RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508338.1

SH3BP2-212, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 491 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-212ENST00000508338 BSXQ3C1V8 233 aa20.65■□□□□ 0.9
SH3BP2-212ENST00000508338 PVRIGQ6DKI7 326 aa20.65■□□□□ 0.9
SH3BP2-212ENST00000508338 OR52B4Q8NGK2 314 aa20.65■□□□□ 0.9
SH3BP2-212ENST00000508338 MISP3Q96FF7 219 aa20.65■□□□□ 0.9
SH3BP2-212ENST00000508338 U3KQ87 197 aa20.65■□□□□ 0.9
SH3BP2-212ENST00000508338 OVOL1O14753 267 aa20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-212ENST00000508338 GGCTO75223 188 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-212ENST00000508338 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-212ENST00000508338 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-212ENST00000508338 ZNF502Q8TBZ5 544 aa20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-212ENST00000508338 DTD1Q8TEA8 209 aa20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-212ENST00000508338 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-212ENST00000508338 MARVELD1Q9BSK0 173 aa20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-212ENST00000508338 C21orf62Q9NYP8 219 aa20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-212ENST00000508338 CMYA5Q8N3K9 4069 aa20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-212ENST00000508338 NOTCH3Q9UM47 2321 aa20.64■□□□□ 0.89
SH3BP2-212ENST00000508338 MFSD2BA6NFX1 497 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BP2-212ENST00000508338 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BP2-212ENST00000508338 ADAP1O75689 374 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BP2-212ENST00000508338 PTTG1O95997 202 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BP2-212ENST00000508338 SLURP1P55000 103 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BP2-212ENST00000508338 C2orf83Q53S99 150 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC24A4Q8NFF2 622 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BP2-212ENST00000508338 DCUN1D4Q92564 292 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BP2-212ENST00000508338 CCDC140Q96MF4 163 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BP2-212ENST00000508338 TXN2Q99757 166 aa20.63■□□□□ 0.89
SH3BP2-212ENST00000508338 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
SH3BP2-212ENST00000508338 K7EIM0 57 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP2-212ENST00000508338 ARL3P36405 182 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP2-212ENST00000508338 INSL3P51460 131 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP2-212ENST00000508338 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
SH3BP2-212ENST00000508338 C9orf66Q5T8R8 295 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP2-212ENST00000508338 SAMD5Q5TGI4 173 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP2-212ENST00000508338 SPSB3Q6PJ21 355 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP2-212ENST00000508338 CLEC19AQ6UXS0 136 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP2-212ENST00000508338 SCARB1Q8WTV0 552 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP2-212ENST00000508338 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
SH3BP2-212ENST00000508338 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
SH3BP2-212ENST00000508338 SEC22CQ9BRL7 303 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP2-212ENST00000508338 RBKSQ9H477 322 aa20.62■□□□□ 0.89
SH3BP2-212ENST00000508338 SNRPGP15A8MWD9 76 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BP2-212ENST00000508338 CLEC3BP05452 202 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BP2-212ENST00000508338 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
SH3BP2-212ENST00000508338 RPP30P78346 268 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
SH3BP2-212ENST00000508338 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
