RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525459.1

PTPRK-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRK, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-218ENST00000525459 DMRT1Q9Y5R6 373 aa14.5□□□□□ -0.09
PTPRK-218ENST00000525459 MFAP2P55001 183 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRK-218ENST00000525459 TAS2R30P59541 319 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRK-218ENST00000525459 C8orf86Q6ZUL3 223 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRK-218ENST00000525459 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
PTPRK-218ENST00000525459 MGAT4CQ9UBM8 478 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRK-218ENST00000525459 RAB11AP62491 216 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRK-218ENST00000525459 ASB13Q8WXK3 278 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRK-218ENST00000525459 MISP3Q96FF7 219 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRK-218ENST00000525459 MAGT1Q9H0U3 335 aa14.49□□□□□ -0.09
PTPRK-218ENST00000525459 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
PTPRK-218ENST00000525459 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRK-218ENST00000525459 NDUFB8O95169 186 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRK-218ENST00000525459 IGHV3-11P01762 117 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRK-218ENST00000525459 MBPP02686 304 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
PTPRK-218ENST00000525459 PF4P02776 101 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRK-218ENST00000525459 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
PTPRK-218ENST00000525459 MYCNOSP40205 109 aa14.48□□□□□ -0.09
PTPRK-218ENST00000525459 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP14.48□□□□□ -0.09
PTPRK-218ENST00000525459 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
PTPRK-218ENST00000525459 SSSCA1O60232 199 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRK-218ENST00000525459 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
PTPRK-218ENST00000525459 IAPPP10997 89 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRK-218ENST00000525459 DEFA5Q01523 94 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF616Q08AN1 781 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRK-218ENST00000525459 IL15RAQ13261 267 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRK-218ENST00000525459 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRK-218ENST00000525459 ETFRF1Q6IPR1 90 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRK-218ENST00000525459 SMIM8Q96KF7 97 aa14.47□□□□□ -0.09
PTPRK-218ENST00000525459 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
PTPRK-218ENST00000525459 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
PTPRK-218ENST00000525459 K7EIM0 57 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRK-218ENST00000525459 CCL24O00175 119 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRK-218ENST00000525459 TSC22D2O75157 780 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRK-218ENST00000525459 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
PTPRK-218ENST00000525459 OR8U8P0C7N1 319 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRK-218ENST00000525459 PET100P0DJ07 73 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRK-218ENST00000525459 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
PTPRK-218ENST00000525459 OPRK1P41145 380 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRK-218ENST00000525459 H2BFSP57053 126 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRK-218ENST00000525459 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
