RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486539.1

CACNA2D1-211, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1, humanhuman

TSL 5

Gene CACNA2D1, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1-211ENST00000486539 CRYGAP11844 174 aa-0.68□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP-0.68□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 CD151P48509 253 aa-0.68□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP-0.68□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP-0.68□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 RAB4BP61018 213 aa-0.68□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 DEFA5Q01523 94 aa-0.68□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 MPV17LQ2QL34 196 aa-0.68□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa-0.68□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF550Q7Z398 422 aa-0.68□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 KIF27Q86VH2 1401 aa-0.68□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR4A15Q8NGL6 344 aa-0.68□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMEM239Q8WW34 195 aa-0.68□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 RORBQ92753 470 aa-0.68□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 ITFG2Q969R8 447 aa-0.68□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 TLCD1Q96CP7 247 aa-0.68□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 IFT46Q9NQC8 304 aa-0.68□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 CLEC2DQ9UHP7 191 aa-0.68□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 C21orf140B9A014 251 aa-0.69□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 F5H5K5 113 aa-0.69□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 LYNX1G3V0Z9 82 aa-0.69□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 GOLGA8RI6L899 631 aa-0.69□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 C1QAP02745 245 aa-0.69□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 MIFP14174 115 aa-0.69□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 GRPRP30550 384 aa-0.69□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 DEKP35659 375 aaKnown RBP-0.69□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 H2BFSP57053 126 aa-0.69□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMEM33P57088 247 aa-0.69□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 PSG9Q00887 426 aa-0.69□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 STK38Q15208 465 aa-0.69□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 CDRT4Q8N9R6 151 aa-0.69□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR4D11Q8NGI4 311 aa-0.69□□□□□ -2.52
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CACNA2D1-211ENST00000486539 ACOT12Q8WYK0 555 aa-0.69□□□□□ -2.52
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CACNA2D1-211ENST00000486539 SPACA1Q9HBV2 294 aa-0.69□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 NAT8Q9UHE5 227 aa-0.69□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 TIMM22Q9Y584 194 aa-0.69□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 SHANK2Q9UPX8 1470 aa-0.69□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF831Q5JPB2 1677 aa-0.69□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 TIAM2Q8IVF5 1701 aa-0.69□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 PTPN23Q9H3S7 1636 aa-0.7□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa-0.7□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLC22A1O15245 554 aa-0.7□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 FADS1O60427 444 aa-0.7□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 IGLV3-1P01715 115 aa-0.7□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 MBP02144 154 aa-0.7□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 ATP5G1P05496 136 aa-0.7□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 LIMS3P0CW19 117 aa-0.7□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 LIMS4P0CW20 117 aa-0.7□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 NQO2P16083 231 aa-0.7□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 FABP5Q01469 135 aa-0.7□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 LRRC26Q2I0M4 334 aa-0.7□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR10J3Q5JRS4 329 aa-0.7□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa-0.7□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 C3orf56Q8N813 242 aa-0.7□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 MT1LQ93083 61 aa-0.7□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR8D2Q9GZM6 311 aa-0.7□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP-0.7□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 PSME2Q9UL46 239 aa-0.7□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa-0.7□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 TOPBP1Q92547 1522 aa-0.7□□□□□ -2.52
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CACNA2D1-211ENST00000486539 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP-0.7□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 ADCY9O60503 1353 aa-0.7□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 TSC2P49815 1807 aa-0.71□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 C1orf167Q5SNV9 1468 aa-0.71□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa-0.71□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP-0.71□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 LEPROTO15243 131 aa-0.71□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 ARL6IP5O75915 188 aa-0.71□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR5F1O95221 314 aa-0.71□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 APOMO95445 188 aa-0.71□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 NSA2O95478 260 aaKnown RBP-0.71□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 SULT1A3P0DMM9 295 aa-0.71□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 SULT1A4P0DMN0 295 aa-0.71□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP-0.71□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 CFL1P23528 166 aaKnown RBP-0.71□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLCO1A2P46721 670 aa-0.71□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 EBPQ15125 230 aaKnown RBP-0.71□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 LPCAT4Q643R3 524 aa-0.71□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa-0.71□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 DEFB128Q7Z7B8 93 aa-0.71□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 GKN2Q86XP6 184 aa-0.71□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP-0.71□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 LINC00311Q8N616 119 aa-0.71□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 PACRGLQ8N7B6 248 aa-0.71□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR7G1Q8NGA0 311 aa-0.71□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 OR52E4Q8NGH9 312 aa-0.71□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 IFT81Q8WYA0 676 aa-0.71□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 C11orf40Q8WZ69 217 aa-0.71□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 CMTM5Q96DZ9 223 aa-0.71□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 FAM210AQ96ND0 272 aa-0.71□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 CCL13Q99616 98 aa-0.71□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP-0.71□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 CD300AQ9UGN4 299 aa-0.71□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP-0.71□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP-0.71□□□□□ -2.52
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa-0.71□□□□□ -2.52
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