-222	ENST00000625672	C2orf68	Q2NKX9	166 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NRXN1-222	ENST00000625672	SFTA2	Q6UW10	78 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NRXN1-222	ENST00000625672	DTX1	Q86Y01	620 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NRXN1-222	ENST00000625672	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NRXN1-222	ENST00000625672	SIGLEC5	O15389	551 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NRXN1-222	ENST00000625672	IGHM	P01871	453 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NRXN1-222	ENST00000625672	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NRXN1-222	ENST00000625672	ZNF257	Q9Y2Q1	563 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NRXN1-222	ENST00000625672	SCO2	A0A1W2PP80	73 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NRXN1-222	ENST00000625672	ZNF883	P0CG24	379 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NRXN1-222	ENST00000625672	LINC00614	P0C842	121 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NRXN1-222	ENST00000625672	POC1A	Q8NBT0	407 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NRXN1-222	ENST00000625672		A0A0G2JMM0	328 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NRXN1-222	ENST00000625672		A0A1W2PPB8	328 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NRXN1-222	ENST00000625672		A0A1W2PRS3	328 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NRXN1-222	ENST00000625672	KIR3DP1	A8MWS1	328 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NRXN1-222	ENST00000625672	SLC17A3	O00476	420 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NRXN1-222	ENST00000625672	ST6GALNAC3	Q8NDV1	305 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NRXN1-222	ENST00000625672	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		11.65	□□□□□ -0.54
NRXN1-222	ENST00000625672	LRP5	O75197	1615 aa		11.65	□□□□□ -0.55
NRXN1-222	ENST00000625672	LAMB2	P55268	1798 aa		11.65	□□□□□ -0.55
NRXN1-222	ENST00000625672	SRSF6	Q13247	344 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.55
NRXN1-222	ENST00000625672	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		11.65	□□□□□ -0.55
NRXN1-222	ENST00000625672	MBD3L2B	A0A1B0GVZ6	204 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
NRXN1-222	ENST00000625672	EVI2A	P22794	236 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NRXN1-222	ENST00000625672	NPC2	P61916	151 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NRXN1-222	ENST00000625672	TMEM219	Q86XT9	240 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NRXN1-222	ENST00000625672	GDF15	Q99988	308 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NRXN1-222	ENST00000625672	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NRXN1-222	ENST00000625672	C17orf98	A8MV24	154 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NRXN1-222	ENST00000625672	CGB3	P0DN86	165 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NRXN1-222	ENST00000625672	MRPS18A	Q9NVS2	196 aa	Known RBP	11.64	□□□□□ -0.55
NRXN1-222	ENST00000625672	TP53BP1	Q12888	1972 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
NRXN1-222	ENST00000625672	FAM186A	A6NE01	2351 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NRXN1-222	ENST00000625672		Q6AWC8	147 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NRXN1-222	ENST00000625672	RCHY1	Q96PM5	261 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NRXN1-222	ENST00000625672	CA1	P00915	261 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
NRXN1-222	ENST00000625672	UCP3	P55916	312 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NRXN1-222	ENST00000625672	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NRXN1-222	ENST00000625672	CD300C	Q08708	224 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NRXN1-222	ENST00000625672	IRF3	Q14653	427 aa		11.64	□□□□□ -0.55
NRXN1-222	ENST00000625672	HLA-DQB1	P01920	261 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NRXN1-222	ENST00000625672	PLN	P26678	52 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NRXN1-222	ENST00000625672	C14orf144	Q96I85	54 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NRXN1-222	ENST00000625672	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NRXN1-222	ENST00000625672	IGHV3-53	P01767	116 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NRXN1-222	ENST00000625672	FXYD7	P58549	80 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NRXN1-222	ENST00000625672	EREG	O14944	169 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NRXN1-222	ENST00000625672	GATA2	P23769	480 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
NRXN1-222	ENST00000625672	ZCCHC24	Q8N2G6	241 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
NRXN1-222	ENST00000625672	GGACT	Q9BVM4	153 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NRXN1-222	ENST00000625672	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NRXN1-222	ENST00000625672	OTOR	Q9NRC9	128 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NRXN1-222	ENST00000625672		A0A1B0GW15	77 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NRXN1-222	ENST00000625672	SRSF1	Q07955	248 aa	Known RBP eCLIP	11.63	□□□□□ -0.55
NRXN1-222	ENST00000625672	C1orf100	Q5SVJ3	147 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NRXN1-222	ENST00000625672	CHCHD2	Q9Y6H1	151 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
NRXN1-222	ENST00000625672	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
NRXN1-222	ENST00000625672	PSG7	Q13046	419 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NRXN1-222	ENST00000625672	CYSLTR1	Q9Y271	337 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NRXN1-222	ENST00000625672	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		11.63	□□□□□ -0.55
NRXN1-222	ENST00000625672	TOMM40	O96008	361 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NRXN1-222	ENST00000625672	COQ2	Q96H96	371 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NRXN1-222	ENST00000625672	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NRXN1-222	ENST00000625672	IL36B	Q9NZH7	164 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NRXN1-222	ENST00000625672	GNG5	P63218	68 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NRXN1-222	ENST00000625672	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NRXN1-222	ENST00000625672	SCN4A	P35499	1836 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NRXN1-222	ENST00000625672	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NRXN1-222	ENST00000625672	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NRXN1-222	ENST00000625672	PAX4	O43316	350 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NRXN1-222	ENST00000625672	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
NRXN1-222	ENST00000625672	HIGD1C	A8MV81	97 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NRXN1-222	ENST00000625672	GNLY	P22749	145 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NRXN1-222	ENST00000625672	KLHL30-AS1	Q8NEE0	82 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NRXN1-222	ENST00000625672	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NRXN1-222	ENST00000625672	RNF125	Q96EQ8	232 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NRXN1-222	ENST00000625672	SPCS1	Q9Y6A9	102 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NRXN1-222	ENST00000625672	VENTX	O95231	258 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NRXN1-222	ENST00000625672	CGB7	P0DN87	165 aa		11.62	□□□□□ -0.55
NRXN1-222	ENST00000625672	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
NRXN1-222	ENST00000625672	ZNF600	Q6ZNG1	722 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NRXN1-222	ENST00000625672	CXorf65	A6NEN9	183 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NRXN1-222	ENST00000625672	SPTA1	P02549	2419 aa		11.61	□□□□□ -0.55
NRXN1-222	ENST00000625672	GCM2	O75603	506 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55

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