RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548567.5

CS-212, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 3,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-212ENST00000548567 CT45A6P0DMU7 189 aa5.9□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 CT45A5P0DMU8 189 aa5.9□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 CT45A7P0DMV0 189 aa5.9□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 IGKV1-13P0DP09 117 aa5.9□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 DEFA4P12838 97 aa5.9□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 G0S2P27469 103 aa5.9□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 RPL11P62913 178 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 ZNF674Q2M3X9 581 aa5.9□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 SP6Q3SY56 376 aa5.9□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa5.9□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 GBGT1Q8N5D6 347 aa5.9□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 RETNQ9HD89 108 aa5.9□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 CCL28Q9NRJ3 127 aa5.9□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 FBLN5Q9UBX5 448 aa5.9□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 A0A087WWC5 75 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 CLDN34H7C241 214 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 DLEU1O43261 78 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 HIST1H2BKO60814 126 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 HIST1H2BJP06899 126 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 METTL15P1P0C7V9 234 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 PET100P0DJ07 73 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 HIST1H2BOP23527 126 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 FCGR2CP31995 323 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 HIST1H2BBP33778 126 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 HIST1H2BDP58876 126 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 HIST1H2BCP62807 126 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 HIST2H2BEQ16778 126 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 HIST1H2BHQ93079 126 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 HIST1H2BNQ99877 126 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 HIST1H2BMQ99879 126 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 SMDT1Q9H4I9 107 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 RAB18Q9NP72 206 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 LINC00473A8K010 186 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 SLC17A2O00624 439 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 RAMP3O60896 148 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 SLC35B1P78383 322 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 ZNF529Q6P280 563 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 FDX2Q6P4F2 183 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 TEX38Q6PEX7 206 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 C9orf139Q6ZV77 190 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 KCTD9Q7L273 389 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 PBDC1Q9BVG4 233 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 SLC35B3Q9H1N7 401 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 IL36GQ9NZH8 169 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 TRAV3A0A0B4J244 114 aa5.88□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 E7EUB6 86 aa5.88□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 K7EIL1 84 aa5.88□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 LMO1P25800 156 aa5.88□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa5.88□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 OR10W1Q8NGF6 305 aa5.88□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 SLC25A31Q9H0C2 315 aa5.88□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa5.88□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa5.88□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 A0A087WW49 117 aa5.88□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa5.88□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa5.88□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 M0R143 59 aa5.88□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 RAB6AP20340 208 aa5.88□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 IL3RAP26951 378 aa5.88□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 BPIFB3P59826 476 aa5.88□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 RPL30P62888 115 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa5.88□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 NABP2Q9BQ15 211 aa5.88□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 IFI27L2Q9H2X8 130 aa5.88□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 TRAV41A0A0B4J266 112 aa5.88□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 PHOX2AO14813 284 aa5.88□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 FABP4P15090 132 aa5.88□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 PMS2P11Q13670 270 aa5.88□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 PRR31Q5SQ13 230 aa5.88□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 GGNBP1Q5YKI7 109 aa5.88□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa5.88□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 ZNF664Q8N3J9 261 aa5.88□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 CD300LFQ8TDQ1 290 aa5.88□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 DTD1Q8TEA8 209 aa5.88□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 OR5AC2Q9NZP5 309 aa5.88□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa5.87□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 IZUMO1RA6ND01 250 aa5.87□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa5.87□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 M0QZK8 103 aa5.87□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 DEFB4AO15263 64 aa5.87□□□□□ -1.47
CS-212ENST00000548567 NBR2O15453 112 aa5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms