RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485556.5

STRC-211, Transcript of stereocilin, humanhuman

TSL 5

Gene STRC, Length 4,253 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRC-211ENST00000485556 C7orf69Q9H7B7 122 aa8.26□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 TRAV34A0A0B4J273 112 aa8.26□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 TNFSF13O75888 250 aa8.26□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 TMEM177Q53S58 311 aa8.26□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 CENPWQ5EE01 88 aa8.26□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 IGFL3Q6UXB1 125 aa8.26□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa8.26□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 NBEAP1P0C6P0 100 aa8.26□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 FGF16O43320 207 aa8.25□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 RPL29P47914 159 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 MIR17HGQ75NE6 70 aa8.25□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 CLDND2Q8NHS1 167 aa8.25□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 RNF138Q8WVD3 245 aa8.25□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa8.25□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 CXorf65A6NEN9 183 aa8.25□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 TIMM23O14925 209 aa8.25□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 CCKARP32238 428 aa8.25□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 CCL20P78556 96 aa8.25□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 TMEM200BQ69YZ2 307 aa8.25□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 ARPC1AQ92747 370 aa8.25□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 CYTL1Q9NRR1 136 aa8.25□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 C21orf62Q9NYP8 219 aa8.25□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 FBXL7Q9UJT9 491 aa8.25□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa8.25□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 LINC00473A8K010 186 aa8.25□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 NBR2O15453 112 aa8.25□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 SMIM6P0DI80 62 aa8.25□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 CA7P43166 264 aa8.25□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 ATP5G2Q06055 141 aa8.25□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 FAM169BQ8N8A8 192 aa8.25□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 ZNF738Q8NE65 137 aa8.25□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 OR10W1Q8NGF6 305 aa8.25□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 WNT10AQ9GZT5 417 aa8.25□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 CRIM1Q9NZV1 1036 aa8.25□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 WDR83OSQ9Y284 106 aa8.25□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 A6NJY4 79 aa8.24□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 TGFAP01135 160 aa8.24□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 TRGV3P03979 118 aa8.24□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 GNLYP22749 145 aa8.24□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 PRCDQ00LT1 54 aa8.24□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 ICAM4Q14773 271 aa8.24□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 TMEM183BQ1AE95 376 aa8.24□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 SPANXN1Q5VSR9 72 aa8.24□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 Q6ZS49 121 aa8.24□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 NUP37Q8NFH4 326 aa8.24□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 COL4A3Q01955 1670 aa8.24□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 A0A0G2JRQ6 117 aa8.24□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 SCO2A0A1W2PP80 73 aa8.24□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 A0A1W2PS18 150 aa8.24□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 TMEM189A5PLL7 270 aa8.24□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 MT-ND6P03923 174 aa8.24□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 NBL1P41271 181 aa8.24□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 GCSAMLQ5JQS6 135 aa8.24□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 Q6ZR03 302 aa8.24□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa8.24□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 OR2T8A6NH00 312 aa8.24□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 ZNF98A6NK75 572 aa8.24□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 NPPCP23582 126 aa8.24□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 GPR183P32249 361 aa8.24□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 KIAA1644Q3SXP7 199 aa8.24□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 SFRP2Q96HF1 295 aa8.24□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 GAFA1Q96PS6 74 aa8.24□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 CEP350Q5VT06 3117 aa8.24□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 PRSS1P07477 247 aa8.23□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 CD81P60033 236 aa8.23□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 ELOBQ15370 118 aa8.23□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 TM4SF20Q53R12 229 aa8.23□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 ANKRD39Q53RE8 183 aa8.23□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa8.23□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 RFNGQ9Y644 331 aa8.23□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 AUP1Q9Y679 476 aa8.23□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 AMY1AP04745 511 aa8.23□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 IGHV1-8P0DP01 117 aa8.23□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 ID1P41134 155 aa8.23□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 CD69Q07108 199 aa8.23□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 Q6ZRM9 215 aa8.23□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 PRO3102Q9H379 93 aa8.23□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 VSIRQ9H7M9 311 aa8.23□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 FAM215AQ9Y5M1 114 aa8.23□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 PTPN13Q12923 2485 aa8.23□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 TRAV3A0A0B4J244 114 aa8.23□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 E7EQL1 145 aa8.23□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 WDR86Q86TI4 376 aa8.23□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa8.23□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 OR52E5Q8NH55 327 aa8.23□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 SLC25A33Q9BSK2 321 aa8.23□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 GPR61Q9BZJ8 451 aa8.23□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
STRC-211ENST00000485556 PCNTO95613 3336 aa8.23□□□□□ -1.09
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