RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541770.1

CLSTN3-212, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 3

Gene CLSTN3, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-212ENST00000541770 FAM223AQ8IWN6 122 aa6.68□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 OR2C3Q8N628 320 aa6.68□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF114Q8NC26 417 aa6.68□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 NECAP1Q8NC96 275 aa6.68□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 OR10W1Q8NGF6 305 aa6.68□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 OR52B4Q8NGK2 314 aa6.68□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 OR1L6Q8NGR2 347 aa6.68□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 OR1N2Q8NGR9 330 aa6.68□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 MS4A10Q96PG2 267 aa6.68□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 FANCD2OSQ96PS1 177 aa6.68□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 HINT2Q9BX68 163 aa6.68□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 PLEKHA3Q9HB20 300 aa6.68□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa6.67□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 A0A1B0GVG6 124 aa6.67□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 FAM90A26D6RGX4 464 aa6.67□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa6.67□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 OVOL1O14753 267 aa6.67□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 PRAF2O60831 178 aa6.67□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 IFNA21P01568 189 aa6.67□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 REG1AP05451 166 aa6.67□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 HOXB5P09067 269 aa6.67□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 DEFA4P12838 97 aa6.67□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 ERHP84090 104 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 RHOGP84095 191 aa6.67□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF616Q08AN1 781 aa6.67□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 FAM209BQ5JX69 171 aa6.67□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 GGNBP1Q5YKI7 109 aa6.67□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 OR1P1Q8NH06 330 aa6.67□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 DCUN1D4Q92564 292 aa6.67□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 GNB4Q9HAV0 340 aa6.67□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 EDA2RQ9HAV5 297 aa6.67□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 THYN1Q9P016 225 aa6.67□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 HSPB7Q9UBY9 170 aa6.67□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa6.66□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 SNRPGP15A8MWD9 76 aa6.66□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 ADAP1O75689 374 aa6.66□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 PRH1P02810 166 aa6.66□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 ATP5G2Q06055 141 aa6.66□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 TNFRSF9Q07011 255 aa6.66□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 FHL3Q13643 280 aa6.66□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 OXA1LQ15070 435 aa6.66□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 PVRIGQ6DKI7 326 aa6.66□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF343Q6P1L6 599 aa6.66□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 Q6ZNX1 250 aa6.66□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 C19orf35Q6ZS72 473 aa6.66□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 OR1S1Q8NH92 325 aa6.66□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 SEC22CQ9BRL7 303 aa6.66□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 TM2D3Q9BRN9 247 aa6.66□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 ENY2Q9NPA8 101 aa6.66□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 DMRT1Q9Y5R6 373 aa6.66□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 SORL1Q92673 2214 aa6.65□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 OR2J3O76001 311 aa6.65□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa6.65□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 SNCAP37840 140 aa6.65□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 SUB1P53999 127 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 SLURP1P55000 103 aa6.65□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 MFAP2P55001 183 aa6.65□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 ID3Q02535 119 aa6.65□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 C15orf32Q32M92 178 aa6.65□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 BSXQ3C1V8 233 aa6.65□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 SPINK9Q5DT21 86 aa6.65□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 SLC25A24Q6NUK1 477 aa6.65□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 VN1R17PQ8TDU5 208 aa6.65□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 CXorf58Q96LI9 332 aa6.65□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 ATP6V0BQ99437 205 aa6.65□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 FBXL7Q9UJT9 491 aa6.65□□□□□ -1.34
CLSTN3-212ENST00000541770 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CLSTN3-212ENST00000541770 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa6.64□□□□□ -1.35
CLSTN3-212ENST00000541770 CEBPZOSA8MTT3 80 aa6.64□□□□□ -1.35
CLSTN3-212ENST00000541770 MPTX1A8MV57 137 aa6.64□□□□□ -1.35
CLSTN3-212ENST00000541770 CORTO00230 105 aa6.64□□□□□ -1.35
CLSTN3-212ENST00000541770 MED6O75586 246 aa6.64□□□□□ -1.35
CLSTN3-212ENST00000541770 NDUFB8O95169 186 aa6.64□□□□□ -1.35
CLSTN3-212ENST00000541770 IGHV3-11P01762 117 aa6.64□□□□□ -1.35
CLSTN3-212ENST00000541770 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CLSTN3-212ENST00000541770 HTR2BP41595 481 aa6.64□□□□□ -1.35
CLSTN3-212ENST00000541770 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CLSTN3-212ENST00000541770 DEFA5Q01523 94 aa6.64□□□□□ -1.35
CLSTN3-212ENST00000541770 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CLSTN3-212ENST00000541770 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CLSTN3-212ENST00000541770 C2orf83Q53S99 150 aa6.64□□□□□ -1.35
CLSTN3-212ENST00000541770 NOXA1Q86UR1 476 aa6.64□□□□□ -1.35
CLSTN3-212ENST00000541770 HAPLN4Q86UW8 402 aa6.64□□□□□ -1.35
CLSTN3-212ENST00000541770 OR4D5Q8NGN0 318 aa6.64□□□□□ -1.35
CLSTN3-212ENST00000541770 DTD1Q8TEA8 209 aa6.64□□□□□ -1.35
CLSTN3-212ENST00000541770 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CLSTN3-212ENST00000541770 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa6.64□□□□□ -1.35
CLSTN3-212ENST00000541770 OR4C12Q96R67 309 aa6.64□□□□□ -1.35
CLSTN3-212ENST00000541770 SPATA25Q9BR10 227 aa6.64□□□□□ -1.35
CLSTN3-212ENST00000541770 HIPK2Q9H2X6 1198 aa6.64□□□□□ -1.35
CLSTN3-212ENST00000541770 RBKSQ9H477 322 aa6.64□□□□□ -1.35
CLSTN3-212ENST00000541770 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CLSTN3-212ENST00000541770 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
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