RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487305.5

TMEM39B-208, Transcript of transmembrane protein 39B, human

TSL 2

Gene TMEM39B, Length 2,087 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM39B-208	ENST00000487305	GAGE1	Q13065	139 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMEM39B-208	ENST00000487305	ZNF124	Q15973	351 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMEM39B-208	ENST00000487305	ZNF474	Q6S9Z5	364 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
TMEM39B-208	ENST00000487305	LINC00311	Q8N616	119 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMEM39B-208	ENST00000487305	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMEM39B-208	ENST00000487305	ZNF596	Q8TC21	504 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMEM39B-208	ENST00000487305	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
TMEM39B-208	ENST00000487305	GGTLC3	B5MD39	225 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMEM39B-208	ENST00000487305	EREG	O14944	169 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMEM39B-208	ENST00000487305	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
TMEM39B-208	ENST00000487305	HNF1A	P20823	631 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMEM39B-208	ENST00000487305	LINC00310	P59036	64 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMEM39B-208	ENST00000487305	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMEM39B-208	ENST00000487305	ST6GALNAC3	Q8NDV1	305 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMEM39B-208	ENST00000487305	TMEM186	Q96B77	213 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMEM39B-208	ENST00000487305	FLYWCH2	Q96CP2	140 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
TMEM39B-208	ENST00000487305	ZNF503	Q96F45	646 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMEM39B-208	ENST00000487305	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
TMEM39B-208	ENST00000487305	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
TMEM39B-208	ENST00000487305	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMEM39B-208	ENST00000487305	IGKV1OR2-108	A0A075B7D4	117 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TMEM39B-208	ENST00000487305	PSMB11	A5LHX3	300 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TMEM39B-208	ENST00000487305	ZNF253	O75346	499 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TMEM39B-208	ENST00000487305	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
TMEM39B-208	ENST00000487305	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
TMEM39B-208	ENST00000487305	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
TMEM39B-208	ENST00000487305	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TMEM39B-208	ENST00000487305	THAP8	Q8NA92	274 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TMEM39B-208	ENST00000487305	LEAP2	Q969E1	77 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TMEM39B-208	ENST00000487305	HARBI1	Q96MB7	349 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TMEM39B-208	ENST00000487305	GNB4	Q9HAV0	340 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TMEM39B-208	ENST00000487305	VSTM5	A8MXK1	200 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TMEM39B-208	ENST00000487305	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
TMEM39B-208	ENST00000487305	COX7A2P2	O60397	106 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TMEM39B-208	ENST00000487305	IGHV3-7	P01780	117 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TMEM39B-208	ENST00000487305	CEACAM8	P31997	349 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
TMEM39B-208	ENST00000487305	MC5R	P33032	325 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TMEM39B-208	ENST00000487305	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
TMEM39B-208	ENST00000487305	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TMEM39B-208	ENST00000487305	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TMEM39B-208	ENST00000487305	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TMEM39B-208	ENST00000487305	FRYL	O94915	3013 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TMEM39B-208	ENST00000487305	GPR179	Q6PRD1	2367 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TMEM39B-208	ENST00000487305	DSCAM	O60469	2012 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TMEM39B-208	ENST00000487305	TCRBV4S1A1T	A0A5B7	111 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TMEM39B-208	ENST00000487305	C20orf202	A1L168	122 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TMEM39B-208	ENST00000487305		H0YJW9	148 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TMEM39B-208	ENST00000487305	IGLV2-8	P01709	118 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TMEM39B-208	ENST00000487305	APCS	P02743	223 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TMEM39B-208	ENST00000487305	IGKV1-16	P04430	117 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TMEM39B-208	ENST00000487305	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
TMEM39B-208	ENST00000487305	CD40	P25942	277 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TMEM39B-208	ENST00000487305	GNG10	P50151	68 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TMEM39B-208	ENST00000487305	OR5I1	Q13606	314 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TMEM39B-208	ENST00000487305	DMRTA1	Q5VZB9	504 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TMEM39B-208	ENST00000487305	C10orf113	Q5VZT2	155 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TMEM39B-208	ENST00000487305	TMEM108	Q6UXF1	575 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TMEM39B-208	ENST00000487305	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
TMEM39B-208	ENST00000487305	CCL13	Q99616	98 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TMEM39B-208	ENST00000487305	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
TMEM39B-208	ENST00000487305	SOX21	Q9Y651	276 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
TMEM39B-208	ENST00000487305	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
TMEM39B-208	ENST00000487305	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	10.07	□□□□□ -0.8
TMEM39B-208	ENST00000487305	LGALS7	P47929	136 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TMEM39B-208	ENST00000487305	ZNF137P	P52743	207 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TMEM39B-208	ENST00000487305	PMCHL1	Q16048	86 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TMEM39B-208	ENST00000487305	DOLPP1	Q86YN1	238 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TMEM39B-208	ENST00000487305	C22orf15	Q8WYQ4	148 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TMEM39B-208	ENST00000487305	PAXX	Q9BUH6	204 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TMEM39B-208	ENST00000487305	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TMEM39B-208	ENST00000487305	URB1	O60287	2271 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
TMEM39B-208	ENST00000487305		A0A1B0GUS0	222 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TMEM39B-208	ENST00000487305	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TMEM39B-208	ENST00000487305	SELL	P14151	372 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TMEM39B-208	ENST00000487305	CA7	P43166	264 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TMEM39B-208	ENST00000487305	AMT	P48728	403 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TMEM39B-208	ENST00000487305	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
TMEM39B-208	ENST00000487305	PRRX1	P54821	245 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TMEM39B-208	ENST00000487305	PAX2	Q02962	417 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TMEM39B-208	ENST00000487305	DEFB109B	Q30KR1	87 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TMEM39B-208	ENST00000487305	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TMEM39B-208	ENST00000487305	VHLL	Q6RSH7	139 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TMEM39B-208	ENST00000487305	OR10X1	Q8NGY0	326 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TMEM39B-208	ENST00000487305	OR9G1	Q8NH87	305 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TMEM39B-208	ENST00000487305	VN1R17P	Q8TDU5	208 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TMEM39B-208	ENST00000487305	MBD6	Q96DN6	1003 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TMEM39B-208	ENST00000487305	WFIKKN1	Q96NZ8	548 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TMEM39B-208	ENST00000487305	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
TMEM39B-208	ENST00000487305	FAM215A	Q9Y5M1	114 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TMEM39B-208	ENST00000487305	DIRC3	C9JPN6	131 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TMEM39B-208	ENST00000487305	CORT	O00230	105 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TMEM39B-208	ENST00000487305	MGST1	P10620	155 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
TMEM39B-208	ENST00000487305	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
TMEM39B-208	ENST00000487305	SPRN	Q5BIV9	151 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TMEM39B-208	ENST00000487305	CT83	Q5H943	113 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TMEM39B-208	ENST00000487305		Q6ZS92	163 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TMEM39B-208	ENST00000487305	FAM216B	Q8N7L0	139 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TMEM39B-208	ENST00000487305	BORCS7	Q96B45	105 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TMEM39B-208	ENST00000487305	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TMEM39B-208	ENST00000487305	NRN1	Q9NPD7	142 aa		10.06	□□□□□ -0.8

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