SH3BP2-212ENST00000508338 ELOVL1Q9BW60 279 aa20.61■□□□□ 0.89
SH3BP2-212ENST00000508338 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa20.6■□□□□ 0.89
SH3BP2-212ENST00000508338 I3L2K1 104 aa20.6■□□□□ 0.89
SH3BP2-212ENST00000508338 BMPR1BO00238 502 aa20.6■□□□□ 0.89
SH3BP2-212ENST00000508338 NXPH3O95157 252 aa20.6■□□□□ 0.89
SH3BP2-212ENST00000508338 TRBV12-3P01733 135 aa20.6■□□□□ 0.89
SH3BP2-212ENST00000508338 IGLL1P15814 213 aa20.6■□□□□ 0.89
SH3BP2-212ENST00000508338 NPY1RP25929 384 aa20.6■□□□□ 0.89
SH3BP2-212ENST00000508338 MFAP4P55083 255 aa20.6■□□□□ 0.89
SH3BP2-212ENST00000508338 C1QL4Q86Z23 238 aa20.6■□□□□ 0.89
SH3BP2-212ENST00000508338 SEC14L6B5MCN3 397 aa20.59■□□□□ 0.89
SH3BP2-212ENST00000508338 SYNGR2O43760 224 aa20.59■□□□□ 0.89
SH3BP2-212ENST00000508338 MT-CO2P00403 227 aa20.59■□□□□ 0.89
SH3BP2-212ENST00000508338 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
SH3BP2-212ENST00000508338 GPHB5Q86YW7 130 aa20.59■□□□□ 0.89
SH3BP2-212ENST00000508338 UXS1Q8NBZ7 420 aa20.59■□□□□ 0.89
SH3BP2-212ENST00000508338 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
SH3BP2-212ENST00000508338 PEMTQ9UBM1 199 aa20.59■□□□□ 0.89
SH3BP2-212ENST00000508338 WIPF1O43516 503 aa20.58■□□□□ 0.89
SH3BP2-212ENST00000508338 SCGB2A1O75556 95 aa20.58■□□□□ 0.89
SH3BP2-212ENST00000508338 IFNA10P01566 189 aa20.58■□□□□ 0.89
SH3BP2-212ENST00000508338 IGHV3-23P01764 117 aa20.58■□□□□ 0.89
SH3BP2-212ENST00000508338 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
SH3BP2-212ENST00000508338 ID3Q02535 119 aa20.58■□□□□ 0.89
SH3BP2-212ENST00000508338 FAM106AQ4KMX7 169 aa20.58■□□□□ 0.89
SH3BP2-212ENST00000508338 ETFRF1Q6IPR1 90 aa20.58■□□□□ 0.89
SH3BP2-212ENST00000508338 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2-212ENST00000508338 PPP5D1E7EU14 171 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2-212ENST00000508338 WRBO00258 174 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2-212ENST00000508338 TGOLN2O43493 480 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2-212ENST00000508338 GPR183P32249 361 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2-212ENST00000508338 NPBWR1P48145 328 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2-212ENST00000508338 Q56UQ5 140 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2-212ENST00000508338 OR4D5Q8NGN0 318 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2-212ENST00000508338 S4R3C0 116 aa20.57■□□□□ 0.88
SH3BP2-212ENST00000508338 OPRK1P41145 380 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-212ENST00000508338 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-212ENST00000508338 OXLD1Q5BKU9 147 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-212ENST00000508338 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-212ENST00000508338 ACSM6Q6P461 480 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-212ENST00000508338 OR9G4Q8NGQ1 327 aa20.56■□□□□ 0.88
SH3BP2-212ENST00000508338 MPTX1A8MV57 137 aa20.55■□□□□ 0.88
SH3BP2-212ENST00000508338 G3V4G9 280 aa20.55■□□□□ 0.88
SH3BP2-212ENST00000508338 LGALS9O00182 355 aa20.55■□□□□ 0.88
SH3BP2-212ENST00000508338 SLC25A4P12235 298 aa20.55■□□□□ 0.88
SH3BP2-212ENST00000508338 SYNJ2BPP57105 145 aa20.55■□□□□ 0.88
SH3BP2-212ENST00000508338 RAB11AP62491 216 aa20.55■□□□□ 0.88
SH3BP2-212ENST00000508338 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
SH3BP2-212ENST00000508338 OR4C12Q96R67 309 aa20.55■□□□□ 0.88
SH3BP2-212ENST00000508338 C5orf51A6NDU8 294 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP2-212ENST00000508338 OR2T8A6NH00 312 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP2-212ENST00000508338 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
SH3BP2-212ENST00000508338 RELQ04864 619 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
SH3BP2-212ENST00000508338 GSG1LQ6UXU4 331 aa20.54■□□□□ 0.88
SH3BP2-212ENST00000508338 REC114Q7Z4M0 266 aa20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.3 ms