RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515835.2

PDE4D-225, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene PDE4D, Length 590 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-225ENST00000515835 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 SCGNO76038 276 aa4.53□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 SLC22A5O76082 557 aa4.53□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 CA2P00918 260 aa4.53□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 CRYGBP07316 175 aa4.53□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 CTXN2P0C2S0 81 aa4.53□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 GP9P14770 177 aa4.53□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 RAB3BP20337 219 aa4.53□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 DTYMKP23919 212 aa4.53□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 MYL9P24844 172 aa4.53□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 TPPP2P59282 170 aa4.53□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 PITPNAQ00169 270 aa4.53□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 FXYD3Q14802 87 aa4.53□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 RTL8BQ17RB0 113 aa4.53□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 OR10R2Q8NGX6 335 aa4.53□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 USMG5Q96IX5 58 aa4.53□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 OR5B12Q96R08 314 aa4.53□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 OCR1Q9BZK8 76 aa4.53□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 JPT2Q9H910 190 aa4.53□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 NDUFB11Q9NX14 153 aa4.53□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 SDHAF2Q9NX18 166 aa4.53□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa4.53□□□□□ -1.68
PDE4D-225ENST00000515835 A0A087X0K7 114 aa4.52□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa4.52□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 CNIH1O95406 144 aa4.52□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 IGLV1-51P01701 117 aa4.52□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 IGLV2-23P01705 113 aa4.52□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 TRGV3P03979 118 aa4.52□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 TALDO1P37837 337 aa4.52□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 CLDN12P56749 244 aa4.52□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 GABARAPL2P60520 117 aa4.52□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 UBE2KP61086 200 aa4.52□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 TATDN3Q17R31 274 aa4.52□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 VMA21Q3ZAQ7 101 aa4.52□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 HES5Q5TA89 166 aa4.52□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 TPRA1Q86W33 373 aa4.52□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 CLCC1Q96S66 551 aa4.52□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 GINS4Q9BRT9 223 aa4.52□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 OR2D2Q9H210 308 aa4.52□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 DCSTAMPQ9H295 470 aa4.52□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 RAB26Q9ULW5 256 aa4.52□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa4.52□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 A4D1N5 150 aa4.51□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 ANKRD65E5RJM6 399 aa4.51□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 H0Y980 276 aa4.51□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 BET1O15155 118 aa4.51□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 IGHV3-11P01762 117 aa4.51□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 HLA-DQB1P01920 261 aa4.51□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 GSTT2P0CG29 244 aa4.51□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 GSTT2BP0CG30 244 aa4.51□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 SPNP16150 400 aa4.51□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 MAP2K4P45985 399 aa4.51□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 RIGQ13278 110 aa4.51□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 ARFRP1Q13795 201 aa4.51□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 PRSS8Q16651 343 aa4.51□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 UBE2UQ5VVX9 321 aa4.51□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 IZUMO2Q6UXV1 221 aa4.51□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa4.51□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 SLC25A42Q86VD7 318 aa4.51□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 SBSPONQ8IVN8 264 aa4.51□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 OR9G4Q8NGQ1 327 aa4.51□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 OR2K2Q8NGT1 345 aa4.51□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 OR6F1Q8NGZ6 308 aa4.51□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 GRPEL2Q8TAA5 225 aa4.51□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 VSTM2AQ8TAG5 236 aa4.51□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 FCGR1BQ92637 280 aa4.51□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 RCHY1Q96PM5 261 aa4.51□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 SPIN2AQ99865 258 aa4.51□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa4.51□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 RPS10P5Q9NQ39 176 aa4.51□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa4.51□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa4.51□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP4.51□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 DNAH9Q9NYC9 4486 aa4.5□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 STAB2Q8WWQ8 2551 aa4.5□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa4.5□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 FAM223BA6NKX1 122 aa4.5□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 K7EQG2 157 aa4.5□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 AIREO43918 545 aa4.5□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 OR2A4O95047 310 aa4.5□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 OR9G9P0C7N8 305 aa4.5□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 CD36P16671 472 aa4.5□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 OR10A3P58181 314 aa4.5□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 PJVKQ0ZLH3 352 aa4.5□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 CDK10Q15131 360 aa4.5□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 MSMO1Q15800 293 aa4.5□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 CDNFQ49AH0 187 aa4.5□□□□□ -1.69
PDE4D-225ENST00000515835 HIGD2BQ4VC39 106 aa4.5□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms