RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 KCNJ16Q9NPI9 418 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 KCNIP1Q9NZI2 227 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 COPZ2Q9P299 210 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 AK3Q9UIJ7 227 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 LRRK2Q5S007 2527 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 FBN2P35556 2912 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRC-214ENST00000530727 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa3.2□□□□□ -1.9
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PTPRC-214ENST00000530727 CD164Q04900 197 aa3.18□□□□□ -1.9
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