RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486235.5

TMEM39A-209, Transcript of transmembrane protein 39A, human

TSL 3

Gene TMEM39A, Length 885 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM39A-209	ENST00000486235	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235		A0A0B4J203	849 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	C9orf170	A2RU37	121 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235		G3V318	75 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	TGOLN2	O43493	480 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	SIX6	O95475	246 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	CSN2	P05814	226 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	CGB3	P0DN86	165 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	CGB7	P0DN87	165 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	SSTR5	P35346	364 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	KIR3DL2	P43630	455 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	AKR1D1	P51857	326 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	TAS2R46	P59540	309 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	SST	P61278	116 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	SMCO1	Q147U7	214 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	RHEB	Q15382	184 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	ANXA2R	Q3ZCQ2	193 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	SERPINA12	Q8IW75	414 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	ZNF565	Q8N9K5	539 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	UBALD1	Q8TB05	177 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	NUDCD2	Q8WVJ2	157 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	PP6455	Q8WZ26	134 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	FGGY	Q96C11	551 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	OR51M1	Q9H341	326 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	KCNK15	Q9H427	330 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	VSIG4	Q9Y279	399 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	TNC	P24821	2201 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	TRAV24	A0A0B4J272	114 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235		A0A1B0GW64	132 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235		A0A1W2PPK0	400 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	FAM74A7	A6NL05	159 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	MOS	P00540	346 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	MAS1	P04201	325 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	ZNF735	P0CB33	412 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	OR5H8	P0DN80	308 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	IGHV3-43D	P0DP04	118 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	KIAA0141	Q14154	515 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	FAM74A3	Q4VXF1	159 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	SGPP2	Q8IWX5	399 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	LINC00469	Q8N7U9	141 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	CHST4	Q8NCG5	386 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	OR1S2	Q8NGQ3	325 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	OR10AC1	Q8NH08	325 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	CASTOR1	Q8WTX7	329 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	PCNP	Q8WW12	178 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	SPSB1	Q96BD6	273 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	C10orf35	Q96D05	121 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	UBE2E2	Q96LR5	201 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	S100A13	Q99584	98 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	PBDC1	Q9BVG4	233 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	TREM1	Q9NP99	234 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	HERC2	O95714	4834 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	IGHV4OR15-8	A0A075B7B6	117 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235		A0A087WW49	117 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	C5orf52	A6NGY3	159 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	ZNF705E	A8MWA4	302 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	LINC01619	G3V211	115 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	ATP6V0E1	O15342	81 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	SLC25A17	O43808	307 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	IFNA17	P01571	189 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	IGF1	P05019	195 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	CD5	P06127	495 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	NPS	P0C0P6	89 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	IL3RA	P26951	378 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	CD1B	P29016	333 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	MAS1L	P35410	378 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	SOX2	P48431	317 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	SULT1A2	P50226	295 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	RAB9A	P51151	201 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	CLDN12	P56749	244 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	RUNX1	Q01196	453 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	OR10K2	Q6IF99	312 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	ATRAID	Q6UW56	229 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	HOGA1	Q86XE5	327 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	FAM71E2	Q8N5Q1	922 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	TMEM104	Q8NE00	496 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TMEM39A-209	ENST00000486235	OR5D14	Q8NGL3	314 aa		4.93	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms