RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589706.1

SMAD4-208, Transcript of SMAD family member 4, human

TSL 3

Gene SMAD4, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SMAD4-208	ENST00000589706	RAB9B	Q9NP90	201 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	CTNNBIP1	Q9NSA3	81 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	MTCH1	Q9NZJ7	389 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	THYN1	Q9P016	225 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	GNG13	Q9P2W3	67 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	WASHC3	Q9Y3C0	194 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	LSM5	Q9Y4Y9	91 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	ANKRD12	Q6UB98	2062 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	FER1L5	A0AVI2	2057 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	LRP4	O75096	1905 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	IGHV1OR21-1	A0A087WYE8	117 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	PIGBOS1	A0A0B4J2F0	54 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	TRBV5-4	A0A0C4DH59	114 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	LOC102725191	A0A1B0GVB3	256 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	C7orf71	A4D174	169 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	CD300LB	A8K4G0	201 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	TMEM150C	B9EJG8	249 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	PRSS46	E5RG02	174 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706		F8W1H4	67 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	CNIH1	O95406	144 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	EPPIN	O95925	133 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	SERPINE2	P07093	398 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	CD55	P08174	381 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	C3orf79	P0CE67	100 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	PRSS56	P0CW18	603 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	ZNF728	P0DKX0	622 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	CRYBB3	P26998	211 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	OTX2	P32243	289 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	HRH1	P35367	487 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	DNASE1L1	P49184	302 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	FXYD6P3	P58550	94 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	EWSR1	Q01844	656 aa	Known RBP eCLIP	4.74	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	KIR2DS3	Q14952	304 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	ZNF74	Q16587	644 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	LCE3B	Q5TA77	95 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	ASCL4	Q6XD76	172 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	RFLNA	Q6ZTI6	216 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	ERAS	Q7Z444	233 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	C17orf82	Q86X59	251 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	LRRC75A	Q8NAA5	344 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	ZFP62	Q8NB50	900 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	CCL4L1	Q8NHW4	92 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	OR5P3	Q8WZ94	311 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	RERG	Q96A58	199 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	C17orf77	Q96MU5	243 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	GPER1	Q99527	375 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	MCHR1	Q99705	422 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	EFCAB11	Q9BUY7	163 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	RSPO3	Q9BXY4	272 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	TMEM126A	Q9H061	195 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	PELI2	Q9HAT8	420 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	NAT8B	Q9UHF3	227 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	TMEM14A	Q9Y6G1	99 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	IGLV3-10	A0A075B6K4	115 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	CPSF4L	A6NMK7	179 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706		F8WDY8	70 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	CDC42EP2	O14613	210 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	SYNGR3	O43761	229 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	UPK3A	O75631	287 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	IGHG3	P01860	377 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	GYPA	P02724	150 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	HPN	P05981	417 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	ZNF17	P17021	662 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	PGC	P20142	388 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	ID1	P41134	155 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	CA7	P43166	264 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	PSMB3	P49720	205 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	FUT6	P51993	359 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	GRB2	P62993	217 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	SERF2	P84101	59 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	LCN15	Q6UWW0	184 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706		Q6ZS92	163 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	OR4C3	Q8NH37	302 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	OR51E1	Q8TCB6	317 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	CT55	Q8WUE5	264 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	PP6455	Q8WZ26	134 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	NRGN	Q92686	78 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	NEUROG1	Q92886	237 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	SPIN2A	Q99865	258 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	WFDC6	Q9BQY6	131 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	TIMM29	Q9BSF4	260 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	APOO	Q9BUR5	198 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SMAD4-208	ENST00000589706	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		4.73	□□□□□ -1.65

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