PTPRK-218ENST00000525459 FHL3Q13643 280 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRK-218ENST00000525459 C18orf65Q6ZTR6 163 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRK-218ENST00000525459 OR11H1Q8NG94 326 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRK-218ENST00000525459 DPF1Q92782 380 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRK-218ENST00000525459 OR5B12Q96R08 314 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRK-218ENST00000525459 TXN2Q99757 166 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRK-218ENST00000525459 C21orf62Q9NYP8 219 aa14.46□□□□□ -0.09
PTPRK-218ENST00000525459 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
PTPRK-218ENST00000525459 MFSD2BA6NFX1 497 aa14.46□□□□□ -0.1
PTPRK-218ENST00000525459 LINC01619G3V211 115 aa14.46□□□□□ -0.1
PTPRK-218ENST00000525459 I3L2K1 104 aa14.46□□□□□ -0.1
PTPRK-218ENST00000525459 L7N2F9 121 aa14.46□□□□□ -0.1
PTPRK-218ENST00000525459 MT-CO2P00403 227 aa14.46□□□□□ -0.1
PTPRK-218ENST00000525459 ZP3P21754 424 aa14.46□□□□□ -0.1
PTPRK-218ENST00000525459 VAMP2P63027 116 aa14.46□□□□□ -0.1
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF502Q8TBZ5 544 aa14.46□□□□□ -0.1
PTPRK-218ENST00000525459 SCARB1Q8WTV0 552 aa14.46□□□□□ -0.1
PTPRK-218ENST00000525459 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.1
PTPRK-218ENST00000525459 RAX2Q96IS3 184 aa14.46□□□□□ -0.1
PTPRK-218ENST00000525459 WNK1Q9H4A3 2382 aa14.45□□□□□ -0.1
PTPRK-218ENST00000525459 K7EPK0 472 aa14.45□□□□□ -0.1
PTPRK-218ENST00000525459 SCGB2A1O75556 95 aa14.45□□□□□ -0.1
PTPRK-218ENST00000525459 SLC25A4P12235 298 aa14.45□□□□□ -0.1
PTPRK-218ENST00000525459 S100A10P60903 97 aa14.45□□□□□ -0.1
PTPRK-218ENST00000525459 OR1N2Q8NGR9 330 aa14.45□□□□□ -0.1
PTPRK-218ENST00000525459 CCDC140Q96MF4 163 aa14.45□□□□□ -0.1
PTPRK-218ENST00000525459 PSENENQ9NZ42 101 aa14.45□□□□□ -0.1
PTPRK-218ENST00000525459 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
PTPRK-218ENST00000525459 SIX6O95475 246 aa14.44□□□□□ -0.1
PTPRK-218ENST00000525459 TSPAN15O95858 294 aa14.44□□□□□ -0.1
PTPRK-218ENST00000525459 RLN2P04090 185 aa14.44□□□□□ -0.1
PTPRK-218ENST00000525459 IFNA4P05014 189 aa14.44□□□□□ -0.1
PTPRK-218ENST00000525459 MFAP4P55083 255 aa14.44□□□□□ -0.1
PTPRK-218ENST00000525459 RAB32Q13637 225 aa14.44□□□□□ -0.1
PTPRK-218ENST00000525459 DEFB136Q30KP8 78 aa14.44□□□□□ -0.1
PTPRK-218ENST00000525459 PRR31Q5SQ13 230 aa14.44□□□□□ -0.1
PTPRK-218ENST00000525459 SPSB3Q6PJ21 355 aa14.44□□□□□ -0.1
PTPRK-218ENST00000525459 ETV3LQ6ZN32 361 aa14.44□□□□□ -0.1
PTPRK-218ENST00000525459 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP14.44□□□□□ -0.1
PTPRK-218ENST00000525459 C15orf62A8K5M9 175 aa14.44□□□□□ -0.1
PTPRK-218ENST00000525459 NPBWR1P48145 328 aa14.44□□□□□ -0.1
PTPRK-218ENST00000525459 SPANXN5Q5MJ07 72 aa14.44□□□□□ -0.1
PTPRK-218ENST00000525459 TMEM170AQ8WVE7 144 aa14.44□□□□□ -0.1
PTPRK-218ENST00000525459 ANK2Q01484 3957 aa14.43□□□□□ -0.1
PTPRK-218ENST00000525459 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa14.43□□□□□ -0.1
PTPRK-218ENST00000525459 A0A087WW49 117 aa14.43□□□□□ -0.1
PTPRK-218ENST00000525459 ANKRD34BA5PLL1 514 aa14.42□□□□□ -0.1
PTPRK-218ENST00000525459 DEDDO75618 318 aa14.42□□□□□ -0.1
PTPRK-218ENST00000525459 ARL3P36405 182 aa14.42□□□□□ -0.1
PTPRK-218ENST00000525459 CD69Q07108 199 aa14.42□□□□□ -0.1
PTPRK-218ENST00000525459 FCN2Q15485 313 aa14.42□□□□□ -0.1
PTPRK-218ENST00000525459 Q56UQ5 140 aa14.42□□□□□ -0.1
PTPRK-218ENST00000525459 CLEC19AQ6UXS0 136 aa14.42□□□□□ -0.1
PTPRK-218ENST00000525459 OR11H7Q8NGC8 314 aa14.42□□□□□ -0.1
PTPRK-218ENST00000525459 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa14.42□□□□□ -0.1
PTPRK-218ENST00000525459 CACNG8Q8WXS5 425 aa14.42□□□□□ -0.1
PTPRK-218ENST00000525459 H3BP45 60 aa14.41□□□□□ -0.1
PTPRK-218ENST00000525459 GGCTO75223 188 aaKnown RBP14.41□□□□□ -0.1
PTPRK-218ENST00000525459 CXCL3P19876 107 aa14.41□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms