RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602319.1

HCG18-242, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

BASIC

Gene HCG18, Length 3,342 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-242ENST00000602319 DEFB108AA8MXU0 73 aa8.06□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 OR7C2O60412 319 aa8.06□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 GRPP07492 148 aa8.06□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 C2orf91Q6ZV80 131 aa8.06□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 SPEM1Q8N4L4 309 aa8.06□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 TTTY12Q9BZ98 90 aa8.06□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 TP73-AS1Q9UF72 201 aa8.06□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 MUC21A0A140T8X8 626 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 OR5AL1P0C617 328 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 MFAP2P55001 183 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 SRYQ05066 204 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 SMIM21Q3B7S5 101 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 MUC21Q5SSG8 566 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 DPF1Q92782 380 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 PMCHL2Q9BQD1 86 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 CLEC5AQ9NY25 188 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 B4GALT7Q9UBV7 327 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 KNL1Q8NG31 2342 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 ACTL6BO94805 426 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 TFF1P04155 84 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 PSG9Q00887 426 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 RNF151Q2KHN1 245 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 C16orf54Q6UWD8 224 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 ZNF826PQ6ZT77 177 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 MLST8Q9BVC4 326 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 GFRA4Q9GZZ7 299 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 ZNF492Q9P255 531 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 DUSP13Q9UII6 198 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 R4GN57 208 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 DSCAML1Q8TD84 2053 aa8.05□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 PEX7O00628 323 aa8.04□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 MGST1P10620 155 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 GATA2P23769 480 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 LINC01545Q5VT33 79 aa8.04□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 NDFIP1Q9BT67 221 aa8.04□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 DCTN5Q9BTE1 182 aa8.04□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 ARF6P62330 175 aa8.04□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa8.04□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 SPINK14Q6IE38 97 aa8.04□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa8.04□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 PRNDQ9UKY0 176 aa8.04□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 OR51B2Q9Y5P1 312 aa8.04□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 C19orf71A6NCJ1 209 aa8.04□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 NUDT3O95989 172 aa8.04□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 MAGEA5P43359 124 aa8.04□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 HBBP68871 147 aa8.04□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 MORN5Q5VZ52 161 aa8.04□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 TPRX1Q8N7U7 411 aa8.04□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 hDV102S1A0JD36 115 aa8.03□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 HIGD1CA8MV81 97 aa8.03□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 NPIPB6E9PJ23 425 aa8.03□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 NBEAP1P0C6P0 100 aa8.03□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 LINC00173Q6ZV60 143 aa8.03□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 SSX8Q7RTT4 187 aa8.03□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 TMEM251Q8N6I4 163 aa8.03□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 RFESDQ8TAC1 157 aa8.03□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 TMEM191AQ9H0A3 160 aa8.03□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 PLEKHA3Q9HB20 300 aa8.03□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 SERTAD4Q9NUC0 356 aa8.03□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 WASHC3Q9Y3C0 194 aa8.03□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 TANC2Q9HCD6 1990 aa8.03□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 DYSFO75923 2080 aa8.03□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa8.03□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 UPK2O00526 184 aa8.03□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 APOHP02749 345 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 COX8AP10176 69 aa8.03□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 CFHR2P36980 270 aa8.03□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 CD69Q07108 199 aa8.03□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 FXYD5Q96DB9 178 aa8.03□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 ADTRPQ96IZ2 230 aa8.03□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 DOCK10Q96BY6 2186 aa8.03□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa8.03□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 GAGE12BA1L429 117 aa8.03□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 FAM231BA6NCW3 169 aa8.03□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 K7ERU9 68 aa8.03□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 FGF6P10767 208 aa8.03□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 SEC11AP67812 179 aa8.03□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 C17orf58Q2M2W7 97 aa8.03□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 CACNG8Q8WXS5 425 aa8.03□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 LINC00479Q96M42 142 aa8.03□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 LINC00574Q9H8X3 128 aa8.03□□□□□ -1.12
HCG18-242ENST00000602319 ENY2Q9NPA8 101 aa8.03□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms