RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503638.1

PGGT1B-204, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 579 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-204ENST00000503638 IFNA10P01566 189 aa10.38□□□□□ -0.75
PGGT1B-204ENST00000503638 IAPPP10997 89 aa10.38□□□□□ -0.75
PGGT1B-204ENST00000503638 SLC25A6P12236 298 aa10.38□□□□□ -0.75
PGGT1B-204ENST00000503638 UBAC2Q8NBM4 344 aa10.38□□□□□ -0.75
PGGT1B-204ENST00000503638 OR11H1Q8NG94 326 aa10.38□□□□□ -0.75
PGGT1B-204ENST00000503638 OR1P1Q8NH06 330 aa10.38□□□□□ -0.75
PGGT1B-204ENST00000503638 RAX2Q96IS3 184 aa10.38□□□□□ -0.75
PGGT1B-204ENST00000503638 CXorf58Q96LI9 332 aa10.38□□□□□ -0.75
PGGT1B-204ENST00000503638 HSPB7Q9UBY9 170 aa10.38□□□□□ -0.75
PGGT1B-204ENST00000503638 CMYA5Q8N3K9 4069 aa10.37□□□□□ -0.75
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PGGT1B-204ENST00000503638 FAM90A26D6RGX4 464 aa10.36□□□□□ -0.75
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PGGT1B-204ENST00000503638 L7N2F9 121 aa10.34□□□□□ -0.75
PGGT1B-204ENST00000503638 SIX6O95475 246 aa10.34□□□□□ -0.75
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PGGT1B-204ENST00000503638 FAM209BQ5JX69 171 aa10.34□□□□□ -0.75
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PGGT1B-204ENST00000503638 C2orf50Q96LR7 162 aa10.34□□□□□ -0.75
PGGT1B-204ENST00000503638 MGAT4CQ9UBM8 478 aa10.34□□□□□ -0.75
PGGT1B-204ENST00000503638 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
PGGT1B-204ENST00000503638 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP10.34□□□□□ -0.75
PGGT1B-204ENST00000503638 WNK1Q9H4A3 2382 aa10.33□□□□□ -0.76
PGGT1B-204ENST00000503638 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
PGGT1B-204ENST00000503638 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa10.33□□□□□ -0.76
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PGGT1B-204ENST00000503638 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
PGGT1B-204ENST00000503638 RAB11AP62491 216 aa10.33□□□□□ -0.76
PGGT1B-204ENST00000503638 SPANXN5Q5MJ07 72 aa10.33□□□□□ -0.76
PGGT1B-204ENST00000503638 OR4D5Q8NGN0 318 aa10.33□□□□□ -0.76
PGGT1B-204ENST00000503638 SCARB1Q8WTV0 552 aa10.33□□□□□ -0.76
PGGT1B-204ENST00000503638 U3KQ87 197 aa10.33□□□□□ -0.76
PGGT1B-204ENST00000503638 VWFP04275 2813 aa10.33□□□□□ -0.76
PGGT1B-204ENST00000503638 K7EIM0 57 aa10.32□□□□□ -0.76
PGGT1B-204ENST00000503638 GNG7O60262 68 aa10.32□□□□□ -0.76
PGGT1B-204ENST00000503638 CLEC3BP05452 202 aa10.32□□□□□ -0.76
PGGT1B-204ENST00000503638 BCAP31P51572 246 aa10.32□□□□□ -0.76
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