RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 IL36GQ9NZH8 169 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 ASXL3Q9C0F0 2248 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 MYO16Q9Y6X6 1858 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 A0A1W2PS18 150 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 KNCNA6PVL3 124 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 PITX3O75364 302 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF708P17019 499 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 S100A4P26447 101 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 MS4A18Q3C1V0 323 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 ETDBQ3ZM63 59 aa5.32□□□□□ -1.56
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PTPRB-210ENST00000551525 C18orf12Q96KH6 178 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
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PTPRB-210ENST00000551525 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 ACSM6Q6P461 480 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
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PTPRB-210ENST00000551525 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 C6orf226Q5I0X4 101 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
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PTPRB-210ENST00000551525 SLC25A2Q9BXI2 301 aa5.32□□□□□ -1.56
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PTPRB-210ENST00000551525 PDCD6O75340 191 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 PDCD1Q15116 288 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM42Q69YG0 159 aa5.31□□□□□ -1.56
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PTPRB-210ENST00000551525 OR5C1Q8NGR4 320 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM190Q8WZ59 177 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 FBXL15Q9H469 300 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 RNF114Q9Y508 228 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 ATG2BQ96BY7 2078 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 FAM90A10PA6NDY2 464 aa5.31□□□□□ -1.56
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PTPRB-210ENST00000551525 FAM90A12PA8MX19 464 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 SLC17A2O00624 439 aa5.31□□□□□ -1.56
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PTPRB-210ENST00000551525 FAM90A15PP0C7V4 464 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 FAM90A13PP0C7W8 464 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 FAM90A14PP0C7W9 464 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 FAM90A24PP0C7X0 464 aa5.31□□□□□ -1.56
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PTPRB-210ENST00000551525 SLC25A53Q5H9E4 307 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 FNDC7Q5VTL7 733 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 DCTN5Q9BTE1 182 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 DPH3P1Q9H4G8 78 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 PTGDSP41222 190 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 TEX36Q5VZQ5 186 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa5.31□□□□□ -1.56
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PTPRB-210ENST00000551525 PSG2P11465 335 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 CDAP32320 146 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 ADMP35318 185 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 EFNA4P52798 201 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 SLC25A28Q96A46 364 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 WFDC1Q9HC57 220 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 UPK3AO75631 287 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 NTN1O95631 604 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 ERVK11-1P61568 191 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
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PTPRB-210ENST00000551525 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 AAMDCQ9H7C9 122 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 PATJQ8NI35 1801 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 A0A0U1RQV1 116 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 IGKV3-11P04433 115 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 MST1P26927 711 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 RND2P52198 227 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 TWIST1Q15672 202 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 CD226Q15762 336 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 TCF23Q7RTU1 214 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 SAXO1Q8IYX7 474 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 BAALCQ8WXS3 180 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 PRELID3AQ96N28 172 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 VGLL1Q99990 258 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 PRDM14Q9GZV8 571 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRB-210ENST00000551525 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
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