RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558831.5

USP3-AS1-201, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP3-AS1, Length 1,784 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-201ENST00000558831 MTORP42345 2549 aa13.61□□□□□ -0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZFHX3Q15911 3703 aa13.61□□□□□ -0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 ATP6V0E1O15342 81 aa13.6□□□□□ -0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 OPRK1P41145 380 aa13.6□□□□□ -0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 DLK1P80370 383 aa13.6□□□□□ -0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 ECSCRQ19T08 205 aa13.6□□□□□ -0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF114Q8NC26 417 aa13.6□□□□□ -0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR1P1Q8NH06 330 aa13.6□□□□□ -0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 GINS3Q9BRX5 216 aa13.6□□□□□ -0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 GGACTQ9BVM4 153 aa13.6□□□□□ -0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC25A32Q9H2D1 315 aa13.6□□□□□ -0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 MXRA5Q9NR99 2828 aa13.6□□□□□ -0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 LINC01548A6NM66 108 aa13.6□□□□□ -0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 CTRB1P17538 263 aa13.6□□□□□ -0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 ATP6V0CP27449 155 aa13.6□□□□□ -0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 RUNX1Q01196 453 aa13.6□□□□□ -0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 CTRB2Q6GPI1 263 aa13.6□□□□□ -0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa13.6□□□□□ -0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 SGMS2Q8NHU3 365 aa13.6□□□□□ -0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP13.6□□□□□ -0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP13.6□□□□□ -0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 ARV1Q9H2C2 271 aa13.6□□□□□ -0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 FGF7P21781 194 aa13.59□□□□□ -0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 AKR1C1Q04828 323 aa13.59□□□□□ -0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 CD69Q07108 199 aa13.59□□□□□ -0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 MLANAQ16655 118 aa13.59□□□□□ -0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM74A1Q5RGS3 127 aa13.59□□□□□ -0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 ASPHD1Q5U4P2 390 aa13.59□□□□□ -0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR5T1Q8NG75 326 aa13.59□□□□□ -0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 SH3BGRL3Q9H299 93 aa13.59□□□□□ -0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 NPVFQ9HCQ7 196 aa13.59□□□□□ -0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 CORTO00230 105 aa13.58□□□□□ -0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 MFAP2P55001 183 aa13.58□□□□□ -0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 BLCAPP62952 87 aa13.58□□□□□ -0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 VWC2Q2TAL6 325 aa13.58□□□□□ -0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 TTC9CQ8N5M4 171 aa13.58□□□□□ -0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP13.58□□□□□ -0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.23
USP3-AS1-201ENST00000558831 NPIPB5A8MRT5 1133 aa13.58□□□□□ -0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 PRH1P02810 166 aa13.58□□□□□ -0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 SEC11BP0C7V7 166 aa13.58□□□□□ -0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 RAB14P61106 215 aa13.58□□□□□ -0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 BTNL8Q6UX41 500 aa13.58□□□□□ -0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC35E3Q7Z769 313 aa13.58□□□□□ -0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR1L6Q8NGR2 347 aa13.58□□□□□ -0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR2G3Q8NGZ4 309 aa13.58□□□□□ -0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 PCNPQ8WW12 178 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC35E1Q96K37 410 aa13.58□□□□□ -0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 DUX5Q96PT3 197 aa13.58□□□□□ -0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 RSG1Q9BU20 258 aa13.58□□□□□ -0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 RFNGQ9Y644 331 aa13.58□□□□□ -0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 IGHV3-48P01763 117 aa13.57□□□□□ -0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 CRYGCP07315 174 aa13.57□□□□□ -0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM157CP0CG43 387 aa13.57□□□□□ -0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 SPP1P10451 314 aa13.57□□□□□ -0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 TREML4Q6UXN2 200 aa13.57□□□□□ -0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 SLC16A13Q7RTY0 426 aa13.57□□□□□ -0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 LINC00527Q9UJ94 153 aa13.57□□□□□ -0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa13.56□□□□□ -0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa13.56□□□□□ -0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 CYB5BO43169 146 aa13.56□□□□□ -0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 CRLF1O75462 422 aa13.56□□□□□ -0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 ETFRF1Q6IPR1 90 aa13.56□□□□□ -0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF709Q8N972 641 aa13.56□□□□□ -0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 OR2T6Q8NHC8 308 aa13.56□□□□□ -0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 CACNG8Q8WXS5 425 aa13.56□□□□□ -0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 ACY3Q96HD9 319 aa13.56□□□□□ -0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa13.56□□□□□ -0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa13.55□□□□□ -0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 G3V318 75 aa13.55□□□□□ -0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 IGHG2P01859 326 aa13.55□□□□□ -0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 GAMTQ14353 236 aa13.55□□□□□ -0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 AKIRIN2Q53H80 203 aa13.55□□□□□ -0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 TEPPQ6URK8 271 aa13.55□□□□□ -0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 TMEM68Q96MH6 324 aa13.55□□□□□ -0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 JMJD8Q96S16 334 aa13.55□□□□□ -0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 WDR83OSQ9Y284 106 aa13.55□□□□□ -0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 DMRT1Q9Y5R6 373 aa13.55□□□□□ -0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 FNDC10F2Z333 226 aa13.55□□□□□ -0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 C17orf112F2Z3M2 114 aa13.55□□□□□ -0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 CLDN34H7C241 214 aa13.55□□□□□ -0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 MT-CO2P00403 227 aa13.55□□□□□ -0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 PVRIGQ6DKI7 326 aa13.55□□□□□ -0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 Q6ZS46 218 aa13.55□□□□□ -0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 RNF141Q8WVD5 230 aa13.55□□□□□ -0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa13.55□□□□□ -0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 TRAV41A0A0B4J266 112 aa13.54□□□□□ -0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 HILS1P60008 231 aa13.54□□□□□ -0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 NPCDR1Q9BY65 106 aa13.54□□□□□ -0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 MPDU1O75352 247 aa13.53□□□□□ -0.24
USP3-AS1-201ENST00000558831 MDKP21741 143 aaPredicted RBP13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73 ms