RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587547.1

NEDD4L-218, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 4-like, E3 ubiquitin protein ligase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NEDD4L, Length 889 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4L-218ENST00000587547 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 ZNF429Q86V71 674 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 Q8N2B8 174 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 OR5M8Q8NGP6 311 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 OR5B3Q8NH48 314 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 C2orf50Q96LR7 162 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 RBKSQ9H477 322 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 PLEKHA3Q9HB20 300 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 ENY2Q9NPA8 101 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 COA4Q9NYJ1 87 aa6.6□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 SACSQ9NZJ4 4579 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 NOTCH3Q9UM47 2321 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 A0A1B0GVG6 124 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 A0A1W2PN81 502 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 TEX22C9J3V5 150 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 WRBO00258 174 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 PITX3O75364 302 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 OR13C7P0DN81 318 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 IAPPP10997 89 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 AREGP15514 252 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 CXCL3P19876 107 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 CHRNA7P36544 502 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 PROK1P58294 105 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 S100A10P60903 97 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 SPCS3P61009 180 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 TNFRSF9Q07011 255 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 ASPHD1Q5U4P2 390 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 FAM122CQ6P4D5 195 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 C19orf35Q6ZS72 473 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 ZNF329Q86UD4 541 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 STPG2Q8N412 459 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 KLHDC1Q8N7A1 406 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 OR5T1Q8NG75 326 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 OR11H7Q8NGC8 314 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 OR4D5Q8NGN0 318 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 LINC01006Q8NI28 216 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 C16orf95Q9H693 158 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 SERTAD4Q9NUC0 356 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa6.59□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
NEDD4L-218ENST00000587547 TENM2Q9NT68 2774 aa6.58□□□□□ -1.36
NEDD4L-218ENST00000587547 IGLC7A0M8Q6 106 aa6.58□□□□□ -1.36
NEDD4L-218ENST00000587547 PSMB11A5LHX3 300 aa6.58□□□□□ -1.36
NEDD4L-218ENST00000587547 FAM90A26D6RGX4 464 aa6.58□□□□□ -1.36
NEDD4L-218ENST00000587547 SSSCA1O60232 199 aa6.58□□□□□ -1.36
NEDD4L-218ENST00000587547 MED6O75586 246 aa6.58□□□□□ -1.36
NEDD4L-218ENST00000587547 IGF1P05019 195 aa6.58□□□□□ -1.36
NEDD4L-218ENST00000587547 H2BFSP57053 126 aa6.58□□□□□ -1.36
NEDD4L-218ENST00000587547 SLC35B1P78383 322 aa6.58□□□□□ -1.36
NEDD4L-218ENST00000587547 WT1-ASQ06250 92 aa6.58□□□□□ -1.36
NEDD4L-218ENST00000587547 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa6.58□□□□□ -1.36
NEDD4L-218ENST00000587547 AARDQ4LEZ3 155 aa6.58□□□□□ -1.36
NEDD4L-218ENST00000587547 C10orf99Q6UWK7 81 aa6.58□□□□□ -1.36
NEDD4L-218ENST00000587547 LINC00482Q8N8I6 264 aa6.58□□□□□ -1.36
NEDD4L-218ENST00000587547 OR52E5Q8NH55 327 aa6.58□□□□□ -1.36
NEDD4L-218ENST00000587547 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
NEDD4L-218ENST00000587547 HSPB7Q9UBY9 170 aa6.58□□□□□ -1.36
NEDD4L-218ENST00000587547 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
NEDD4L-218ENST00000587547 K7EPK0 472 aa6.57□□□□□ -1.36
NEDD4L-218ENST00000587547 L7N2F9 121 aa6.57□□□□□ -1.36
NEDD4L-218ENST00000587547 SYNGR2O43760 224 aa6.57□□□□□ -1.36
NEDD4L-218ENST00000587547 MBPP02686 304 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
NEDD4L-218ENST00000587547 PRH1P02810 166 aa6.57□□□□□ -1.36
NEDD4L-218ENST00000587547 DEFA4P12838 97 aa6.57□□□□□ -1.36
NEDD4L-218ENST00000587547 PSMB6P28072 239 aa6.57□□□□□ -1.36
NEDD4L-218ENST00000587547 SNCAP37840 140 aa6.57□□□□□ -1.36
NEDD4L-218ENST00000587547 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
NEDD4L-218ENST00000587547 VAMP2P63027 116 aa6.57□□□□□ -1.36
NEDD4L-218ENST00000587547 ERHP84090 104 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
NEDD4L-218ENST00000587547 DEFA5Q01523 94 aa6.57□□□□□ -1.36
NEDD4L-218ENST00000587547 RAB32Q13637 225 aa6.57□□□□□ -1.36
NEDD4L-218ENST00000587547 AKIRIN2Q53H80 203 aa6.57□□□□□ -1.36
NEDD4L-218ENST00000587547 LCNL1Q6ZST4 164 aa6.57□□□□□ -1.36
NEDD4L-218ENST00000587547 OR2C3Q8N628 320 aa6.57□□□□□ -1.36
NEDD4L-218ENST00000587547 DTD1Q8TEA8 209 aa6.57□□□□□ -1.36
NEDD4L-218ENST00000587547 MS4A10Q96PG2 267 aa6.57□□□□□ -1.36
NEDD4L-218ENST00000587547 GON7Q9BXV9 100 aa6.57□□□□□ -1.36
NEDD4L-218ENST00000587547 NMES1Q9C002 83 aa6.57□□□□□ -1.36
NEDD4L-218ENST00000587547 HIPK2Q9H2X6 1198 aa6.57□□□□□ -1.36
NEDD4L-218ENST00000587547 CACFD1Q9UGQ2 172 aa6.57□□□□□ -1.36
NEDD4L-218ENST00000587547 NPIPB5A8MRT5 1133 aa6.56□□□□□ -1.36
NEDD4L-218ENST00000587547 H3BP45 60 aa6.56□□□□□ -1.36
NEDD4L-218ENST00000587547 SOX15O60248 233 aa6.56□□□□□ -1.36
NEDD4L-218ENST00000587547 IFNA10P01566 189 aa6.56□□□□□ -1.36
NEDD4L-218ENST00000587547 CYCSP99999 105 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
NEDD4L-218ENST00000587547 CD69Q07108 199 aa6.56□□□□□ -1.36
NEDD4L-218ENST00000587547 ZNF124Q15973 351 aa6.56□□□□□ -1.36
NEDD4L-218ENST00000587547 C19orf54Q5BKX5 351 aa6.56□□□□□ -1.36
NEDD4L-218ENST00000587547 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa6.56□□□□□ -1.36
NEDD4L-218ENST00000587547 SLC25A24Q6NUK1 477 aa6.56□□□□□ -1.36
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