RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578916.2

PTPRM-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-210ENST00000578916 ST3GAL4Q11206 333 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 HSD17B12Q53GQ0 312 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 PVRIGQ6DKI7 326 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 SSX9Q7RTT3 188 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF575Q86XF7 245 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 MS4A15Q8N5U1 240 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 POM121L12Q8N7R1 296 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 OR4S2Q8NH73 311 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 RNF141Q8WVD5 230 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 MAFIPQ8WZ33 124 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 C20orf24Q9BUV8 137 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 HRH4Q9H3N8 390 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 THYN1Q9P016 225 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRM-210ENST00000578916 HERC1Q15751 4861 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 OR2T8A6NH00 312 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF98A6NK75 572 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 CD37P11049 281 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 CD36P16671 472 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 WNT4P56705 351 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 RPL11P62913 178 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 RPL8P62917 257 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 ID3Q02535 119 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 ZFP1Q6P2D0 407 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF645Q8N7E2 425 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 TSPAN14Q8NG11 270 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 FCGR1BQ92637 280 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 RNF126Q9BV68 326 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 MAGT1Q9H0U3 335 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 A0A087WWL8 130 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 A0A1B0GVG6 124 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 K7EMT4 169 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 NDUFA4O00483 81 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 SLC17A2O00624 439 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 CYB5BO43169 146 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 HRASP01112 189 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 HLA-GP17693 338 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 DTYMKP23919 212 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 CAMPP49913 170 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 RPL30P62888 115 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 SSX1Q16384 188 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 LGALS9BQ3B8N2 356 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 Q6ZTC4 211 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 OCC1Q8TAD7 63 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 LHFPL5Q8TAF8 219 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 VN1R17PQ8TDU5 208 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 RAB3CQ96E17 227 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 RNF2Q99496 336 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 SMPXQ9UHP9 88 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 C15orf61A6NNL5 157 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM238C9JI98 176 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 CCNKO75909 580 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 SLC22A5O76082 557 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 RBMY1CP0DJD4 496 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 TALDO1P37837 337 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 CLDN12P56749 244 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 OR2B8PP59922 312 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 TNP2Q05952 138 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 SOHLH1Q5JUK2 328 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 SPSB3Q6PJ21 355 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 GPR141Q7Z602 305 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 NANOGP1Q8N7R0 232 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 Q8NAQ8 132 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 NUDT10Q8NFP7 164 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 FAM3DQ96BQ1 224 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 HRASLSQ9HDD0 168 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 ETV7Q9Y603 341 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 LRP1BQ9NZR2 4599 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 A0A1B0GW15 77 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 C5orf52A6NGY3 159 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 CGB1A6NKQ9 187 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 C15orf62A8K5M9 175 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 CHEK1O14757 476 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 IFNA10P01566 189 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 HLA-DQB1P01920 261 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 AMBPP02760 352 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 UCHL1P09936 223 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 MIFP14174 115 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 GNB3P16520 340 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 GADD45AP24522 165 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 PAFAH1B2P68402 229 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 TRIM16LQ309B1 348 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 MFSD4AQ8N468 514 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRM-210ENST00000578916 GBGT1Q8N5D6 347 aa6.61□□□□□ -1.35
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