RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 ETFRF1Q6IPR1 90 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-206ENST00000588815 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-206ENST00000588815 SCARB1Q8WTV0 552 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-206ENST00000588815 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-206ENST00000588815 FBXO7Q9Y3I1 522 aa24.49■■□□□ 1.51
CAPNS1-206ENST00000588815 SONP18583 2426 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-206ENST00000588815 ATP6V0E1O15342 81 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-206ENST00000588815 FBXO24O75426 580 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-206ENST00000588815 APELAP0DMC3 54 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-206ENST00000588815 ASPHD1Q5U4P2 390 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-206ENST00000588815 LFNGQ8NES3 379 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-206ENST00000588815 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-206ENST00000588815 WNT10AQ9GZT5 417 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-206ENST00000588815 NPVFQ9HCQ7 196 aa24.48■■□□□ 1.51
CAPNS1-206ENST00000588815 SEC11BP0C7V7 166 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-206ENST00000588815 DEFA4P12838 97 aa24.47■■□□□ 1.51
CAPNS1-206ENST00000588815 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-206ENST00000588815 MPDU1O75352 247 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF580Q9UK33 172 aa24.46■■□□□ 1.51
CAPNS1-206ENST00000588815 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa24.45■■□□□ 1.51
CAPNS1-206ENST00000588815 IGF1P05019 195 aa24.45■■□□□ 1.51
CAPNS1-206ENST00000588815 SPP1P10451 314 aa24.45■■□□□ 1.51
CAPNS1-206ENST00000588815 MDKP21741 143 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.51
CAPNS1-206ENST00000588815 ALKAL2Q6UX46 152 aa24.45■■□□□ 1.51
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC35E3Q7Z769 313 aa24.45■■□□□ 1.51
CAPNS1-206ENST00000588815 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa24.45■■□□□ 1.51
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP24.45■■□□□ 1.51
CAPNS1-206ENST00000588815 WDR83OSQ9Y284 106 aa24.45■■□□□ 1.51
CAPNS1-206ENST00000588815 MXRA5Q9NR99 2828 aa24.45■■□□□ 1.51
CAPNS1-206ENST00000588815 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-206ENST00000588815 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-206ENST00000588815 SMR3AQ99954 134 aa24.45■■□□□ 1.5
CAPNS1-206ENST00000588815 ATP6V0CP27449 155 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-206ENST00000588815 OPRK1P41145 380 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-206ENST00000588815 MFAP2P55001 183 aa24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-206ENST00000588815 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-206ENST00000588815 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP24.44■■□□□ 1.5
CAPNS1-206ENST00000588815 HIVEP2P31629 2446 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-206ENST00000588815 KLK9Q2XQG4 91 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-206ENST00000588815 C9orf152Q5JTZ5 239 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-206ENST00000588815 TREML4Q6UXN2 200 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC16A13Q7RTY0 426 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC35E1Q96K37 410 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-206ENST00000588815 THYN1Q9P016 225 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-206ENST00000588815 KLK9Q9UKQ9 250 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-206ENST00000588815 TIMM9Q9Y5J7 89 aa24.43■■□□□ 1.5
CAPNS1-206ENST00000588815 SMCO3A2RU48 225 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-206ENST00000588815 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-206ENST00000588815 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM144Q7Z5S9 345 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-206ENST00000588815 TMED6Q8WW62 240 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-206ENST00000588815 MISP3Q96FF7 219 aa24.42■■□□□ 1.5
CAPNS1-206ENST00000588815 AP4M1O00189 453 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-206ENST00000588815 SRD5A1P18405 259 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-206ENST00000588815 FGF7P21781 194 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-206ENST00000588815 BLCAPP62952 87 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-206ENST00000588815 ECSCRQ19T08 205 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-206ENST00000588815 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-206ENST00000588815 LRRC20Q8TCA0 184 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-206ENST00000588815 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa24.41■■□□□ 1.5
CAPNS1-206ENST00000588815 SOX15O60248 233 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-206ENST00000588815 AKR1C1Q04828 323 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-206ENST00000588815 TEPPQ6URK8 271 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-206ENST00000588815 BTNL8Q6UX41 500 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-206ENST00000588815 SLC25A32Q9H2D1 315 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-206ENST00000588815 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-206ENST00000588815 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-206ENST00000588815 DMRT1Q9Y5R6 373 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-206ENST00000588815 ZFHX3Q15911 3703 aa24.4■■□□□ 1.5
CAPNS1-206ENST00000588815 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa24.39■■□□□ 1.5
CAPNS1-206ENST00000588815 TRAV41A0A0B4J266 112 aa24.39■■□□□ 1.5
CAPNS1-206ENST00000588815 LINC01548A6NM66 108 aa24.39■■□□□ 1.5
CAPNS1-206ENST00000588815 C17orf112F2Z3M2 114 aa24.39■■□□□ 1.5
CAPNS1-206ENST00000588815 GAMTQ14353 236 aa24.39■■□□□ 1.5
CAPNS1-206ENST00000588815 C19orf54Q5BKX5 351 aa24.39■■□□□ 1.5
CAPNS1-206ENST00000588815 PRSS22Q9GZN4 317 aa24.39■■□□□ 1.5
CAPNS1-206ENST00000588815 SERF2P84101 59 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-206ENST00000588815 RAB31Q13636 194 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-206ENST00000588815 TNFRSF19Q9NS68 423 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-206ENST00000588815 CLDN34H7C241 214 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-206ENST00000588815 RUNX1Q01196 453 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF709Q8N972 641 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-206ENST00000588815 OR5T1Q8NG75 326 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-206ENST00000588815 RNF141Q8WVD5 230 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-206ENST00000588815 FANCD2OSQ96PS1 177 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-206ENST00000588815 NPCDR1Q9BY65 106 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-206ENST00000588815 KCNIP2Q9NS61 270 aa24.38■■□□□ 1.49
CAPNS1-206ENST00000588815 UMAD1C9J7I0 102 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-206ENST00000588815 MT-CO2P00403 227 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-206ENST00000588815 RAB5CP51148 216 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-206ENST00000588815 RAB14P61106 215 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-206ENST00000588815 C19orf35Q6ZS72 473 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-206ENST00000588815 OR2G3Q8NGZ4 309 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-206ENST00000588815 SH3BGRL3Q9H299 93 aa24.37■■□□□ 1.49
CAPNS1-206ENST00000588815 TRIM77I1YAP6 450 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-206ENST00000588815 I3L2K1 104 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-206ENST00000588815 BRI3O95415 125 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-206ENST00000588815 SULT1A2P50226 295 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM116Q8NCL8 245 aa24.36■■□□□ 1.49
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
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