RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568530.5

PDPR-210, Transcript of pyruvate dehydrogenase phosphatase regulatory subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDPR, Length 7,223 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDPR-210ENST00000568530 TMEM54Q969K7 222 aa7.13□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 DPM3Q9P2X0 92 aa7.13□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 NPIPB8E9PQR5 432 aa7.13□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 NPIPB9F8W1W9 429 aa7.13□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 NPIPB7O75200 414 aa7.13□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 C6orf226Q5I0X4 101 aa7.13□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa7.13□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa7.13□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 TMEM127O75204 238 aa7.13□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 CEACAM21Q3KPI0 293 aa7.13□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 PRR31Q5SQ13 230 aa7.13□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 ZNF562Q6V9R5 426 aa7.13□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 KCNE5Q9UJ90 142 aa7.13□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 Q0VFX4 171 aa7.12□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 RPS20P60866 119 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 WNT2P09544 360 aa7.12□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 LINC00614P0C842 121 aa7.12□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 NR2C2APQ86WQ0 139 aa7.12□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 IFNL4K9M1U5 179 aa7.12□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 TMEM50AO95807 157 aa7.12□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 HLA-DRB1P01911 266 aa7.12□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 VMO1Q7Z5L0 202 aa7.12□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 ANGPTL4Q9BY76 406 aa7.12□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 ST20Q9HBF5 79 aa7.12□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 SNHG12Q9BXW3 62 aa7.12□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa7.12□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa7.12□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa7.12□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa7.12□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 MPTX1A8MV57 137 aa7.12□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 F8VVB4 439 aa7.12□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 F8VWA3 439 aa7.12□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 PTP4A3O75365 173 aa7.12□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 LSM6P62312 80 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 RHOGP84095 191 aa7.12□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 STPG2Q8N412 459 aa7.12□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa7.11□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 hADV29S1A0JD25 119 aa7.11□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 TCRAP04437 139 aa7.11□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 TBR1Q16650 682 aa7.11□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 C4orf48Q5BLP8 95 aa7.11□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 HAPLN4Q86UW8 402 aa7.11□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 AICDAQ9GZX7 198 aa7.11□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 KNL1Q8NG31 2342 aa7.11□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 A0A1W2PQD3 144 aa7.11□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 OR11H12B2RN74 326 aa7.11□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 VWC2LB2RUY7 222 aa7.11□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 H0YL77 283 aa7.11□□□□□ -1.27
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PDPR-210ENST00000568530 SLC25A45Q8N413 288 aa7.11□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 RNF182Q8N6D2 247 aa7.11□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 ERVH48-1M5A8F1 160 aa7.11□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 PKIAP61925 76 aa7.11□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 COTL1Q14019 142 aa7.11□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 PIP4P2Q8N4L2 257 aa7.11□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa7.11□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 RAMP1O60894 148 aa7.11□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 TIAF1O95411 115 aa7.11□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 RAG2P55895 527 aa7.11□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 UBE2V2Q15819 145 aa7.11□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 FAM57AQ8TBR7 257 aa7.11□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa7.11□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 HLA-DQB1P01920 261 aa7.11□□□□□ -1.27
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PDPR-210ENST00000568530 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa7.1□□□□□ -1.27
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PDPR-210ENST00000568530 C1orf159Q96HA4 380 aa7.1□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 LIMS1P48059 325 aa7.1□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 LINC00596Q86U02 117 aa7.1□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 HOGA1Q86XE5 327 aa7.1□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 RP1P56715 2156 aa7.1□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 H3BUX3 64 aa7.1□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 TMEM105Q8N8V8 129 aa7.1□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 KLF4O43474 513 aa7.1□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 FCN3O75636 299 aa7.1□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 LY6HO94772 140 aa7.1□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 VKORC1Q9BQB6 163 aa7.1□□□□□ -1.27
PDPR-210ENST00000568530 NRIP2Q9BQI9 281 aa7.1□□□□□ -1.27
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