RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 Q8N7P7 452 aa8.34□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 OR8B3Q8NGG8 313 aa8.34□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 PLPPR2Q96GM1 343 aa8.34□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 OR8B2Q96RD0 313 aa8.34□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 UBE2G1P62253 170 aa8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 UFSP1Q6NVU6 142 aa8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 MDP1Q86V88 176 aa8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 UBALD1Q8TB05 177 aa8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 FAM222BQ8WU58 562 aa8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 ZDHHC16Q969W1 377 aa8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 JMJD8Q96S16 334 aa8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 USP24Q9UPU5 2620 aa8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 C7orf71A4D174 169 aa8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 IGLV2-14P01704 120 aa8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 CX3CL1P78423 397 aa8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM147Q9BVK8 224 aa8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 OR4C46A6NHA9 309 aa8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 PMS2P5A8MQ11 134 aa8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 SNAI2O43623 268 aa8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 HSBP1O75506 76 aa8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 S100GP29377 79 aa8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 LINC00173Q6ZV60 143 aa8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 TCF24Q7RTU0 167 aa8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 IL1F10Q8WWZ1 152 aa8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 OR2D2Q9H210 308 aa8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa8.32□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 CA1P00915 261 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 FAM27BQ5VT28 67 aa8.32□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF611Q8N823 705 aa8.32□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 OR1A1Q9P1Q5 309 aa8.32□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 USF3Q68DE3 2245 aa8.32□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa8.32□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 CD5LO43866 347 aa8.32□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 OR4A5Q8NH83 315 aa8.32□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 THYN1Q9P016 225 aa8.32□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 AKAP13Q12802 2813 aa8.32□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa8.32□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 LRP5LA4QPB2 252 aa8.32□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 HAND1O96004 215 aa8.32□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 CEACAM3P40198 252 aa8.32□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 ADORA2A-AS1P86434 159 aa8.32□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 SMPXQ9UHP9 88 aa8.32□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 MZT1Q08AG7 82 aa8.31□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 WDR73Q6P4I2 378 aa8.31□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 Q6ZSR3 168 aa8.31□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa8.31□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 SCCPDHQ8NBX0 429 aa8.31□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 PIGCQ92535 297 aa8.31□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 TMEM54Q969K7 222 aa8.31□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 A0A1W2PPV4 95 aa8.31□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 LINC00869P0C866 280 aa8.31□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 SLC25A34Q6PIV7 304 aa8.31□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 OR2T6Q8NHC8 308 aa8.31□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 SLC25A40Q8TBP6 338 aa8.31□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 APCSP02743 223 aa8.31□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 CCL2P13500 99 aa8.31□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 BCL3P20749 454 aa8.31□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 C12orf54Q6X4T0 127 aa8.31□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa8.31□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 NEGR1Q7Z3B1 354 aa8.31□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 FGFRL1Q8N441 504 aa8.31□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 NABP1Q96AH0 204 aa8.31□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 OR2W1Q9Y3N9 320 aa8.31□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 MT-ND6P03923 174 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 RPL8P62917 257 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 OR5A2Q8NGI9 324 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 NINJ1Q92982 152 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 OR2H1Q9GZK4 316 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 COMMD5Q9GZQ3 224 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 SPG11Q96JI7 2443 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 J3QR06 171 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 CD1BP29016 333 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 C10orf35Q96D05 121 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 PTPN13Q12923 2485 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 MGST1P10620 155 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 SPATA46Q5T0L3 261 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 C10orf128Q5T292 105 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 CFAP161Q6P656 301 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 TNFRSF19Q9NS68 423 aa8.3□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 RAB9AP51151 201 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 SCGB2A2Q13296 93 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 ST20Q9HBF5 79 aa8.29□□□□□ -1.08
TRPS1-211ENST00000520276 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
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